Lielākās akadēmiskās sadarbības mērķis ir pārveidot bērnu vēža ārstēšanu

Lielākās akadēmiskās sadarbības mērķis ir pārveidot bērnu vēža ārstēšanu

Plašais MIT un Hārvardas institūts, Dana-Farber Cancer Institute un St. Jude Children's Research Hospital šodien paziņoja par lielāko šāda veida akadēmisko sadarbību, lai pārveidotu un paātrinātu bērnu vēža ievainojamību noteikšanu un pārvērstu tās par labāku ārstēšanu.

Sadarbība tiek atbalstīta ar jaunu kopīgu finansējuma ieguldījumu no visām trim iestādēm vairāk nekā 60 miljonu ASV dolāru apmērā piecu gadu laikā. Šīs investīcijas atbalstīs infrastruktūras attīstību un zinātnisko darbu komandā, kurā pašlaik ir vairāk nekā 80 sadarbojoši pētnieki, datu zinātnieki un zinātniskais personāls. Paredzams, ka iniciatīva sasniegs 100 dalībniekus, jo katra iestāde pievienos jaunus darbiniekus.

Apvienojot trīs institūciju intelektuālo vadību, tehniskās zināšanas un institucionālos resursus, šīs jaunās sadarbības mērķis ir novērst būtisko zināšanu trūkumu saistībā ar bērnu vēža bioloģisko pamatu un to, kā to varētu efektīvāk ārstēt. Projekts Pediatric Cancer Dependencies Accelerator, kas izceļas ar lielo investīciju apjomu, sadarbojošo zinātnieku skaitu un zinātnisko darbības jomu, paātrinās progresu jaunu agresīvu bērnu vēža ārstēšanas metožu izstrādē, veicot:

• Entwicklung und Einsatz von Genom-Editierungstechniken zur Identifizierung versteckter Schwachstellen (Abhängigkeiten) bei einer Reihe von hochriskanten Gehirn-, soliden und Blutkrebserkrankungen im Kindesalter.
• Nutzung neuer Technologien zur Charakterisierung der genetischen und epigenetischen Landschaft von Krebserkrankungen bei Kindern.
• Entwicklung von Modellsystemen für Hochrisiko-Krebserkrankungen im Kindesalter mit schlechtem Ausgang, wo es derzeit keine gibt.
• Identifizierung wirksamer Kombinationstherapien und Mechanismen der Arzneimittelresistenz sowie Verkürzung des Zeitrahmens für die Entwicklung neuer Therapien.
• Entwicklung rechnerischer Ansätze zur Gewinnung und Integration von Daten und Entwicklung innovativer Softwaretools für den Datenaustausch.

Projektu kopīgi vada Charles W. M. Roberts, MD, PhD, St. Jude Comprehensive Cancer Center direktore, Kimberly Stegmaier, MD, Dana-Farber Cancer Institute, bērnu onkoloģijas pētījumu vicepriekšsēdētāja, un Francisca Vazquez, PhD, Broad Institute Cancer, atkarības kartes projekta direktore.

Neskatoties uz daudzajiem sasniegumiem, vēzis joprojām ir galvenais ar slimībām saistītās nāves cēlonis bērnu vidū Amerikas Savienotajās Valstīs. Pētniecības laboratorijā var paiet gadu desmitiem, lai izprastu mehānismus un izstrādātu jaunas ārstēšanas metodes. Mēs uzskatām, ka ar šī projekta palīdzību mēs tagad varam pārvarēt šķēršļus, lai ātri identificētu bērnu vēža terapeitiskās ievainojamības un daudz ātrāk pārvērstu tās mērķtiecīgās terapijās klīnikā.

Čārlzs WM Roberts, MD, PhD, Sentdjūdas Visaptverošais vēža centrs

"Mūsu pirmais bērnu vēža atkarības kartes projekts bija ārkārtīgi veiksmīgs, taču tas ir tikai aisberga redzamā daļa," sacīja Stegmaiers. "Esmu ļoti gandarīts par šo bezprecedenta sadarbību starp trim izcilām iestādēm. PedDep Accelerator atklās jaunus un ļoti nepieciešamos jaunus terapeitiskos mērķus, vienlaikus atklājot dažādu bērnu vēža veidu mehānisko pamatu, nodrošinot mums daudz datu." Pētnieku kopiena."

