Största akademiska samarbetet syftar till att förändra behandlingen av barncancer

Största akademiska samarbetet syftar till att förändra behandlingen av barncancer

Broad Institute of MIT och Harvard, Dana-Farber Cancer Institute och St. Jude Children's Research Hospital tillkännagav idag det största akademiska samarbetet i sitt slag för att transformera och påskynda identifieringen av sårbarheter i barncancer och översätta dem till bättre behandlingar.

Samarbetet stöds av en ny gemensam finansieringsinvestering från alla tre institutioner på mer än 60 miljoner dollar under fem år. Denna investering kommer att stödja utvecklingen av infrastruktur och det vetenskapliga arbetet i ett team som för närvarande består av mer än 80 samarbetande forskare, datavetare och forskarpersonal. Initiativet förväntas nå 100 medlemmar när varje institution tillför ny personal.

Genom att kombinera de tre institutionernas intellektuella ledarskap, tekniska expertis och institutionella resurser, syftar detta nya samarbete till att ta itu med kritiska kunskapsluckor relaterade till den biologiska grunden för barncancer och hur den kan behandlas mer effektivt. Pediatric Cancer Dependencies Accelerator-projektet, som kännetecknas av sin stora investeringsskala, antalet samarbetande forskare och vetenskapliga omfattning, kommer att påskynda framstegen i utvecklingen av nya behandlingar för aggressiva barncancer genom:

• Entwicklung und Einsatz von Genom-Editierungstechniken zur Identifizierung versteckter Schwachstellen (Abhängigkeiten) bei einer Reihe von hochriskanten Gehirn-, soliden und Blutkrebserkrankungen im Kindesalter.
• Nutzung neuer Technologien zur Charakterisierung der genetischen und epigenetischen Landschaft von Krebserkrankungen bei Kindern.
• Entwicklung von Modellsystemen für Hochrisiko-Krebserkrankungen im Kindesalter mit schlechtem Ausgang, wo es derzeit keine gibt.
• Identifizierung wirksamer Kombinationstherapien und Mechanismen der Arzneimittelresistenz sowie Verkürzung des Zeitrahmens für die Entwicklung neuer Therapien.
• Entwicklung rechnerischer Ansätze zur Gewinnung und Integration von Daten und Entwicklung innovativer Softwaretools für den Datenaustausch.

Projektet leds av Charles W. M. Roberts, MD, PhD, chef för St. Jude Comprehensive Cancer Center, Kimberly Stegmaier, MD, Dana-Farber Cancer Institute, vice ordförande för pediatrisk onkologisk forskning, och Francisca Vazquez, PhD, Broad Institute Cancer, chef för dependency Map-projektet.

Trots många framsteg är cancer fortfarande den vanligaste orsaken till sjukdomsrelaterad död bland barn i USA. I ett forskningslaboratorium kan det ta decennier att förstå mekanismer och utveckla nya behandlingar. Vi tror att vi genom detta projekt nu kan övervinna hinder för att snabbt identifiera terapeutiska sårbarheter i barncancer och översätta dessa till riktade terapier på kliniken mycket snabbare.”

Charles WM Roberts, MD, PhD, St. Jude Comprehensive Cancer Center

"Vårt första kartprojekt för barncancerberoende var extremt framgångsrikt, men bara toppen av isberget," sa Stegmaier. "Jag är mycket glad över detta oöverträffade samarbete mellan tre exceptionella institutioner. PedDep Accelerator kommer att avslöja nya och välbehövliga nya terapeutiska mål samtidigt som den avslöjar den mekanistiska grunden för en mängd olika barncancerformer, vilket ger oss en mängd data." Forskargemenskap."

"PedDep Accelerator är ett exempel på kraften i djupt samarbete och att sammanföra ett multidisciplinärt team över institutioner för att ta itu med en viktig sjukdomsutmaning som påverkar barn över hela världen", säger Vazquez. "Genom att dela data och utveckla verktyg siktar vi på att skapa en resurs som det vetenskapliga samfundet kan använda för att göra en verklig inverkan på barncancer. Jag är spännande att se vilken inverkan detta projekt kommer att ha på takten i terapeutisk upptäckt för pediatriska tumörer." .”

Barncancer: En möjlighet till innovation och upptäckt

Samarbetet bygger på banbrytande forskningsinitiativ från varje institution. Under det senaste decenniet har Pediatric Cancer Genome Project vid St. Jude-Washington University och andra storskaliga sekvenseringsinsatser gett omfattande insikter i det genomiska landskapet för barncancer, inklusive insikten att de flesta sjukdomsorsakande genetiska mutationer inte kan behandlas med läkemedel. Att utveckla exakta terapier kräver att man identifierar cancerberoenden och sårbarheter som inte kan avslöjas genom att analysera genomiska datauppsättningar enbart.

Broads initiativ för Cancer Dependency Map (DepMap) har utvecklat storskaliga datauppsättningar i världsklass och datorinfrastruktur som har påverkat forskning och målupptäcktsprogram över hela världen. Pediatric Cancer Dependency Map Project (PedDep), som lanserades 2015, fungerade som ett proof-of-concept för tillämpningen av DepMap-metoden på barncancer. Till exempel har helgenom CRISPR-skärmar nu använts framgångsrikt i stor skala för att identifiera sårbarheter i hundratals vuxna cancerformer, och principbevis har visats att dessa tillvägagångssätt också kan identifiera sårbarheter i barncancer, som ofta har mycket enklare genom. Storskaliga läkemedelsscreeningsmöjligheter har också utvecklats. Denna infrastruktur och expertis kommer att utnyttjas och utökas genom dessa ansträngningar.

Projektet kommer att dra nytta av St. Jude och Dana-Farbers modelleringsexpertis i att skapa patient-derived xenograft (PDX) modeller som använder patientens cancerceller för att bättre matcha sjukdomens biologi när den uppstår på kliniken. St. Judes beräkningsbiologer kommer att tillföra bred expertis inom epigenomisk och genomisk karakteriseringsanalys, datavisualisering och utveckling av beräkningspipeline. Dessutom kommer St. Judes infrastruktur att underlätta kombinerad läkemedelsscreening och in vivo CRISPR och läkemedelsscreeningsmetoder.

De tvärfunktionella grupperna kommer att inkludera forskare från Broad, Dana-Farber och St. Jude som kommer att fokusera på tre kärnsjukdomsområden (hjärntumörer, hematologiska maligniteter och solida tumörer) och kommer att tillföra kombinerad cancerexpertis inom datavetenskap, funktionell genomik och storskaliga cancerformer. omfattande läkemedelsscreening. Tillsammans kommer forskare vid dessa institutioner att förbättra och påskynda framstegen genom att kombinera unika styrkor och resurser för att ta itu med de största utmaningarna i att förstå och behandla barncancer.

Källa:

St. Jude Children's Research Hospital

.