Analiza kromosomskih mikromrež bi lahko pomagala ugotoviti vzrok SIDS ali SUDC pri starejših otrocih

Analiza kromosomskih mikromrež bi lahko pomagala ugotoviti vzrok SIDS ali SUDC pri starejših otrocih

Genetski test, znan kot analiza kromosomskih mikromrež (CMA), bi lahko pomagal prepoznati vzrok sindroma nenadne smrti dojenčka (SIDS) ali njegovega dvojnika pri starejših otrocih, znanega kot nenadna nepojasnjena smrt v otroštvu (SUDC), ugotavlja študija, ki jo vodi Bostonska otroška bolnišnica.

Raziskovalci, ki jih vodijo Richard Goldstein, MD, Ingrid Holm, MD, MPH, in Catherine Brownstein, MPH, PhD, zahtevajo, da CMA postane rutina pri vrednotenju SIDS in SUDC. Svoje rezultate študije so objavili na spletu 7. novembra v reviji Advanced Genetics.

"Verjamemo, da imamo dovolj informacij, da lahko rečemo, da je CMA vredno razmisliti, ko je otrok umrl brez pojasnila, in je vredno nadaljnje preiskave, da bi bolje razumeli te smrti," pravi Goldstein, ki vodi Robertov program za nenadno nepričakovano smrt v pediatriji na Bostonski otroški kliniki in je bil višji avtor študije.

Ekipa je uporabila CMA za testiranje vzorcev 116 umrlih dojenčkov in malčkov, starih do 28 mesecev, katerih smrt je bila razvrščena kot SIDS ali SUDC. Pri 14 otrocih (12 odstotkov) je CMA odkril delecije ali podvajanja segmentov otrokove DNK ali majhne preureditve DNK, ki so bile patogene ali "ugodno patogene".

CMA se že redno uporablja za otroke z boleznimi, kot so avtizem, zaostanek v razvoju in številne prirojene anomalije, pa tudi za otroke z nediagnosticiranimi zdravstvenimi težavami.«

Ingrid Holm, soavtorica študije

Da bi dodatno potrdili svoje ugotovitve, so raziskovalci primerjali rezultate CMA pri bolnikih s SIDS/SUDC s tistimi v kontrolnih skupinah otrok iz skupnosti in dveh kohortah otrok z motnjo avtističnega spektra. Pri ocenjevanju verjetnosti potencialno vplivnih kromosomskih sprememb pri CMA je skupina SIDS/SUDC dosegla znatno višje rezultate kot kontrolna skupina, vendar je imela podobne rezultate kot otroci z motnjo avtističnega spektra (ASD).

Mnoge ugotovitve CMA niso imele očitne povezave s SIDS/SUDC in zahtevajo nadaljnje preiskave. Na primer, dva otroka sta imela nediagnosticiran Klinefelterjev sindrom, pri katerem se dečki rodijo z dodatnim kromosomom X, vendar imajo na splošno normalno življenjsko dobo. Več ugotovljenih kromosomskih izbrisov/podvojitev je bilo prav tako povezanih z nevrorazvojnimi stanji, vključno z epileptičnimi napadi, ASD, razvojno zamudo in shizofrenijo.

Dodajanje v arzenal testiranja

E-knjiga o genetiki in genomiki

Zbirka najboljših intervjujev, člankov in novic zadnjega leta. Prenesite brezplačno kopijo

V prejšnjem delu so raziskovalci na Boston Children's uporabili sekvenciranje celotnega eksoma (sekvenciranje 1 do 2 odstotkov genoma, ki kodira beljakovine), da bi ocenili otroke, katerih smrt je bila razvrščena kot SIDS ali SUDC. V tej študiji je imelo 11 odstotkov otrok genetske različice (spremembe), ki so verjetno imele vlogo pri njihovi smrti. Še vedno je treba videti, v kolikšni meri bi CMA prispeval k tem rezultatom in koliko je prekrivanja med geni, za katere je bilo ugotovljeno, da so spremenjeni s sekvenciranjem eksomov, in geni, na katere vplivajo delecije/podvajanja DNK.

Ekipa upa, da bodo njihove ugotovitve spodbudile medicinske preiskovalce, ki preiskujejo smrti SIDS, da jih prosijo za pomoč.

»Zdravniki se zanimajo za genetsko testiranje, vendar jim primanjkuje sredstev, zlasti ko gre za interpretacijo rezultatov,« pravi Goldstein. "Poskušamo premakniti to žogo naprej in zagotoviti koristne informacije."

Poleg sekvenciranja eksomov in kromosomskih nepravilnosti pri CMA so raziskovalci nedavno prejeli štipendijo ameriškega inštituta za SIDS za preučevanje kompleksnejših strukturnih sprememb v kromosomih, ki lahko prispevajo k SIDS in SUDC, z uporabo napredne genomske platforme, imenovane Bionano Saphyr, za slikanje izjemno dolgih verig DNK.

"Ta tehnika nam daje možnost, da najdemo strukturne variacije, ki so prevelike, da bi jih lahko zaznali s tradicionalnim sekvenciranjem DNK, vendar premajhne, ​​da bi jih zaznali s kromosomskimi mikromrežami," pravi Brownstein, vodilni avtor študije in znanstveni direktor Mantonovega centra za raziskovanje bolezni sirot Gene Discovery Core pri Bostonski otroški ustanovi. »Zaznamo lahko tudi primere, ko se segment DNK »obrne« na drugo mesto na kromosomu.

Dolgoročno, ko se stroški sekvenciranja DNK znižujejo, želijo raziskovalci uporabiti sekvenciranje celotnega genoma za preučevanje SIDS in SUDC, en sam test, ki bi lahko zmanjšal potrebo po CMA.

Vir:

Bostonska otroška bolnišnica

Referenca:

Brownstein, CA, et al. (2022) Spremembe števila kopij in strukturne genomske ugotovitve v 116 primerih nenadne nepojasnjene smrti med 1 in 28 meseci. Napredna genetika. doi.org/10.1002/ggn2.202200012.

.