Największa współpraca akademicka ma na celu zmianę sposobu leczenia nowotworów u dzieci

Największa współpraca akademicka ma na celu zmianę sposobu leczenia nowotworów u dzieci

Broad Institute of MIT i Harvard, Dana-Farber Cancer Institute i St. Jude Children's Research Hospital ogłosiły dziś największą w swoim rodzaju współpracę akademicką mającą na celu przekształcenie i przyspieszenie identyfikacji słabych punktów nowotworów u dzieci oraz przełożenie ich na lepsze metody leczenia.

Współpraca jest wspierana przez nową wspólną inwestycję w finansowanie wszystkich trzech instytucji o wartości ponad 60 milionów dolarów w ciągu pięciu lat. Inwestycja ta wesprze rozwój infrastruktury i pracę naukową zespołu, który obecnie składa się z ponad 80 współpracujących badaczy, analityków danych i kadry badawczej. Oczekuje się, że inicjatywa dotrze do 100 członków w miarę dodawania przez każdą instytucję nowego personelu.

Łącząc intelektualne przywództwo, wiedzę techniczną i zasoby instytucjonalne trzech instytucji, ta nowa współpraca ma na celu uzupełnienie kluczowych luk w wiedzy związanych z biologicznymi podstawami nowotworów u dzieci i sposobami ich skuteczniejszego leczenia. Projekt Akcelerator Zależności od Nowotworów Dzieci, wyróżniający się dużą skalą inwestycji, liczbą współpracujących naukowców i zakresem naukowym, przyspieszy postęp w opracowywaniu nowych metod leczenia agresywnych nowotworów wieku dziecięcego poprzez:

• Entwicklung und Einsatz von Genom-Editierungstechniken zur Identifizierung versteckter Schwachstellen (Abhängigkeiten) bei einer Reihe von hochriskanten Gehirn-, soliden und Blutkrebserkrankungen im Kindesalter.
• Nutzung neuer Technologien zur Charakterisierung der genetischen und epigenetischen Landschaft von Krebserkrankungen bei Kindern.
• Entwicklung von Modellsystemen für Hochrisiko-Krebserkrankungen im Kindesalter mit schlechtem Ausgang, wo es derzeit keine gibt.
• Identifizierung wirksamer Kombinationstherapien und Mechanismen der Arzneimittelresistenz sowie Verkürzung des Zeitrahmens für die Entwicklung neuer Therapien.
• Entwicklung rechnerischer Ansätze zur Gewinnung und Integration von Daten und Entwicklung innovativer Softwaretools für den Datenaustausch.

Projektem współkierują dr Charles W. M. Roberts, dyrektor St. Jude Comprehensive Cancer Center, dr Kimberly Stegmaier z Dana-Farber Cancer Institute, wiceprzewodnicząca ds. badań onkologii dziecięcej oraz dr Francisca Vazquez z Broad Institute Cancer, dyrektor projektu mapy zależności.

Pomimo wielu postępów nowotwory pozostają główną przyczyną zgonów związanych z chorobami wśród dzieci w Stanach Zjednoczonych. W laboratorium badawczym zrozumienie mechanizmów i opracowanie nowych metod leczenia może zająć dziesięciolecia. Wierzymy, że dzięki temu projektowi możemy teraz pokonać przeszkody, aby szybko zidentyfikować słabe punkty terapeutyczne nowotworów u dzieci i znacznie szybciej przełożyć je na terapie celowane w praktyce klinicznej”.

Charles WM Roberts, lekarz medycyny, doktor nauk medycznych, Kompleksowe Centrum Onkologii St. Jude

„Nasz pierwszy projekt mapy uzależnienia od nowotworów u dzieci był niezwykle udany, ale stanowił jedynie wierzchołek góry lodowej” – powiedział Stegmaier. „Jestem bardzo zadowolony z tej bezprecedensowej współpracy pomiędzy trzema wyjątkowymi instytucjami. Akcelerator PedDep odkryje nowatorskie i bardzo potrzebne nowe cele terapeutyczne, odkrywając jednocześnie mechanistyczne podstawy różnych nowotworów u dzieci, dostarczając nam bogactwa danych”. Społeczność naukowa.”

