Največje akademsko sodelovanje je namenjeno preoblikovanju zdravljenja raka pri otrocih

Največje akademsko sodelovanje je namenjeno preoblikovanju zdravljenja raka pri otrocih

Broad Institute MIT in Harvard, Dana-Farber Cancer Institute in otroška raziskovalna bolnišnica St. Jude so danes objavili največje akademsko sodelovanje te vrste za preoblikovanje in pospešitev prepoznavanja ranljivosti pri raku pri otrocih ter njihovo pretvorbo v boljše zdravljenje.

Sodelovanje je podprto z novo skupno naložbo vseh treh institucij v višini več kot 60 milijonov dolarjev v petih letih. Ta naložba bo podprla razvoj infrastrukture in znanstveno delo ekipe, ki jo trenutno sestavlja več kot 80 sodelujočih raziskovalcev, podatkovnih znanstvenikov in raziskovalnega osebja. Pobuda naj bi dosegla 100 članov, saj vsaka institucija dodaja novo osebje.

Z združevanjem intelektualnega vodstva, tehničnega strokovnega znanja in institucionalnih virov treh institucij je cilj tega novega sodelovanja odpraviti kritične vrzeli v znanju, povezane z biološko osnovo raka pri otrocih in kako bi ga bilo mogoče učinkoviteje zdraviti. Projekt Pediatric Cancer Dependencies Accelerator, ki se odlikuje po velikem obsegu naložb, številu sodelujočih znanstvenikov in znanstvenem obsegu, bo pospešil napredek pri razvoju novih zdravljenj agresivnega raka pri otrocih z:

• Entwicklung und Einsatz von Genom-Editierungstechniken zur Identifizierung versteckter Schwachstellen (Abhängigkeiten) bei einer Reihe von hochriskanten Gehirn-, soliden und Blutkrebserkrankungen im Kindesalter.
• Nutzung neuer Technologien zur Charakterisierung der genetischen und epigenetischen Landschaft von Krebserkrankungen bei Kindern.
• Entwicklung von Modellsystemen für Hochrisiko-Krebserkrankungen im Kindesalter mit schlechtem Ausgang, wo es derzeit keine gibt.
• Identifizierung wirksamer Kombinationstherapien und Mechanismen der Arzneimittelresistenz sowie Verkürzung des Zeitrahmens für die Entwicklung neuer Therapien.
• Entwicklung rechnerischer Ansätze zur Gewinnung und Integration von Daten und Entwicklung innovativer Softwaretools für den Datenaustausch.

Projekt sovodijo Charles W. M. Roberts, MD, PhD, direktor St. Jude Comprehensive Cancer Center, Kimberly Stegmaier, MD, Dana-Farber Cancer Institute, podpredsednica pediatrične onkološke raziskave, in Francisca Vazquez, PhD, Broad Institute Cancer, direktorica projekta Map odvisnosti.

Kljub številnim napredkom ostaja rak glavni vzrok smrti zaradi bolezni med otroki v Združenih državah. V raziskovalnem laboratoriju lahko traja desetletja, da razumemo mehanizme in razvijemo nova zdravljenja. Verjamemo, da lahko s tem projektom zdaj premagamo ovire za hitro odkrivanje terapevtskih ranljivosti pri otroškem raku in jih veliko hitreje prenesemo v ciljne terapije na kliniki.«

Charles WM Roberts, MD, PhD, St. Jude Comprehensive Cancer Center

»Naš prvi projekt zemljevida odvisnosti od raka pri otrocih je bil izjemno uspešen, a le vrh ledene gore,« je dejal Stegmaier. "Zelo sem vesel tega sodelovanja brez primere med tremi izjemnimi ustanovami. PedDep Accelerator bo odkril nove in prepotrebne nove terapevtske tarče, obenem pa odkril mehanistično osnovo različnih otroških rakov, kar nam bo zagotovilo ogromno podatkov." Raziskovalna skupnost."

"PedDep Accelerator je primer moči poglobljenega sodelovanja in združevanja multidisciplinarne ekipe v institucijah za reševanje pomembnega izziva bolezni, ki prizadene otroke po vsem svetu," je dejal Vazquez. "Z izmenjavo podatkov in razvojem orodij želimo ustvariti vir, ki ga lahko znanstvena skupnost uporabi za dejanski vpliv na raka pri otrocih. Navdušen sem, da vidim, kakšen vpliv bo imel ta projekt na hitrost terapevtskega odkrivanja pediatričnih tumorjev." .”

Rak v otroštvu: priložnost za inovacije in odkritja

Sodelovanje temelji na prelomnih raziskovalnih pobudah vsake institucije. V zadnjem desetletju so Pediatric Cancer Genome Project na univerzi St. Jude-Washington in druga obsežna prizadevanja za določanje zaporedja zagotovila celovit vpogled v genomsko pokrajino otroških rakov, vključno s spoznanjem, da večine genetskih mutacij, ki povzročajo bolezni, ni mogoče zdraviti z zdravili. Razvijanje natančnih terapij zahteva prepoznavanje odvisnosti od raka in ranljivosti, ki jih ni mogoče odkriti samo z analizo genomskih podatkovnih nizov.

Broadova pobuda Cancer Dependency Map (DepMap) je razvila obsežne nabore podatkov svetovnega razreda in računalniško infrastrukturo, ki je vplivala na raziskave in programe odkrivanja ciljev po vsem svetu. Projekt Pediatric Cancer Dependency Map Project (PedDep), ki se je začel leta 2015, je služil kot dokaz koncepta za uporabo pristopa DepMap pri raku pri otrocih. Na primer, zasloni CRISPR celotnega genoma so bili zdaj uspešno uporabljeni v velikem obsegu za prepoznavanje ranljivosti pri stotinah rakavih obolenj pri odraslih in dokazano je bilo, da lahko ti pristopi prepoznajo ranljivosti tudi pri raku v otroštvu, ki ima pogosto veliko enostavnejše genome. Razvite so bile tudi obsežne zmogljivosti presejanja zdravil. Ta infrastruktura in strokovno znanje bosta s temi prizadevanji izkoriščena in razširjena.

Projekt bo temeljil na strokovnem znanju modelov St. Jude in Dana-Farber pri ustvarjanju modelov ksenotransplantatov (PDX), ki izhajajo iz pacientov, ki uporabljajo rakave celice pacientov za boljše ujemanje z biologijo bolezni, ko se pojavi na kliniki. Računalniški biologi St. Jude bodo prinesli obsežno strokovno znanje na področju epigenomske in genomske karakterizacijske analize, vizualizacije podatkov in razvoja računalniškega cevovoda. Poleg tega bo infrastruktura St. Jude olajšala kombinirano presejanje zdravil ter pristope in vivo CRISPR in presejalne preglede zdravil.

Medfunkcionalne skupine bodo vključevale raziskovalce iz Broada, Dana-Farberja in St. Judea, ki se bodo osredotočali na tri glavna področja bolezni (možganski tumorji, hematološke malignosti in solidni tumorji) in bodo prinesli kombinirano strokovno znanje o raku na področju podatkovne znanosti, funkcionalne genomike in obsežnih rakov. celovit pregled zdravil. Raziskovalci v teh institucijah bodo skupaj izboljšali in pospešili napredek z združevanjem edinstvenih prednosti in virov za reševanje največjih izzivov pri razumevanju in zdravljenju raka pri otrocih.

Vir:

Otroška raziskovalna bolnišnica St. Jude

.