Výzkum zdůrazňuje vznik imunitně vyhýbavých variant SARS-CoV-2 u imunokompromitovaných pacientů

Výzkum zdůrazňuje vznik imunitně vyhýbavých variant SARS-CoV-2 u imunokompromitovaných pacientů

Nový výzkum, který bude příští týden představen na globálním kongresu ESCMID (dříve ECCMID) v Barceloně ve Španělsku (27. až 30. dubna), zdůrazňuje riziko nových imunitně vyhýbavých variant SARS-CoV-2, které se objevují u imunokompromitovaných pacientů. Zprávu vypracovala doktorandka Magda Vergouweová, Centrum pro experimentální a molekulární medicínu (CEMM), Amsterdam University Medical Center (Amsterdam UMC), University of Amsterdam, Nizozemsko a kolegové.

Popisují prodloužený vývoj viru u pacienta infikovaného SARS-CoV-2 po dobu 613 dnů, což vedlo k silně mutované nové variantě. Pokud je autorům známo, jedná se o dosud nejdelší trvání infekce SARS-CoV-2, i když již bylo zaznamenáno několik případů trvajících stovky dní.

Zatímco zdraví pacienti infikovaní SARS-CoV-2 mohou virus odstranit během dnů až týdnů, u osoby s oslabenou imunitou se může rozvinout perzistentní infekce s prodlouženou replikací a vývojem viru. Například se předpokládá, že počáteční výskyt varianty Omicron pochází z imunokompromitovaného jedince, což zdůrazňuje důležitost pečlivého sledování genomu u této populace pacientů. Kromě toho může použití cíleného imunitního tlaku, včetně terapií monoklonálními protilátkami a/nebo nových antivirových léků, dále podporovat vznik variant úniku viru.

Vergouwe a kolegové ve své zprávě popisují 72letého imunokompromitovaného pacienta přijatého do univerzitní nemocnice v Amsterdamu. v únoru 2022 s infekcí SARS-CoV-2. Byl považován za imunokompromitovaného kvůli anamnéze alogenní transplantace kmenových buněk pro léčbu myelodysplastického a myeloproliferativního překryvného syndromu. To bylo komplikováno rozvojem lymfomu po transplantaci, kvůli kterému dostal rituximab, který vyčerpává všechny dostupné B buňky, včetně těch, které normálně produkují protilátky namířené proti SARS-CoV-2.

Předtím byl několikrát očkován proti SARS-CoV-2, aniž by při přijetí do nemocnice došlo k měřitelné reakci IgG protilátek SARS-CoV-2. Rutinní genomický dohled odhalil infekci Omicron SARS-CoV-2 variantou BA.1.17. Bez klinické odpovědi dostával léčbu anti-SARS-CoV-2 protilátkou sotrovimab, anti-IL6 protilátkou sarilumab a dexamethason.

Následné sekvenování SARS-CoV-2 ukázalo vývoj známé mutace rezistence na sotrovimab S:E340K již 21 dní po podání infuze sotrovimabu. Aktivita T-buněk specifických pro SARS-CoV-2 a tvorba protilátek proti špičce byly v prvním měsíci minimální, což naznačuje, že imunitní systém pacienta nebyl schopen virus vyčistit. Probíhající infekce vedla ke vzniku nové imunitně vyhýbavé varianty v důsledku rozsáhlé evoluce v hostiteli. Nakonec pacient zemřel na recidivu svého hematologického onemocnění poté, co zůstal pozitivní na SARS-CoV-2 s vysokou virovou náloží po dobu celkem 613 dnů. Naštěstí nebyl zdokumentován přenos vysoce mutované varianty na sekundární případy v komunitě.

Přesněji řečeno, 613 dní po první detekci SARS-CoV-2 bylo charakterizováno četnými symptomatickými epizodami souvisejícími se SARS-CoV-2 a nesouvisejícími, které vyžadovaly hospitalizaci. Přetrvávající infekce SARS-CoV-2 způsobila, že pacient měl delší období izolace a zvýšené používání osobních ochranných materiálů během hospitalizace, což významně zhoršilo jeho samoukazovanou kvalitu života. Sekvenování celého genomu SARS-CoV-2 bylo provedeno na 27 vzorcích z nosohltanu odebraných od února 2022 do září 2023. Tím bylo identifikováno více než 50 nukleotidových mutací ve srovnání s variantami BA.1, které v současnosti kolují po celém světě s mnoha substitucemi aminokyselin, včetně substitucí vazebného místa receptoru ACE-2 S:KL453F/M Kromě toho se v N-terminální doméně Spika vyvinuly četné delece, což naznačuje imunitní únik.

Autoři říkají: „Tento případ poukazuje na riziko přetrvávajících infekcí SARS-CoV-2 u imunokompromitovaných jedinců, protože se mohou objevit jedinečné varianty viru SARS-CoV-2 v důsledku rozsáhlé evoluce v hostiteli. Zdůrazňujeme význam pokračujícího genomového monitorování vývoje SARS-CoV-2 u imunokompromitovaných jedinců s přetrvávajícími infekcemi, vzhledem k potenciální hrozbě pro veřejné zdraví, kterou představuje zavedení variant úniku viru do komunity.“

Přestože je zapotřebí pečlivé sledování, autoři zdůrazňují, že musí existovat rovnováha mezi ochranou veřejnosti před potenciálními novými variantami a humánní podpůrnou domácí péčí o kriticky nemocné pacienty na konci života. Možná řešení mohou zahrnovat zvýšené povědomí o potenciálních rizicích v kombinaci s poskytováním včasného dostupného diagnostického testování známým (rodinným) kontaktům, jakmile se u nich objeví příslušné příznaky. To by mělo být kombinováno s genomickým dozorem, aby bylo možné společně s odborníky na veřejné zdraví posoudit hrozbu pro veřejné zdraví. Autoři zdůrazňují, že i když u imunokompromitovaných pacientů může existovat zvýšené riziko vzniku nových variant, ne každá nová varianta u těchto pacientů se vyvine v novou variantu, která je pro komunitu předmětem zájmu (VOC). Základní mechanismy zapojené do vývoje VOC jsou mnohem složitější, protože také závisí na faktorech v populaci obklopující pacienta, včetně prevalence imunity související s B- a T-buňkami.

Autoři uzavírají: „Délka trvání infekce SARS-CoV-2 v tomto popsaném případě je extrémní, ale delší infekce se u imunokompromitovaných pacientů vyskytuje mnohem častěji než u běžné populace. Další práce našeho týmu zahrnuje popis kohorty dlouhotrvajících infekcí u imunokompromitovaných pacientů z naší nemocnice s dobou trvání infekce od 1 měsíce do 2 let. Z pohledu široké veřejnosti však přetrvávající infekce zůstávají vzácné, protože imunokompromitovaná populace představuje velmi malé procento celkové populace.“

Zdroje: