Анализът на хромозомни микрочипове може да помогне за идентифициране на причината за SIDS или SUDC при по-големи деца

Анализът на хромозомни микрочипове може да помогне за идентифициране на причината за SIDS или SUDC при по-големи деца

Генетичен тест, известен като анализ на хромозомни микрочипове (CMA), може да помогне за идентифициране на причината за синдрома на внезапна детска смърт (SIDS) или неговия аналог при по-големи деца, известен като внезапна необяснима смърт в детството (SUDC), открива проучване, ръководено от Бостънската детска болница.

Изследователите, ръководени от Richard Goldstein, MD, Ingrid Holm, MD, MPH, и Catherine Brownstein, MPH, PhD, призовават CMA да стане рутинна при оценката на SIDS и SUDC. Те публикуваха резултатите от проучването си онлайн на 7 ноември в списание Advanced Genetics.

„Вярваме, че разполагаме с достатъчно информация, за да кажем, че CMA си струва да се обмисли, когато дете е починало без обяснение и си струва да се проучи допълнително, за да се разберат по-добре тези смъртни случаи“, казва Голдщайн, който ръководи Програмата за внезапна неочаквана смърт на Робърт в педиатрията в Boston Children's и е старши автор на изследването.

Екипът използва CMA, за да тества проби от 116 починали бебета и малки деца на възраст до 28 месеца, чиято смърт е класифицирана като SIDS или SUDC. При 14 деца (12 процента) CMA идентифицира делеции или дублирания на сегменти от ДНК на детето или малки пренареждания на ДНК, които са патогенни или „благоприятно патогенни“.

CMA вече се използва рутинно за деца със състояния като аутизъм, изоставане в развитието и множество вродени аномалии, както и деца с недиагностицирани медицински състояния.

Ингрид Холм, съавтор на изследването

За по-нататъшно потвърждаване на своите констатации изследователите сравняват резултатите от CMA при пациенти със SIDS/SUDC с тези в контролни групи деца от общността и две кохорти деца с разстройство от аутистичния спектър. При оценка на вероятността от потенциално въздействащи хромозомни промени в CMA, групата от SIDS/SUDC отбеляза значително по-висок резултат от контролната група, но имаше сходни резултати с тези на децата с разстройство от аутистичния спектър (ASD).

Много от констатациите на CMA нямат очевидна връзка със SIDS/SUDC и изискват допълнително изследване. Например две деца са имали недиагностициран синдром на Клайнфелтер, при който момчетата се раждат с допълнителна Х хромозома, но обикновено имат нормална продължителност на живота. Няколко идентифицирани хромозомни делеции/дупликации също са свързани със състояния на неврологичното развитие, включително припадъци, ASD, забавяне на развитието и шизофрения.

Добавяне към тестовия арсенал

Електронна книга по генетика и геномика

Компилация от най-добрите интервюта, статии и новини от последната година. Изтеглете безплатно копие

В предишна работа изследователи от Boston Children's използваха секвениране на целия екзом (секвениране на 1 до 2 процента от генома, който кодира протеини), за да оценят деца, чиято смърт е класифицирана като SIDS или SUDC. В това проучване 11 процента от децата са имали генетични варианти (промени), които вероятно са изиграли роля в смъртта им. Остава да се види до каква степен CMA ще допринесе за тези резултати и колко припокриване има между гените, за които е установено, че са променени чрез секвениране на екзома, и гените, засегнати от делеции/дупликации на ДНК.

Екипът се надява, че техните открития ще насърчат медицинските следователи, разследващи смъртните случаи от SIDS, да ги помолят за помощ.

„Медицинските изследователи се интересуват от генетични тестове, но им липсват ресурси, особено когато става въпрос за тълкуване на резултатите“, казва Голдщайн. „Опитваме се да придвижим тази топка напред и да предоставим полезна информация.“

В допълнение към секвенирането на екзоми и хромозомните аномалии в CMA, изследователите наскоро получиха грант от Американския институт за SIDS за изследване на по-сложни структурни промени в хромозомите, които могат да допринесат за SIDS и SUDC, използвайки усъвършенствана геномна платформа, наречена Bionano Saphyr, за изобразяване на изключително дълги ДНК вериги.

„Тази техника ни дава възможността да намираме структурни вариации, които са твърде големи, за да бъдат открити чрез традиционно секвениране на ДНК, но твърде малки, за да бъдат открити с хромозомни микрочипове“, казва Браунщайн, водещ автор на изследването и научен директор на Manton Center for Orphan Disease Research Gene Discovery Core в Boston Children’s. „Можем също да открием случаи, при които ДНК сегмент „се обръща“ на друго място в хромозомата.

В дългосрочен план, тъй като разходите за секвениране на ДНК намаляват, изследователите искат да използват секвениране на целия геном за изследване на SIDS и SUDC, единичен тест, който може да намали необходимостта от CMA.

източник:

Бостънска детска болница

Справка:

Brownstein, CA, et al. (2022) Вариации в броя на копията и структурни геномни находки в 116 случая на внезапна необяснима смърт между 1 и 28 месеца. Разширена генетика. doi.org/10.1002/ggn2.202200012.

.