Novo modelo mostra como a instabilidade genômica surge em tecido histologicamente benigno

Novo modelo mostra como a instabilidade genômica surge em tecido histologicamente benigno

Compreender quais células dão origem a que áreas de cancro pode melhorar a nossa compreensão de como um tumor cresceu e se desenvolveu, incluindo como mudou geneticamente ao longo do tempo. Isso foi possível graças a uma nova técnica chamada transcriptômica espacial, que permite aos cientistas ver quais mudanças genéticas estão ocorrendo sem quebrar o tecido em questão. Isto acrescenta uma nova dimensão que os investigadores usaram agora para revelar quais células sofreram mutação e onde estão no ecossistema de um órgão.

As técnicas atuais para estudar a genética das células nos tumores incluem a coleta de uma amostra da área cancerosa e a análise do DNA dessas células. O problema é que muitos cancros, como o cancro da próstata, são tridimensionais, o que significa que cada amostra individual forneceria apenas uma pequena imagem do tumor.

Num novo estudo publicado na Nature e financiado pela Cancer Research UK, os investigadores usaram a transcriptómica espacial para criar um mapa transversal de uma próstata inteira, incluindo áreas de células saudáveis ​​e cancerosas. Ao agrupar células por identidade genética semelhante, ficaram surpreendidos ao ver áreas de tecido supostamente saudável que já apresentavam muitas das características genéticas do cancro. Esta descoberta foi surpreendente tanto pela variabilidade genética dentro do tecido como pelo grande número de células que seriam consideradas saudáveis, mas continham mutações normalmente identificadas com células cancerígenas.

O tecido da próstata é tridimensional e, como a maioria dos órgãos que podem desenvolver câncer, ainda temos muito que aprender sobre quais alterações celulares causam o câncer e onde ele começa. Temos certeza de que tudo começa com mutações genéticas.”

Alastair Lamb, Departamento de Ciências Cirúrgicas de Nuffield, Universidade de Oxford

"Nunca tivemos este nível de resolução disponível antes, e esta nova abordagem revelou alguns resultados surpreendentes. Por exemplo, descobrimos que muitos dos eventos de número de cópias que pensávamos anteriormente estarem especificamente associados ao cancro já estão, na verdade, presentes em tecidos benignos. Isto tem implicações importantes para o diagnóstico e, potencialmente, também para decidir quais partes de um cancro precisam de ser tratadas."

O professor Joakim Lundeberg do KTH Royal Institute of Technology disse: "Mapear milhares de regiões de tecidos em um único experimento é uma abordagem sem precedentes para decifrar a heterogeneidade dos tumores e seu microambiente. Esta visão de alta resolução influencia a maneira como vemos ecossistemas complexos, como a capacidade de detectar eventos precoces é especial para o futuro emocionante."

Além disso, os pesquisadores analisaram mais de 150 mil regiões em três tecidos de próstata, dois de mama, pele, linfonodos e cérebro e desenvolveram um algoritmo para rastrear grupos de células com alterações genéticas semelhantes – clones – até sua localização precisa. Esta abordagem permitiu-lhes ampliar diretamente a partir do tecido visível, através de estruturas multicelulares microscópicas, e diretamente nos próprios genes, mantendo ao mesmo tempo um olho na paisagem geral do tecido.

Fonte:

Universidade de Oxford

Referência:

Erickson, A. et al. (2022) Alterações no número de cópias clonais resolvidas espacialmente em tecidos benignos e malignos. Natureza. doi.org/10.1038/s41586-022-05023-2.

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