"PedDep Accelerator ir piemērs dziļas sadarbības spēkam un daudznozaru komandas apvienošanai dažādās iestādēs, lai risinātu svarīgu slimību problēmu, kas skar bērnus visā pasaulē," sacīja Vazquez. "Apmainoties ar datiem un izstrādājot rīkus, mūsu mērķis ir izveidot resursu, ko zinātnieku kopiena var izmantot, lai reāli ietekmētu bērnu vēzi. Es priecājos redzēt, kāda būs šī projekta ietekme uz bērnu audzēju terapeitiskās atklāšanas tempu." ”.

Vēzis bērnībā: iespēja jauninājumiem un atklājumiem

Sadarbība balstās uz revolucionārām pētniecības iniciatīvām no katras iestādes. Pēdējo desmit gadu laikā Sv. Džūdas-Vašingtonas universitātes bērnu vēža genoma projekts un citi liela mēroga sekvencēšanas pasākumi ir snieguši visaptverošu ieskatu bērnu vēža genoma ainavā, tostarp apzinoties, ka lielākā daļa slimību izraisošo ģenētisko mutāciju nav ārstējamas ar zālēm. Lai izstrādātu precīzu terapiju, ir jānosaka vēža atkarības un ievainojamības, kuras nevar atklāt, analizējot tikai genoma datu kopas.

Broads Cancer Dependency Map (DepMap) iniciatīva ir izstrādājusi liela mēroga, pasaules līmeņa datu kopas un skaitļošanas infrastruktūru, kas ir ietekmējusi pētniecību un mērķa atklāšanas programmas visā pasaulē. 2015. gadā uzsāktais bērnu vēža atkarības kartes projekts (PedDep) kalpoja kā koncepcijas pierādījums DepMap pieejas izmantošanai bērnu vēža ārstēšanā. Piemēram, visa genoma CRISPR ekrāni tagad ir veiksmīgi izmantoti plašā mērogā, lai identificētu ievainojamības simtiem pieaugušo vēža gadījumu, un ir pierādīts, ka šīs pieejas var identificēt arī bērnu vēža ievainojamības, kurām bieži ir daudz vienkāršāki genomi. Ir izstrādātas arī liela mēroga narkotiku skrīninga iespējas. Pateicoties šiem centieniem, šī infrastruktūra un zināšanas tiks izmantotas un paplašinātas.

Projektā tiks izmantotas St. Jude un Dana-Farber modelēšanas zināšanas, veidojot no pacienta atvasinātus ksenotransplantāta (PDX) modeļus, kuros tiek izmantotas pacienta vēža šūnas, lai labāk atbilstu slimības bioloģijai, kāda tā notiek klīnikā. St. Jude's skaitļošanas biologi sniegs plašas zināšanas epigenomiskā un genoma raksturojuma analīzē, datu vizualizācijā un skaitļošanas cauruļvadu izstrādē. Turklāt St. Jude infrastruktūra atvieglos kombinēto narkotiku skrīningu un in vivo CRISPR un narkotiku skrīninga pieejas.

Starpfunkcionālajās grupās būs pētnieki no Broad, Dana-Farber un St. Jude, kas koncentrēsies uz trim galvenajām slimību jomām (smadzeņu audzējiem, hematoloģiskiem ļaundabīgiem audzējiem un cietajiem audzējiem) un apvienos vēža zināšanas datu zinātnē, funkcionālajā genomikā un liela mēroga vēža jomā. visaptveroša narkotiku pārbaude. Kopā šo iestāžu pētnieki uzlabos un paātrinās progresu, apvienojot unikālas stiprās puses un resursus, lai risinātu lielākās problēmas bērnu vēža izpratnē un ārstēšanā.

Avots:

Sv. Jūdas Bērnu pētniecības slimnīca

.