Analiza mikronizova kromosoma mogla bi pomoći u prepoznavanju uzroka SIDS-a ili SUDC-a kod starije djece

Analiza mikronizova kromosoma mogla bi pomoći u prepoznavanju uzroka SIDS-a ili SUDC-a kod starije djece

Genetski test poznat kao analiza kromosomskih mikronizova (CMA) mogao bi pomoći u identificiranju uzroka sindroma iznenadne smrti dojenčadi (SIDS) ili njegovog dvojnika kod starije djece, poznatog kao iznenadna neobjašnjiva smrt u djetinjstvu (SUDC), otkriva studija koju je vodila Bostonska dječja bolnica.

Istraživači, predvođeni Richardom Goldsteinom, MD, Ingrid Holm, MD, MPH, i Catherine Brownstein, MPH, PhD, pozivaju da CMA postane rutina u evaluaciji SIDS-a i SUDC-a. Objavili su rezultate svoje studije online 7. studenog u časopisu Advanced Genetics.

“Vjerujemo da imamo dovoljno informacija da kažemo da je CMA vrijedan razmatranja kada je dijete umrlo bez objašnjenja i da je vrijedan daljnje istrage kako bismo bolje razumjeli te smrti,” kaže Goldstein, koji vodi Robertov Program Sudden Unexpected Death in Pediatrics Program na Bostonskoj dječjoj klinici i bio je viši autor studije.

Tim je koristio CMA za testiranje uzoraka 116 umrle dojenčadi i male djece do 28 mjeseci starosti čija je smrt klasificirana kao SIDS ili SUDC. U 14 djece (12 posto) CMA je identificirao brisanja ili duplikacije segmenata djetetove DNK ili male DNK preraspodjele koje su bile patogene ili "povoljno patogene".

CMA se već rutinski koristi za djecu sa stanjima kao što su autizam, kašnjenje u razvoju i višestruke kongenitalne anomalije, kao i za djecu s nedijagnosticiranim medicinskim stanjima.”

Ingrid Holm, suautorica studije

Kako bi dodatno potvrdili svoje nalaze, istraživači su usporedili rezultate CMA-a kod pacijenata sa SIDS-om/SUDC-om s onima u kontrolnim skupinama djece iz zajednice i dvjema kohortama djece s poremećajem iz spektra autizma. Pri procjeni vjerojatnosti potencijalno utjecajnih kromosomskih promjena u CMA, skupina SIDS/SUDC postigla je znatno više rezultate od kontrolne skupine, ali je imala slične rezultate kao djeca s poremećajem iz autističnog spektra (ASD).

Mnogi nalazi CMA nisu imali očitu povezanost sa SIDS-om/SUDC-om i zahtijevaju daljnje istraživanje. Na primjer, dvoje djece imalo je nedijagnosticiran Klinefelterov sindrom, u kojem se dječaci rađaju s viškom X kromosoma, ali općenito imaju normalan životni vijek. Nekoliko identificiranih kromosomskih delecija/duplikacija također je povezano s neurorazvojnim stanjima, uključujući napadaje, ASD, kašnjenje u razvoju i shizofreniju.

Dodavanje arsenalu testiranja

E-knjiga o genetici i genomici

Kompilacija najboljih intervjua, članaka i vijesti iz prošle godine. Preuzmite besplatnu kopiju

U prethodnom radu, istraživači u Bostonskoj dječjoj ustanovi koristili su sekvenciranje cijelog egzoma (sekvenciranje 1 do 2 posto genoma koji kodira proteine) za procjenu djece čija je smrt klasificirana kao SIDS ili SUDC. U ovoj studiji, 11 posto djece imalo je genetske varijante (promjene) koje su vjerojatno imale ulogu u njihovoj smrti. Ostaje za vidjeti u kojoj bi mjeri CMA pridonio ovim rezultatima i koliko postoji preklapanja između gena za koje je utvrđeno da su izmijenjeni sekvenciranjem egzoma i gena zahvaćenih brisanjem/dupliciranjem DNK.

Tim se nada da će njihova otkrića potaknuti medicinske istražitelje koji istražuju smrti od SIDS-a da ih zatraže pomoć.

“Medicinski istražitelji zainteresirani su za genetsko testiranje, ali im nedostaju resursi, posebno kada je riječ o tumačenju rezultata”, kaže Goldstein. "Pokušavamo pomaknuti ovu loptu naprijed i pružiti korisne informacije."

Osim sekvenciranja egzoma i kromosomskih abnormalnosti u CMA, istraživači su nedavno dobili potporu od američkog Instituta za SIDS za proučavanje složenijih strukturnih promjena u kromosomima koje mogu pridonijeti SIDS-u i SUDC-u, koristeći naprednu genomsku platformu nazvanu Bionano Saphyr za snimanje ekstremno dugih lanaca DNK.

"Ova tehnika nam daje mogućnost da pronađemo strukturne varijacije koje su prevelike da bi se otkrile tradicionalnim sekvenciranjem DNK, ali premale da bi se otkrile kromosomskim mikronizovima", kaže Brownstein, glavni autor studije i znanstveni direktor Centra za otkrivanje gena Manton Centra za istraživanje bolesti siročadi pri Bostonskoj dječjoj ustanovi. “Također možemo otkriti slučajeve u kojima se segment DNK “okrene” na drugo mjesto na kromosomu.

Dugoročno, kako troškovi sekvenciranja DNK opadaju, istraživači žele koristiti sekvenciranje cijelog genoma za proučavanje SIDS-a i SUDC-a, jednog testa koji bi mogao smanjiti potrebu za CMA.

Izvor:

Bostonska dječja bolnica

Referenca:

Brownstein, CA, i sur. (2022) Varijacije broja kopija i strukturni genomski nalazi u 116 slučajeva iznenadne neobjašnjive smrti između 1 i 28 mjeseci. Napredna genetika. doi.org/10.1002/ggn2.202200012.

.