„Akcelerator PedDep to przykład potęgi głębokiej współpracy i gromadzenia multidyscyplinarnego zespołu w różnych instytucjach, aby stawić czoła ważnemu wyzwaniu chorobowemu dotykającemu dzieci na całym świecie” – powiedział Vazquez. „Udostępniając dane i opracowując narzędzia, naszym celem jest stworzenie zasobu, który społeczność naukowa będzie mogła wykorzystać, aby wywrzeć realny wpływ na nowotwory u dzieci. Nie mogę się doczekać, jaki wpływ będzie miał ten projekt na tempo odkryć terapeutycznych nowotworów u dzieci”. .”

Rak u dzieci: szansa na innowacje i odkrycia

Współpraca opiera się na przełomowych inicjatywach badawczych każdej instytucji. W ciągu ostatniej dekady projekt Pediatric Cancer Genome Project na Uniwersytecie St. Jude-Washington i inne działania mające na celu sekwencjonowanie na dużą skalę zapewniły kompleksowy wgląd w krajobraz genomiczny nowotworów u dzieci, w tym uświadomienie sobie, że większości chorobotwórczych mutacji genetycznych nie można leczyć za pomocą leków. Opracowanie precyzyjnych terapii wymaga zidentyfikowania zależności nowotworowych i słabych punktów, których nie można odkryć na podstawie samej analizy zbiorów danych genomowych.

W ramach inicjatywy Broad Cancer Depency Map (DepMap) opracowano wielkoskalowe, światowej klasy zbiory danych i infrastrukturę obliczeniową, które wywarły wpływ na programy badawcze i odkrywanie celów na całym świecie. Projekt mapy zależności od nowotworów u dzieci (PedDep), rozpoczęty w 2015 r., posłużył jako dowód słuszności koncepcji zastosowania podejścia DepMap do nowotworów u dzieci. Na przykład badania przesiewowe CRISPR całego genomu są obecnie z powodzeniem stosowane na dużą skalę do identyfikowania słabych punktów w setkach nowotworów u dorosłych i wykazano, że podejścia te mogą również identyfikować słabe punkty w przypadku nowotworów dziecięcych, które często mają znacznie prostsze genomy. Opracowano także możliwości w zakresie badań przesiewowych narkotyków na dużą skalę. Dzięki tym wysiłkom infrastruktura i wiedza specjalistyczna zostaną wykorzystane i poszerzone.

W projekcie wykorzystana zostanie wiedza St. Jude i Dana-Farber w zakresie modelowania w zakresie tworzenia modeli ksenoprzeszczepów pochodzących od pacjenta (PDX), w których wykorzystywane są komórki nowotworowe pacjenta, aby lepiej dopasować biologię choroby występującej w klinice. Biolodzy obliczeniowi z St. Jude wniosą szeroką wiedzę specjalistyczną w zakresie analizy charakterystyki epigenomicznej i genomicznej, wizualizacji danych i opracowywania potoków obliczeniowych. Ponadto infrastruktura St. Jude ułatwi łączone badania przesiewowe narkotyków oraz podejście CRISPR i badania przesiewowe narkotyków in vivo.

W skład grup przekrojowych wejdą badacze z Broad, Dana-Farber i St. Jude, którzy skoncentrują się na trzech głównych obszarach chorobowych (guzy mózgu, nowotwory hematologiczne i guzy lite) i wniosą połączoną wiedzę specjalistyczną w zakresie nowotworów w zakresie analityki danych, genomiki funkcjonalnej i nowotworów na dużą skalę. kompleksowe badanie leków. Wspólnie naukowcy z tych instytucji poprawią i przyspieszą postęp, łącząc unikalne mocne strony i zasoby, aby sprostać największym wyzwaniom w zrozumieniu i leczeniu nowotworów u dzieci.

Źródło:

Szpital Badawczy Dziecięcy św. Judy

.