Η μεγαλύτερη ακαδημαϊκή συνεργασία στοχεύει να μεταμορφώσει τη θεραπεία του παιδικού καρκίνου

Η μεγαλύτερη ακαδημαϊκή συνεργασία στοχεύει να μεταμορφώσει τη θεραπεία του παιδικού καρκίνου

Το Broad Institute of MIT και το Harvard, το Dana-Farber Cancer Institute και το St. Jude Children's Research Hospital ανακοίνωσαν σήμερα τη μεγαλύτερη ακαδημαϊκή συνεργασία στο είδος της για να μεταμορφώσουν και να επιταχύνουν τον εντοπισμό των τρωτών σημείων στους παιδικούς καρκίνους και να τους μεταφράσουν σε καλύτερες θεραπείες.

Η συνεργασία υποστηρίζεται από μια νέα επένδυση κοινής χρηματοδότησης και από τα τρία ιδρύματα άνω των 60 εκατομμυρίων δολαρίων σε διάστημα πέντε ετών. Αυτή η επένδυση θα υποστηρίξει την ανάπτυξη υποδομών και το επιστημονικό έργο μιας ομάδας που αυτή τη στιγμή αποτελείται από περισσότερους από 80 συνεργαζόμενους ερευνητές, επιστήμονες δεδομένων και ερευνητικό προσωπικό. Η πρωτοβουλία αναμένεται να φτάσει τα 100 μέλη καθώς κάθε ίδρυμα προσθέτει νέο προσωπικό.

Συνδυάζοντας την πνευματική ηγεσία, την τεχνική τεχνογνωσία και τους θεσμικούς πόρους των τριών ιδρυμάτων, αυτή η νέα συνεργασία στοχεύει να αντιμετωπίσει κρίσιμα κενά γνώσης που σχετίζονται με τη βιολογική βάση του παιδικού καρκίνου και πώς θα μπορούσε να αντιμετωπιστεί πιο αποτελεσματικά. Το έργο Pediatric Cancer Dependencies Accelerator, που διακρίνεται για τη μεγάλη του κλίμακα επενδύσεων, τον αριθμό συνεργαζόμενων επιστημόνων και την επιστημονική του εμβέλεια, θα επιταχύνει την πρόοδο στην ανάπτυξη νέων θεραπειών για επιθετικούς παιδικούς καρκίνους με:

• Entwicklung und Einsatz von Genom-Editierungstechniken zur Identifizierung versteckter Schwachstellen (Abhängigkeiten) bei einer Reihe von hochriskanten Gehirn-, soliden und Blutkrebserkrankungen im Kindesalter.
• Nutzung neuer Technologien zur Charakterisierung der genetischen und epigenetischen Landschaft von Krebserkrankungen bei Kindern.
• Entwicklung von Modellsystemen für Hochrisiko-Krebserkrankungen im Kindesalter mit schlechtem Ausgang, wo es derzeit keine gibt.
• Identifizierung wirksamer Kombinationstherapien und Mechanismen der Arzneimittelresistenz sowie Verkürzung des Zeitrahmens für die Entwicklung neuer Therapien.
• Entwicklung rechnerischer Ansätze zur Gewinnung und Integration von Daten und Entwicklung innovativer Softwaretools für den Datenaustausch.

Συνεπικεφαλής του έργου είναι ο Charles W. M. Roberts, MD, PhD, διευθυντής του Κέντρου Καρκίνου του St.

Παρά τις πολλές προόδους, ο καρκίνος παραμένει η κύρια αιτία θανάτου που σχετίζεται με ασθένειες μεταξύ των παιδιών στις Ηνωμένες Πολιτείες. Σε ένα ερευνητικό εργαστήριο, μπορεί να χρειαστούν δεκαετίες για να κατανοηθούν οι μηχανισμοί και να αναπτυχθούν νέες θεραπείες. Πιστεύουμε ότι μέσω αυτού του έργου μπορούμε τώρα να ξεπεράσουμε τα εμπόδια για να εντοπίσουμε γρήγορα τις θεραπευτικές ευπάθειες στον παιδικό καρκίνο και να τις μεταφράσουμε σε στοχευμένες θεραπείες στην κλινική πολύ πιο γρήγορα».

Charles WM Roberts, MD, PhD, Ολοκληρωμένο Κέντρο Καρκίνου St. Jude

«Το πρώτο μας έργο χάρτη εξάρτησης από τον καρκίνο της παιδικής ηλικίας ήταν εξαιρετικά επιτυχημένο, αλλά μόνο η κορυφή του παγόβουνου», είπε ο Stegmaier. "Είμαι πολύ χαρούμενος για αυτήν την άνευ προηγουμένου συνεργασία μεταξύ τριών εξαιρετικών ιδρυμάτων. Το PedDep Accelerator θα αποκαλύψει νέους και τόσο απαραίτητους νέους θεραπευτικούς στόχους, ενώ θα αποκαλύψει τη μηχανιστική βάση μιας ποικιλίας παιδικών καρκίνων, παρέχοντας πληθώρα δεδομένων για εμάς." Ερευνητική κοινότητα."

«Το PedDep Accelerator είναι ένα παράδειγμα της δύναμης της βαθιάς συνεργασίας και της συγκέντρωσης μιας διεπιστημονικής ομάδας σε ιδρύματα για την αντιμετώπιση μιας σημαντικής πρόκλησης ασθένειας που επηρεάζει τα παιδιά παγκοσμίως», δήλωσε ο Vazquez. "Με την κοινή χρήση δεδομένων και την ανάπτυξη εργαλείων, στοχεύουμε να δημιουργήσουμε μια πηγή που μπορεί να χρησιμοποιήσει η επιστημονική κοινότητα για να έχει πραγματικό αντίκτυπο στους παιδικούς καρκίνους. Είμαι ενθουσιασμένος που βλέπω τι αντίκτυπο θα έχει αυτό το έργο στον ρυθμό της θεραπευτικής ανακάλυψης για παιδιατρικούς όγκους." .»

Παιδικός Καρκίνος: Μια Ευκαιρία για Καινοτομία και Ανακάλυψη

Η συνεργασία βασίζεται σε πρωτοποριακές ερευνητικές πρωτοβουλίες από κάθε ίδρυμα. Κατά την τελευταία δεκαετία, το Πρόγραμμα Παιδιατρικού Γονιδιώματος Καρκίνου στο Πανεπιστήμιο St. Jude-Washington και άλλες μεγάλης κλίμακας προσπάθειες προσδιορισμού αλληλουχίας παρείχαν ολοκληρωμένες πληροφορίες για το γονιδιωματικό τοπίο των παιδικών καρκίνων, συμπεριλαμβανομένης της συνειδητοποίησης ότι οι περισσότερες γενετικές μεταλλάξεις που προκαλούν ασθένειες δεν αντιμετωπίζονται με φάρμακα. Η ανάπτυξη ακριβών θεραπειών απαιτεί τον εντοπισμό εξαρτήσεων και τρωτών σημείων καρκίνου που δεν μπορούν να αποκαλυφθούν μόνο με την ανάλυση γονιδιωματικών συνόλων δεδομένων.

Η πρωτοβουλία της Broad's Cancer Dependency Map (DepMap) έχει αναπτύξει μεγάλης κλίμακας, παγκόσμιας κλάσης σύνολα δεδομένων και υπολογιστική υποδομή που έχει επηρεάσει την έρευνα και τα προγράμματα ανακάλυψης στόχων παγκοσμίως. Το έργο Pediatric Cancer Dependency Map (PedDep), που ξεκίνησε το 2015, χρησίμευσε ως απόδειξη της ιδέας για την εφαρμογή της προσέγγισης DepMap στον παιδικό καρκίνο. Για παράδειγμα, οι οθόνες CRISPR ολόκληρου του γονιδιώματος έχουν πλέον χρησιμοποιηθεί με επιτυχία σε μεγάλη κλίμακα για τον εντοπισμό τρωτών σημείων σε εκατοντάδες καρκίνους ενηλίκων και έχει αποδειχθεί η αρχή ότι αυτές οι προσεγγίσεις μπορούν επίσης να εντοπίσουν ευπάθειες σε παιδικούς καρκίνους, οι οποίοι συχνά έχουν πολύ απλούστερα γονιδιώματα. Έχουν επίσης αναπτυχθεί μεγάλης κλίμακας δυνατότητες ελέγχου φαρμάκων. Αυτή η υποδομή και η τεχνογνωσία θα αξιοποιηθούν και θα επεκταθούν μέσω αυτών των προσπαθειών.

Το έργο θα βασιστεί στην τεχνογνωσία του St. Jude και της Dana-Farber στη δημιουργία μοντέλων ξενομοσχευμάτων (PDX) που προέρχονται από ασθενείς που χρησιμοποιούν καρκινικά κύτταρα ασθενών για να ταιριάζουν καλύτερα με τη βιολογία της νόσου όπως εμφανίζεται στην κλινική. Οι υπολογιστικοί βιολόγοι του St. Jude θα φέρουν ευρεία τεχνογνωσία στην ανάλυση επιγονιδιωματικού και γονιδιωματικού χαρακτηρισμού, στην οπτικοποίηση δεδομένων και στην ανάπτυξη υπολογιστικών γραμμών. Επιπλέον, η υποδομή του St. Jude θα διευκολύνει τον συνδυασμένο έλεγχο ναρκωτικών και τις in vivo προσεγγίσεις CRISPR και ελέγχου ναρκωτικών.

Οι διαλειτουργικές ομάδες θα περιλαμβάνουν ερευνητές από τους Broad, Dana-Farber και St. Jude που θα επικεντρωθούν σε τρεις βασικούς τομείς ασθενειών (όγκοι εγκεφάλου, αιματολογικές κακοήθειες και συμπαγείς όγκοι) και θα φέρουν συνδυασμένη τεχνογνωσία στον καρκίνο στην επιστήμη δεδομένων, τη λειτουργική γονιδιωματική και τους καρκίνους μεγάλης κλίμακας. ολοκληρωμένος έλεγχος φαρμάκων. Μαζί, οι ερευνητές σε αυτά τα ιδρύματα θα βελτιώσουν και θα επιταχύνουν την πρόοδο συνδυάζοντας μοναδικές δυνάμεις και πόρους για την αντιμετώπιση των μεγαλύτερων προκλήσεων στην κατανόηση και τη θεραπεία των παιδικών καρκίνων.

Πηγή:

Ερευνητικό Νοσοκομείο Παίδων St. Jude

.