Suurima akadeemilise koostöö eesmärk on muuta lastevähi ravi

Suurima akadeemilise koostöö eesmärk on muuta lastevähi ravi

MIT-i ja Harvardi Broad Institute, Dana-Farber Cancer Institute ja St. Jude'i lasteuuringute haigla teatasid täna suurimast omataolisest akadeemilisest koostööst, mille eesmärk on muuta ja kiirendada laste vähktõve haavatavuse tuvastamist ning muuta need paremateks ravimeetoditeks.

Koostööd toetab kõigi kolme asutuse uus ühisrahastusinvesteering üle 60 miljoni dollari viie aasta jooksul. See investeering toetab infrastruktuuri arendamist ja praegu enam kui 80 koostööd tegevast teadlasest, andmeteadlasest ja teadustöötajast koosneva meeskonna teadustööd. Kui iga institutsioon lisab uusi töötajaid, peaks algatus jõudma 100 liikmeni.

Kombineerides kolme institutsiooni intellektuaalset juhtimist, tehnilisi teadmisi ja institutsionaalseid ressursse, on selle uue koostöö eesmärk lahendada kriitilised teadmiste lüngad, mis on seotud lapseea vähi bioloogilise alusega ja sellega, kuidas seda tõhusamalt ravida. Projekt Pediatric Cancer Dependencies Accelerator, mida iseloomustab suur investeeringute maht, koostööd tegevate teadlaste arv ja teaduslik ulatus, kiirendab agressiivsete lastevähi uute ravimeetodite väljatöötamist järgmistel viisidel:

• Entwicklung und Einsatz von Genom-Editierungstechniken zur Identifizierung versteckter Schwachstellen (Abhängigkeiten) bei einer Reihe von hochriskanten Gehirn-, soliden und Blutkrebserkrankungen im Kindesalter.
• Nutzung neuer Technologien zur Charakterisierung der genetischen und epigenetischen Landschaft von Krebserkrankungen bei Kindern.
• Entwicklung von Modellsystemen für Hochrisiko-Krebserkrankungen im Kindesalter mit schlechtem Ausgang, wo es derzeit keine gibt.
• Identifizierung wirksamer Kombinationstherapien und Mechanismen der Arzneimittelresistenz sowie Verkürzung des Zeitrahmens für die Entwicklung neuer Therapien.
• Entwicklung rechnerischer Ansätze zur Gewinnung und Integration von Daten und Entwicklung innovativer Softwaretools für den Datenaustausch.

Projekti juhivad Charles W. M. Roberts, MD, PhD, St. Jude'i tervikliku vähikeskuse direktor, Kimberly Stegmaier, MD, Dana-Farber Cancer Institute, pediaatrilise onkoloogia uuringute asejuht, ja Francisca Vazquez, PhD, Broad Institute Cancer, sõltuvuskaardi projekti direktor.

Vaatamata paljudele edusammudele on vähk endiselt Ameerika Ühendriikide laste haigustega seotud surmajuhtumite peamine põhjus. Uurimislaboris võib mehhanismide mõistmiseks ja uute ravimeetodite väljatöötamiseks kuluda aastakümneid. Usume, et selle projekti kaudu saame nüüd ületada tõkked, et kiiresti tuvastada lapseea vähi terapeutilised haavatavused ja muuta need kliinikus palju kiiremini sihipärasteks teraapiateks.

Charles WM Roberts, MD, PhD, St. Jude'i terviklik vähikeskus

"Meie esimene lapseea vähisõltuvuse kaardiprojekt oli äärmiselt edukas, kuid ainult jäämäe tipp," ütles Stegmaier. "Mul on väga hea meel selle enneolematu koostöö üle kolme erakordse institutsiooni vahel. PedDep Accelerator avab uudseid ja väga vajalikke uusi terapeutilisi sihtmärke, paljastades samal ajal mitmesuguste lapseea vähivormide mehaanilise aluse, pakkudes meile hulgaliselt andmeid." Teadlaste kogukond."

