Flytting av sykehuservervede bakterier fra lungene til tarmen øker risikoen for sepsis

Flytting av sykehuservervede bakterier fra lungene til tarmen øker risikoen for sepsis

En sykehuservervet bakterie som forårsaker alvorlige infeksjoner kan reise fra lungene til tarmene hos samme pasient, noe som øker risikoen for livstruende sepsis, viser ny forskning.

Publisert i dag (25. november) iNaturForskere ved Wellcome Sanger Institute analyserte DNA-data fra sykehuspasienter for å forstå bevegelsen til bakterien.Pseudomonas aeruginosa(P. aeruginosa)innenfor enkeltpersoner.

Forskningen belyser hvordan lungeinfeksjoner kan føre til spredning av en viktig sykdomsfremkallende bakterie mellom flere deler av kroppen, noe som øker risikoen for sepsis hos risikopasienter. Funn fra studien kan informere fremtidige strategier for sykehus for å spore og forhindre sepsisrelaterte dødsfall.

P. aeruginosaer en vanlig bakterie som kan forårsake sykdom hos mennesker, planter og dyr. Det er en ledende årsak til sykehuservervede infeksjoner og kan føre til tilstander som lungebetennelse, ørebetennelse, urinveisinfeksjoner og sårinfeksjoner.

Bakterien er også kjent for å være en årsak til sepsis. Sepsis oppstår når kroppen ikke reagerer riktig på en infeksjon. Infeksjonsbekjempende prosessen begynner å angripe kroppen, noe som får noen organer til å svikte. Det er en livstruende tilstand, og det er 48 000 sepsisrelaterte dødsfall i Storbritannia hvert år og fem dødsfall skjer hver time.

En tidligere studie har allerede vist detteP. aeruginosahar gått fra tarmene til lungene til en enkelt intensivpasient, og avslører dens evne til å bevege seg og kolonisere andre deler av kroppen. Hvor ofte dette skjer og i hvilken retning bakteriene sprer seg er imidlertid fortsatt uklart.

I en ny studie analyserte forskere ved Sanger Institute metagenomiske sekvenseringsdata fra 256 sykehusinnlagte pasienter i Italia. De brukte disse dataene for å forstå hvorP. aeruginosabegynner å kolonisere og i hvilken retning bakterien beveger seg gjennom kroppen.

Av de 84 pasientene hvorP. aeruginosaSelv om genomer kunne gjenopprettes, fant teamet 27 tilfeller der den samme bakterieklonen (celler som er identiske i deres DNA) dukket opp i flere deler av kroppen. Dette indikerer at de fleste av disse infeksjonene ikke ble overført gjentatte ganger i sykehusmiljøet, men snarere ble etablert og kolonisert av en enkelt klon over tid og spredt i pasientens egen kropp. I tillegg,P. aeruginosaInfeksjoner var signifikant hyppigere hos intensivpasienter enn hos pasienter på andre avdelinger.

Ved å lage familietrær avP. aeruginosaTeamet spådde at de fleste stammene som spredte seg hadde sin opprinnelse i lungene. Dette tyder på at infeksjoner mest sannsynlig reiser fra lungene til tarmene, hvorP. aeruginosakan etablere langsiktige koloniseringer. Forskerne foreslår at naturlig svelging av sputum – en blanding av spytt og slim fra lungene – kan inneholde demP. aeruginosakan være en sannsynlig rute for tarmkolonisering. De ble heller ikke funnetP. aeruginosabare i neseprøver, noe som tyder på at det først må være tilstede andre steder i kroppen og nesen fungerer som et overløpssted i stedet for et stabilt kolonisted.

Forskerne fant også vanlige DNA-endringer i gener knyttet til antibiotikaresistens (AMR), uavhengig av hvor bakteriene befinner seg i kroppen. Disse DNA-endringene gjør behandlingen mye vanskeligere.

Til syvende og sist har resultatene betydelig utvidet en liten mengde eksisterende kunnskap om bevegelsen av en farlig insekt i en person. Kolonisering avP. aeruginosai lungene bør derfor betraktes som en risikofaktor for sepsis som starter i tarmen hos pasienter som er spesielt utsatt for denne livstruende sykdommen.

Dr. Lewis Fisher, hovedforfatter ved Wellcome Sanger Institute, sa: "Vi fant ut at de fleste pasienter bar den samme stammen av patogenet."P. aeruginosaFlere prøver viser at når denne bakterien først har etablert seg, har den en tendens til å vedvare i stedet for å bli erstattet av nye infeksjoner. Denne utholdenheten er med på å forklare hvorfor det kan være så vanskelig å utrydde viruset på sykehus.»

Dr. Ron Daniels, grunnlegger og medisinsk sjef for UK Sepsis Trust, sa: "Pseudomonas-infeksjoner er notorisk vanskelige å utrydde og er et stort problem i våre intensivavdelinger, spesielt hos immunkompromitterte pasienter, og er en ledende årsak til sepsis. Denne nye forskningen tjener til å forbedre vår forståelse av denne organismen, som nå og hvor lite kan være bra for våre pasienter i fremtiden. patogener og deres oppførsel."

Vi så også raske genetiske endringer i antibiotikaresistensgener, uavhengig av hvor bakterien ble funnet i kroppen. Dette fremhever hvor rasktP. aeruginosakan tilpasse seg, noe som gjør behandling og kontroll på intensivavdelingen stadig vanskeligere.»

Professor Jukka Corander, medforfatter ved Wellcome Sanger Institute og Universitetet i Oslo

Dr. Josie Bryant, seniorforfatter ved Wellcome Sanger Institute, sa: "Våre funn viser at disse bakterielle infeksjonene ofte sprer seg i pasientens egne kropper, typisk fra lungene til tarmene. Å oppdage denne skjulte bevegelsen er nøkkelen til å forbedre måten sykehus overvåker og forebygger sepsis på hos sårbare pasienter."

Kilder: