Un nouveau modèle montre comment l'instabilité génomique apparaît dans des tissus histologiquement bénins

Un nouveau modèle montre comment l'instabilité génomique apparaît dans des tissus histologiquement bénins

Comprendre quelles cellules donnent naissance à quelles zones de cancer peut améliorer notre compréhension de la croissance et du développement d'une tumeur, y compris de la façon dont elle a changé génétiquement au fil du temps. Cela a été rendu possible grâce à une nouvelle technique appelée transcriptomique spatiale, qui permet aux scientifiques de voir quels changements génétiques se produisent sans détruire le tissu considéré. Cela ajoute une nouvelle dimension que les chercheurs ont désormais utilisée pour révéler quelles cellules ont muté et où dans l'écosystème d'un organe.

Les techniques actuelles pour étudier la génétique des cellules dans les tumeurs comprennent le prélèvement d'un échantillon de la zone cancéreuse et l'analyse de l'ADN de ces cellules. Le problème est que de nombreux cancers, comme le cancer de la prostate, sont tridimensionnels, ce qui signifie que chaque échantillon individuel ne fournirait qu’un petit aperçu de la tumeur.

Dans une nouvelle étude publiée dans Nature et financée par Cancer Research UK, les chercheurs ont utilisé la transcriptomique spatiale pour créer une carte transversale de l'ensemble d'une prostate, y compris les zones de cellules saines et cancéreuses. En regroupant les cellules selon une identité génétique similaire, ils ont été surpris de voir des zones de tissus soi-disant sains qui présentaient déjà de nombreuses caractéristiques génétiques du cancer. Cette découverte était surprenante à la fois en raison de la variabilité génétique au sein du tissu et du grand nombre de cellules qui seraient considérées comme saines mais contenaient des mutations normalement identifiées avec les cellules cancéreuses.

Le tissu prostatique est tridimensionnel et, comme la plupart des organes susceptibles de développer un cancer, nous avons encore beaucoup à apprendre sur les changements cellulaires qui causent le cancer et sur l’endroit où il commence. Nous sommes presque sûrs que cela commence par des mutations génétiques.

Alastair Lamb, Département Nuffield des sciences chirurgicales, Université d'Oxford

"Nous n'avons jamais eu ce niveau de résolution disponible auparavant, et cette nouvelle approche a révélé des résultats surprenants. Par exemple, nous avons constaté que de nombreux événements de nombre de copies que nous pensions auparavant spécifiquement associés au cancer sont en réalité déjà présents dans les tissus bénins. Cela a des implications majeures pour le diagnostic et potentiellement aussi pour décider quelles parties d'un cancer doivent être traitées. "

Le professeur Joakim Lundeberg du KTH Royal Institute of Technology a déclaré : « Cartographier des milliers de régions tissulaires en une seule expérience est une approche sans précédent pour déchiffrer l'hétérogénéité des tumeurs et leur microenvironnement.

En outre, les chercheurs ont analysé plus de 150 000 régions dans trois tissus de la prostate, deux du sein, de la peau, des ganglions lymphatiques et du cerveau et ont développé un algorithme pour suivre des groupes de cellules présentant des modifications génétiques similaires - les clones - jusqu'à leur emplacement précis. Cette approche leur a permis de zoomer directement à partir des tissus visibles, à travers des structures multicellulaires microscopiques et directement dans les gènes eux-mêmes, tout en gardant un œil sur le paysage global du tissu.

Source:

Université d'Oxford

Référence:

Erickson, A. et coll. (2022) Modifications du nombre de copies clonales résolues spatialement dans les tissus bénins et malins. Nature. est ce que je.org/10.1038/s41586-022-05023-2.

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