Største akademiske samarbeid tar sikte på å transformere behandlingen av barnekreft

Største akademiske samarbeid tar sikte på å transformere behandlingen av barnekreft

Broad Institute of MIT og Harvard, Dana-Farber Cancer Institute og St. Jude Children's Research Hospital kunngjorde i dag det største akademiske samarbeidet i sitt slag for å transformere og akselerere identifiseringen av sårbarheter i barnekreft og omsette dem til bedre behandlinger.

Samarbeidet støttes av en ny felles finansieringsinvestering fra alle tre institusjonene på mer enn 60 millioner dollar over fem år. Denne investeringen vil støtte utviklingen av infrastruktur og det vitenskapelige arbeidet til et team som i dag består av mer enn 80 samarbeidende forskere, datavitere og forskningsansatte. Initiativet forventes å nå 100 medlemmer etter hvert som hver institusjon legger til nye ansatte.

Ved å kombinere det intellektuelle lederskapet, den tekniske ekspertisen og de institusjonelle ressursene til de tre institusjonene, tar dette nye samarbeidet sikte på å adressere kritiske kunnskapshull knyttet til det biologiske grunnlaget for barnekreft og hvordan det kan behandles mer effektivt. Pediatric Cancer Dependencies Accelerator-prosjektet, kjennetegnet ved sin store investeringsskala, antall samarbeidende forskere og vitenskapelig omfang, vil akselerere fremgangen i utviklingen av nye behandlinger for aggressive barnekreftformer ved:

• Entwicklung und Einsatz von Genom-Editierungstechniken zur Identifizierung versteckter Schwachstellen (Abhängigkeiten) bei einer Reihe von hochriskanten Gehirn-, soliden und Blutkrebserkrankungen im Kindesalter.
• Nutzung neuer Technologien zur Charakterisierung der genetischen und epigenetischen Landschaft von Krebserkrankungen bei Kindern.
• Entwicklung von Modellsystemen für Hochrisiko-Krebserkrankungen im Kindesalter mit schlechtem Ausgang, wo es derzeit keine gibt.
• Identifizierung wirksamer Kombinationstherapien und Mechanismen der Arzneimittelresistenz sowie Verkürzung des Zeitrahmens für die Entwicklung neuer Therapien.
• Entwicklung rechnerischer Ansätze zur Gewinnung und Integration von Daten und Entwicklung innovativer Softwaretools für den Datenaustausch.

Prosjektet ledes av Charles W. M. Roberts, MD, PhD, direktør for St. Jude Comprehensive Cancer Center, Kimberly Stegmaier, MD, Dana-Farber Cancer Institute, nestleder for pediatrisk onkologisk forskning, og Francisca Vazquez, PhD, Broad Institute Cancer, direktør for avhengighetskartprosjektet.

Til tross for mange fremskritt er kreft fortsatt den ledende årsaken til sykdomsrelatert død blant barn i USA. I et forskningslaboratorium kan det ta flere tiår å forstå mekanismer og utvikle nye behandlinger. Vi tror at vi gjennom dette prosjektet nå kan overvinne hindringer for raskt å identifisere terapeutiske sårbarheter i barnekreft og oversette disse til målrettede terapier i klinikken mye raskere."

Charles WM Roberts, MD, PhD, St. Jude Comprehensive Cancer Center

"Vårt første kartprosjekt for barndomskreftavhengighet var ekstremt vellykket, men bare toppen av isfjellet," sa Stegmaier. "Jeg er veldig glad for dette enestående samarbeidet mellom tre eksepsjonelle institusjoner. PedDep Accelerator vil avdekke nye og sårt tiltrengte nye terapeutiske mål samtidig som den avdekker det mekanistiske grunnlaget for en rekke barnekreftformer, og gir oss et vell av data." Forskningsmiljø.»

"PedDep Accelerator er et eksempel på kraften i dypt samarbeid og samler et tverrfaglig team på tvers av institusjoner for å møte en viktig sykdomsutfordring som påvirker barn over hele verden," sa Vazquez. "Ved å dele data og utvikle verktøy, tar vi sikte på å skape en ressurs som det vitenskapelige samfunnet kan bruke til å gjøre en reell innvirkning på kreft i barndommen. Jeg er spent på å se hvilken innvirkning dette prosjektet vil ha på tempoet i terapeutisk oppdagelse for pediatriske svulster." ."

Childhood Cancer: En mulighet for innovasjon og oppdagelse

Samarbeidet bygger på banebrytende forskningsinitiativ fra hver institusjon. I løpet av det siste tiåret har Pediatric Cancer Genome Project ved St. Jude-Washington University og andre storstilte sekvenseringstiltak gitt omfattende innsikt i det genomiske landskapet til barnekreft, inkludert erkjennelsen av at de fleste sykdomsfremkallende genetiske mutasjoner ikke kan behandles med medisiner. Å utvikle presise terapier krever å identifisere kreftavhengigheter og sårbarheter som ikke kan avdekkes ved å analysere genomiske datasett alene.

Broads Cancer Dependency Map-initiativ (DepMap) har utviklet store datasett i verdensklasse og datainfrastruktur som har påvirket forskning og måloppdagelsesprogrammer over hele verden. Pediatric Cancer Dependency Map Project (PedDep), som ble lansert i 2015, fungerte som et proof-of-concept for anvendelsen av DepMap-tilnærmingen til barnekreft. For eksempel har helgenom CRISPR-skjermer nå blitt brukt med suksess i stor skala for å identifisere sårbarheter i hundrevis av voksne kreftformer, og prinsippbevis har blitt vist at disse tilnærmingene også kan identifisere sårbarheter i barnekreft, som ofte har mye enklere genomer. Det er også utviklet muligheter for storskala narkotikascreening. Denne infrastrukturen og ekspertisen vil bli utnyttet og utvidet gjennom denne innsatsen.

Prosjektet vil trekke på St. Jude og Dana-Farbers modelleringsekspertise i å lage pasientavledede xenograft (PDX)-modeller som bruker pasientkreftceller for å bedre matche biologien til sykdommen slik den oppstår i klinikken. St. Jude's beregningsbiologer vil bringe bred ekspertise innen epigenomisk og genomisk karakteriseringsanalyse, datavisualisering og beregningsmessig pipelineutvikling. I tillegg vil St. Judes infrastruktur tilrettelegge for kombinert medikamentscreening og in vivo CRISPR og narkotikascreening.

De tverrfunksjonelle gruppene vil inkludere forskere fra Broad, Dana-Farber og St. Jude som vil fokusere på tre kjernesykdomsområder (hjernetumorer, hematologiske maligniteter og solide svulster) og vil bringe kombinert kreftekspertise innen datavitenskap, funksjonell genomikk og storskala kreft. omfattende legemiddelscreening. Sammen vil forskere ved disse institusjonene forbedre og akselerere fremgang ved å kombinere unike styrker og ressurser for å møte de største utfordringene i å forstå og behandle barnekreft.

Kilde:

St. Jude barneforskningssykehus

.