Un model nou arată cum apare instabilitatea genomică în țesutul benign din punct de vedere histologic

Un model nou arată cum apare instabilitatea genomică în țesutul benign din punct de vedere histologic

Înțelegerea celulelor care dau naștere la care zone de cancer ne poate îmbunătăți înțelegerea modului în care a crescut și s-a dezvoltat o tumoare, inclusiv cum s-a schimbat genetic în timp. Acest lucru a fost posibil printr-o nouă tehnică numită transcriptomică spațială, care permite oamenilor de știință să vadă ce modificări genetice au loc fără a descompune țesutul luat în considerare. Acest lucru adaugă o nouă dimensiune pe care cercetătorii au folosit-o acum pentru a dezvălui care celule au mutat și unde în ecosistemul unui organ.

Tehnicile actuale pentru studierea geneticii celulelor din tumori includ prelevarea unei probe din zona canceroasă și analiza ADN-ului acelor celule. Problema este că multe tipuri de cancer, cum ar fi cancerul de prostată, sunt tridimensionale, ceea ce înseamnă că fiecare probă individuală ar oferi doar un mic instantaneu al tumorii.

Într-un nou studiu publicat în Nature și finanțat de Cancer Research UK, cercetătorii au folosit transcriptomica spațială pentru a crea o hartă transversală a unei întregi prostate, inclusiv zone de celule sănătoase și canceroase. Prin gruparea celulelor după identitate genetică similară, ei au fost surprinși să vadă zone de țesut presupus sănătos care aveau deja multe dintre caracteristicile genetice ale cancerului. Această descoperire a fost surprinzătoare atât din cauza variabilității genetice din țesut, cât și din cauza numărului mare de celule care ar fi considerate sănătoase, dar care conțin mutații identificate în mod normal cu celulele canceroase.

Țesutul de prostată este tridimensional și, la fel ca majoritatea organelor care pot dezvolta cancer, mai avem multe de învățat despre ce modificări celulare cauzează cancerul și unde începe acesta. Suntem destul de siguri că începe cu mutații genetice.”

Alastair Lamb, Departamentul de Științe Chirurgicale Nuffield, Universitatea din Oxford

„Nu am avut niciodată acest nivel de rezoluție disponibil până acum, iar această nouă abordare a dezvăluit niște rezultate surprinzătoare. De exemplu, am descoperit că multe dintre evenimentele cu numărul de copii despre care credeam anterior că sunt asociate în mod specific cu cancerul sunt deja prezente în țesutul benign. Acest lucru are implicații majore pentru diagnostic și, potențial, de asemenea, pentru a decide ce părți ale unui cancer trebuie tratate.”

Profesorul Joakim Lundeberg de la Institutul Regal de Tehnologie KTH a spus: „Cartografiarea a mii de regiuni de țesut într-un singur experiment este o abordare fără precedent pentru a descifra eterogenitatea tumorilor și a micromediului lor. Această vedere de înaltă rezoluție influențează modul în care vedem ecosistemele complexe, cum ar fi capacitatea de a detecta evenimente timpurii, este specială pentru viitorul interesant”.

În plus, cercetătorii au analizat peste 150.000 de regiuni din trei țesuturi de prostată, doi sâni, piele, ganglioni limfatici și creier și au dezvoltat un algoritm pentru a urmări grupuri de celule cu modificări genetice similare - clone - până la locația lor precisă. Această abordare le-a permis să zoomeze direct din țesutul vizibil, prin structuri multicelulare microscopice și direct în genele în sine, păstrând în același timp un ochi pe peisajul general al țesutului.

Sursă:

Universitatea din Oxford

Referinţă:

Erickson, A. şi colab. (2022) Modificări ale numărului de copii clonale rezolvate spațial în țesuturile benigne și maligne. Natură. doi.org/10.1038/s41586-022-05023-2.

.