Største akademiske samarbejde har til formål at transformere behandlingen af ​​børnekræft

Største akademiske samarbejde har til formål at transformere behandlingen af ​​børnekræft

Broad Institute of MIT og Harvard, Dana-Farber Cancer Institute og St. Jude Children's Research Hospital annoncerede i dag det største akademiske samarbejde af sin art for at transformere og accelerere identifikation af sårbarheder i børnekræft og omsætte dem til bedre behandlinger.

Samarbejdet er støttet af en ny fælles finansieringsinvestering fra alle tre institutioner på mere end 60 millioner dollars over fem år. Denne investering vil støtte udviklingen af ​​infrastruktur og det videnskabelige arbejde i et team, der i øjeblikket består af mere end 80 samarbejdende forskere, dataforskere og forskningspersonale. Initiativet forventes at nå op på 100 medlemmer, efterhånden som hver institution tilføjer nyt personale.

Ved at kombinere de tre institutioners intellektuelle lederskab, tekniske ekspertise og institutionelle ressourcer, sigter dette nye samarbejde på at adressere kritiske videnshuller relateret til det biologiske grundlag for børnekræft, og hvordan det kan behandles mere effektivt. Pediatric Cancer Dependencies Accelerator-projektet, kendetegnet ved dets store investeringsskala, antallet af samarbejdende videnskabsmænd og videnskabelige omfang, vil fremskynde fremskridt i udviklingen af ​​nye behandlinger for aggressive børnekræftformer ved:

• Entwicklung und Einsatz von Genom-Editierungstechniken zur Identifizierung versteckter Schwachstellen (Abhängigkeiten) bei einer Reihe von hochriskanten Gehirn-, soliden und Blutkrebserkrankungen im Kindesalter.
• Nutzung neuer Technologien zur Charakterisierung der genetischen und epigenetischen Landschaft von Krebserkrankungen bei Kindern.
• Entwicklung von Modellsystemen für Hochrisiko-Krebserkrankungen im Kindesalter mit schlechtem Ausgang, wo es derzeit keine gibt.
• Identifizierung wirksamer Kombinationstherapien und Mechanismen der Arzneimittelresistenz sowie Verkürzung des Zeitrahmens für die Entwicklung neuer Therapien.
• Entwicklung rechnerischer Ansätze zur Gewinnung und Integration von Daten und Entwicklung innovativer Softwaretools für den Datenaustausch.

Projektet ledes i fællesskab af Charles W. M. Roberts, MD, PhD, direktør for St. Jude Comprehensive Cancer Center, Kimberly Stegmaier, MD, Dana-Farber Cancer Institute, næstformand for pædiatrisk onkologisk forskning, og Francisca Vazquez, PhD, Broad Institute Cancer, direktør for dependency Map-projektet.

På trods af mange fremskridt er kræft fortsat den førende årsag til sygdomsrelateret død blandt børn i USA. I et forskningslaboratorium kan det tage årtier at forstå mekanismer og udvikle nye behandlinger. Vi tror på, at vi gennem dette projekt nu kan overvinde forhindringer for hurtigt at identificere terapeutiske sårbarheder i børnekræft og meget hurtigere omsætte disse til målrettede behandlinger i klinikken.”

Charles WM Roberts, MD, PhD, St. Jude Comprehensive Cancer Center

"Vores første projekt om afhængighed af børnekræft var ekstremt vellykket, men kun toppen af ​​isbjerget," sagde Stegmaier. "Jeg er meget glad for dette hidtil usete samarbejde mellem tre exceptionelle institutioner. PedDep Accelerator vil afsløre nye og tiltrængte nye terapeutiske mål, samtidig med at den afdækker det mekanistiske grundlag for en række børnekræftformer, hvilket giver os et væld af data." Forskersamfund."

"PedDep Accelerator er et eksempel på kraften i dybt samarbejde og at samle et tværfagligt team på tværs af institutioner for at løse en vigtig sygdomsudfordring, der påvirker børn over hele verden," sagde Vazquez. "Ved at dele data og udvikle værktøjer sigter vi efter at skabe en ressource, som det videnskabelige samfund kan bruge til at gøre en reel indflydelse på børnekræft. Jeg er spændt på at se, hvilken indflydelse dette projekt vil have på tempoet i terapeutisk opdagelse af pædiatriske tumorer." ."

Childhood Cancer: En mulighed for innovation og opdagelse

Samarbejdet bygger på banebrydende forskningsinitiativer fra hver institution. I løbet af det sidste årti har Pediatric Cancer Genome Project ved St. Jude-Washington University og andre storstilede sekventeringsbestræbelser givet omfattende indsigt i det genomiske landskab af børnekræft, herunder erkendelsen af, at de fleste sygdomsfremkaldende genetiske mutationer ikke kan behandles med lægemidler. Udvikling af præcise terapier kræver at identificere kræftafhængigheder og sårbarheder, som ikke kan afsløres ved at analysere genomiske datasæt alene.

Broads Cancer Dependency Map (DepMap)-initiativ har udviklet datasæt og computerinfrastruktur i stor skala i verdensklasse, som har påvirket forskning og målopdagelsesprogrammer verden over. Pediatric Cancer Dependency Map Project (PedDep), der blev lanceret i 2015, fungerede som et proof-of-concept for anvendelsen af ​​DepMap-tilgangen til børnekræft. For eksempel er hel-genom CRISPR-skærme nu blevet brugt med succes i stor skala til at identificere sårbarheder i hundredvis af voksne kræftformer, og principielt bevis er blevet vist, at disse tilgange også kan identificere sårbarheder i børnekræft, som ofte har meget enklere genomer. Der er også udviklet storstilede lægemiddelscreeningskapaciteter. Denne infrastruktur og ekspertise vil blive udnyttet og udvidet gennem disse bestræbelser.

Projektet vil trække på St. Jude og Dana-Farbers modelleringsekspertise i at skabe patient-derived xenograft (PDX) modeller, der bruger patientkræftceller til bedre at matche sygdommens biologi, som den opstår i klinikken. St. Jude's beregningsbiologer vil bringe bred ekspertise inden for epigenomisk og genomisk karakteriseringsanalyse, datavisualisering og beregningsmæssig pipelineudvikling. Derudover vil St. Judes infrastruktur lette kombineret lægemiddelscreening og in vivo CRISPR- og lægemiddelscreeningstilgange.

De tværfunktionelle grupper vil omfatte forskere fra Broad, Dana-Farber og St. Jude, som vil fokusere på tre kernesygdomsområder (hjernetumorer, hæmatologiske maligniteter og solide tumorer) og vil bringe kombineret kræftekspertise inden for datavidenskab, funktionel genomik og kræft i stor skala. omfattende lægemiddelscreening. Sammen vil forskere ved disse institutioner forbedre og fremskynde fremskridt ved at kombinere unikke styrker og ressourcer for at løse de største udfordringer med at forstå og behandle børnekræft.

Kilde:

St. Jude Børneforskningshospital

.