L'analisi dei microarray cromosomici potrebbe aiutare a identificare la causa della SIDS o della SUDC nei bambini più grandi

L'analisi dei microarray cromosomici potrebbe aiutare a identificare la causa della SIDS o della SUDC nei bambini più grandi

Un test genetico noto come analisi microarray cromosomica (CMA) potrebbe aiutare a identificare la causa della sindrome della morte improvvisa del lattante (SIDS) o la sua controparte nei bambini più grandi, nota come morte improvvisa inspiegabile nell'infanzia (SUDC), secondo uno studio condotto dal Boston Children's Hospital.

I ricercatori, guidati da Richard Goldstein, MD, Ingrid Holm, MD, MPH, e Catherine Brownstein, MPH, PhD, chiedono che la CMA diventi una routine nella valutazione di SIDS e SUDC. Hanno pubblicato i risultati del loro studio online il 7 novembre sulla rivista Advanced Genetics.

"Crediamo di avere informazioni sufficienti per dire che vale la pena considerare la CMA quando un bambino è morto senza spiegazione e che vale la pena indagare ulteriormente per comprendere meglio queste morti", afferma Goldstein, che dirige il programma Sudden Unexpected Death in Pediatrics di Robert presso il Boston Children's ed è stato autore senior dello studio.

Il team ha utilizzato la CMA per testare campioni di 116 neonati e bambini piccoli fino a 28 mesi deceduti, i cui decessi sono stati classificati come SIDS o SUDC. In 14 bambini (12%), la CMA ha identificato delezioni o duplicazioni di segmenti del DNA del bambino o piccoli riarrangiamenti del DNA che erano patogeni o “favorevolemente patogeni”.

La CMA è già utilizzata abitualmente per bambini affetti da condizioni quali autismo, ritardo dello sviluppo e anomalie congenite multiple, nonché per bambini con condizioni mediche non diagnosticate”.

Ingrid Holm, co-autrice senior dello studio

Per convalidare ulteriormente i loro risultati, i ricercatori hanno confrontato i risultati della CMA nei pazienti SIDS/SUDC con quelli dei gruppi di controllo di bambini della comunità e di due coorti di bambini con disturbo dello spettro autistico. Nel valutare la probabilità di cambiamenti cromosomici potenzialmente di impatto nell’APLV, il gruppo SIDS/SUDC ha ottenuto punteggi significativamente più alti rispetto al gruppo di controllo, ma aveva punteggi simili a quelli dei bambini con disturbo dello spettro autistico (ASD).

Molti dei risultati della CMA non avevano alcuna associazione apparente con SIDS/SUDC e richiedono ulteriori indagini. Ad esempio, due bambini avevano la sindrome di Klinefelter non diagnosticata, in cui i ragazzi nascono con un cromosoma X in più ma generalmente hanno una durata di vita normale. Diverse delezioni/duplicazioni cromosomiche identificate sono state anche collegate a condizioni dello sviluppo neurologico, tra cui convulsioni, ASD, ritardo dello sviluppo e schizofrenia.

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In lavori precedenti, i ricercatori del Boston Children's hanno utilizzato il sequenziamento dell'intero esoma (sequenziamento dell'1-2% del genoma che codifica per le proteine) per valutare i bambini le cui morti erano state classificate come SIDS o SUDC. In questo studio, l’11% dei bambini presentava varianti genetiche (cambiamenti) che probabilmente hanno avuto un ruolo nella loro morte. Resta da vedere in che misura la CMA contribuirebbe a questi risultati e quanta sovrapposizione c'è tra i geni risultati alterati dal sequenziamento dell'esoma e i geni affetti da delezioni/duplicazioni del DNA.

Il team spera che i risultati incoraggino gli investigatori medici che indagano sulle morti per SIDS a chiedere loro aiuto.

"I ricercatori medici sono interessati ai test genetici, ma non hanno le risorse, soprattutto quando si tratta di interpretare i risultati", afferma Goldstein. "Stiamo cercando di portare avanti questa palla e fornire informazioni utili."

Oltre al sequenziamento dell'esoma e alle anomalie cromosomiche nella CMA, i ricercatori hanno recentemente ricevuto un finanziamento dall'American SIDS Institute per studiare cambiamenti strutturali più complessi nei cromosomi che potrebbero contribuire alla SIDS e alla SUDC, utilizzando una piattaforma genomica avanzata chiamata Bionano Saphyr per visualizzare filamenti di DNA estremamente lunghi.

"Questa tecnica ci dà la capacità di trovare variazioni strutturali che sono troppo grandi per essere rilevate dal sequenziamento tradizionale del DNA ma troppo piccole per essere rilevate con microarray cromosomici", afferma Brownstein, autore principale dello studio e direttore scientifico del Manton Center for Orphan Disease Research Gene Discovery Core presso il Boston Children's. “Possiamo anche rilevare casi in cui un segmento di DNA “si capovolge” in una posizione diversa sul cromosoma.

Nel lungo termine, man mano che il costo del sequenziamento del DNA diminuisce, i ricercatori vogliono utilizzare il sequenziamento dell’intero genoma per studiare SIDS e SUDC, un singolo test che potrebbe ridurre la necessità di CMA.

Fonte:

Ospedale pediatrico di Boston

Riferimento:

Brownstein, CA, et al. (2022) Variazione del numero di copie e risultati genomici strutturali in 116 casi di morte improvvisa e inspiegabile tra 1 e 28 mesi. Genetica avanzata. doi.org/10.1002/ggn2.202200012.

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