"PedDep Accelerator on näide sügavast koostööst ja institutsioonidevahelise multidistsiplinaarse meeskonna ühendamisest, et lahendada lapsi kogu maailmas mõjutav oluline haigusprobleem," ütles Vazquez. "Andmete jagamise ja tööriistade väljatöötamisega soovime luua ressurssi, mida teadusringkond saaks kasutada laste vähktõve tõeliseks mõjutamiseks. Mul on hea meel näha, millist mõju avaldab see projekt laste kasvajate terapeutilise avastamise tempole." .”

Lapsepõlvevähk: võimalus uuendusteks ja avastusteks

Koostöö põhineb iga institutsiooni murrangulistel uurimisalgatustel. Viimase kümnendi jooksul on St. Jude-Washingtoni ülikooli pediaatrilise vähi genoomiprojekt ja muud suuremahulised sekveneerimisalased jõupingutused andnud põhjaliku ülevaate laste vähktõve genoomsetest maastikest, sealhulgas mõistnud, et enamik haigusi põhjustavaid geneetilisi mutatsioone ei ole ravimitega ravitavad. Täpsete ravimeetodite väljatöötamiseks on vaja tuvastada vähktõve sõltuvused ja haavatavused, mida ei saa avastada ainult genoomsete andmekogumite analüüsimisega.

Broadi vähisõltuvuse kaardi (DepMap) algatus on välja töötanud suuremahulised maailmatasemel andmekogumid ja andmetöötluse infrastruktuuri, mis on mõjutanud teadusuuringuid ja sihtmärkide avastamise programme kogu maailmas. 2015. aastal käivitatud Pediatric Cancer Dependency Map Project (PedDep) oli kontseptsiooni tõestus DepMapi lähenemisviisi rakendamisel lastevähi puhul. Näiteks on terve genoomi hõlmavaid CRISPR-sõelu edukalt laialdaselt kasutatud sadade täiskasvanute vähivormide haavatavuse tuvastamiseks ning on tõestatud, et need lähenemisviisid võivad tuvastada haavatavust ka laste vähkkasvajate puhul, mille genoomid on sageli palju lihtsamad. Samuti on välja töötatud laiaulatuslikud ravimite skriinimise võimalused. Seda infrastruktuuri ja teadmisi kasutatakse nende jõupingutuste kaudu ja laiendatakse.

Projekt tugineb St. Jude'i ja Dana-Farberi modelleerimisteadmistele, luues patsiendist pärinevaid ksenotransplantaadi (PDX) mudeleid, mis kasutavad patsiendi vähirakke, et paremini sobitada kliinikus esineva haiguse bioloogiat. St. Jude'i arvutusbioloogid toovad kaasa laialdased teadmised epigenoomilise ja genoomse iseloomustuse analüüsi, andmete visualiseerimise ja arvutuslike torustike arendamise alal. Lisaks hõlbustab St. Jude'i infrastruktuur kombineeritud ravimite sõeluuringut ning in vivo CRISPR-i ja ravimite sõeluuringuid.

Ristfunktsionaalsetesse rühmadesse kuuluvad Broadi, Dana-Farberi ja St. Jude'i teadlased, kes keskenduvad kolmele põhihaiguse valdkonnale (ajukasvajad, hematoloogilised pahaloomulised kasvajad ja soliidkasvajad) ning toovad kaasa kombineeritud vähiteadmised andmeteaduse, funktsionaalse genoomika ja suuremahuliste vähivormide vallas. põhjalik uimastisõeluuringud. Üheskoos parandavad ja kiirendavad nende asutuste teadlased edusamme, ühendades ainulaadsed tugevused ja ressursid, et lahendada lapseea vähktõve mõistmise ja ravi suurimaid probleeme.

Allikas:

St. Jude'i lasteuuringute haigla

.