人工智能自动进行姐妹染色单体交换计数,改善布卢姆综合征的诊断

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东京都立大学的研究人员开发了一系列算法,可以在显微镜下自动计数染色体中的姐妹染色单体交换(SCE)。常规分析需要经过培训的人员和时间,具体情况因人而异。该团队基于机器学习的算法准确率高达 84%...

人工智能自动进行姐妹染色单体交换计数,改善布卢姆综合征的诊断

东京都立大学的研究人员开发了一系列算法,可以在显微镜下自动计数染色体中的姐妹染色单体交换(SCE)。常规分析需要经过培训的人员和时间,具体情况因人而异。该团队基于机器学习的算法具有 84% 的准确率,并提供了更客观的测量。这对于诊断与 SCE 数量异常相关的疾病(例如布卢姆综合征)至关重要。

DNA 是所有生物体的生命蓝图,被包装在称为染色体的复杂结构中。当 DNA 复制时,会产生两条相同的链,称为姐妹染色单体,每条链都携带完全相同的遗传信息。与减数分裂不同,姐妹染色单体在有丝分裂期间不必经历重组,并且在大多数情况下完整地转移到子细胞中。然而,如果 DNA 发生损伤,生物体会尝试使用剩余的未损伤 DNA 作为模板来修复损伤。在这个修复过程中,经常会发生姐妹染色单体的某些部分相互交换的情况。在这个修复过程中,经常会发生姐妹染色单体的某些部分相互交换的情况。这种“姐妹色交换”(SCE)本身并无害处,但过多可能是某些严重疾病的良好指标。布卢姆综合症就是这样的例子:受影响的人可能有患癌症的倾向。

为了计算 SCE,在正常方法中,经验丰富的临床医生在显微镜下检查染色染色体,并尝试识别姐妹染色单体的“交换”片段。这不仅是劳动密集型且缓慢的,而且还可能是主观的并且取决于人眼如何感知特征。显微镜图像的全自动分析将节省时间并提供 SCE 数量的客观测量,以便在不同的临床环境中实现更一致的诊断。

现在,由东京都立大学 Kiyoshi Nishikawa 和 Kan Okubo 教授领导的团队开发了一套使用机器学习来计算图像中 SCE 的算法。他们结合了不同的方法:一种方法用于识别单个染色体,另一种方法用于确定 SCE 是否存在,最后另一种方法用于对这些染色体进行分组和计数,从而对显微镜图像中的 SCE 数量进行客观、全自动的测量。他们确定准确度为 84.1%,这个值足以满足实际应用。为了了解它如何处理真实数据,他们从人工敲除的细胞中收集了染色体图像黑土LM基因,布卢姆综合征患者中观察到的抑制类型。该团队的算法能够产生与人类计数器相匹配的 SCE 计数。

目前正在进行利用大量可用临床数据来训练算法的工作,并将进一步完善。该团队相信,用完全自动化取代手动计数将有助于实现比以往更快、更客观的临床分析,而这只是人工智能为医学研究做的事情的开始。

这项工作得到了 JSPS KAKENHI 拨款号 22H05072、25K09513 和 22K12170 的支持。


资料来源:

Journal reference:

寺冈,M.,等人。(2025)。使用机器学习模型和图像分析算法自动检测姐妹染色单体交换。科学报告。DOI:10.1038/s41598-025-22608-9。 https://www.nature.com/articles/s41598-025-22608-9