Eine Chromosomen-Microarray-Analyse könnte helfen, die Ursache von SIDS oder SUDC bei älteren Kindern zu identifizieren
Ein als chromosomale Microarray-Analyse (CMA) bekannter Gentest könnte helfen, die Ursache des plötzlichen Kindstods (SIDS) oder seines Gegenstücks bei älteren Kindern, bekannt als plötzlicher unerklärlicher Tod in der Kindheit (SUDC), zu identifizieren, findet eine Studie unter der Leitung des Boston Children’s Hospital .
Die Forscher unter der Leitung von Richard Goldstein, MD, Ingrid Holm, MD, MPH, und Catherine Brownstein, MPH, PhD, fordern, CMA bei der Untersuchung von SIDS und SUDC zur Routine zu machen. Sie veröffentlichten ihre Studienergebnisse online am 7. November in der Zeitschrift Advanced Genetics.
„Wir glauben, dass wir genug Informationen haben, um zu sagen, dass CMA eine Überlegung wert ist, wenn ein Kind ohne Erklärung gestorben ist, und es wert ist, weiter untersucht zu werden, um diese Todesfälle besser zu verstehen“, sagt Goldstein, der Roberts Programm über plötzlichen unerwarteten Tod in der Pädiatrie leitet Boston Children’s und war leitender Autor der Studie.
Das Team verwendete CMA, um Proben von 116 verstorbenen Säuglingen und Kleinkindern im Alter von bis zu 28 Monaten zu testen, deren Todesfälle als SIDS oder SUDC klassifiziert wurden. Bei 14 Kindern (12 Prozent) identifizierte CMA Deletionen oder Duplikationen von Segmenten der DNA des Kindes oder kleine DNA-Umlagerungen, die pathogen oder „favorisierend pathogen“ waren.
CMA wird bereits routinemäßig bei Kindern mit Erkrankungen wie Autismus, Entwicklungsverzögerung und mehreren angeborenen Anomalien sowie bei Kindern mit nicht diagnostizierten Erkrankungen eingesetzt.“
Ingrid Holm, Co-Senior-Autorin der Studie
Um ihre Ergebnisse weiter zu validieren, verglichen die Forscher CMA-Ergebnisse bei SIDS/SUDC-Patienten mit denen in Kontrollgruppen von Kindern aus der Gemeinde und zwei Kohorten von Kindern mit einer Autismus-Spektrum-Störung. Bei der Bewertung der Wahrscheinlichkeit potenziell wirkungsvoller chromosomaler Veränderungen bei CMA erzielte die SIDS/SUDC-Gruppe signifikant höhere Werte als die Kontrollgruppe, hatte jedoch ähnliche Werte wie Kinder mit Autismus-Spektrum-Störung (ASD).
Viele der CMA-Ergebnisse hatten keinen offensichtlichen Zusammenhang mit SIDS/SUDC und erfordern weitere Untersuchungen. Beispielsweise hatten zwei Kinder ein nicht diagnostiziertes Klinefelter-Syndrom, bei dem Jungen mit einem zusätzlichen X-Chromosom geboren werden, aber im Allgemeinen eine normale Lebensdauer haben. Mehrere identifizierte chromosomale Deletionen/Duplikationen wurden auch mit neurologischen Entwicklungszuständen in Verbindung gebracht, darunter Krampfanfälle, ASD, Entwicklungsverzögerung und Schizophrenie.
Hinzufügen zum Testarsenal
Genetik & Genomik eBook
Zusammenstellung der Top-Interviews, Artikel und Nachrichten des letzten Jahres. Laden Sie eine kostenlose Kopie herunter
In früheren Arbeiten verwendeten Forscher von Boston Children’s Whole-Exome Sequencing (Sequenzierung der 1 bis 2 Prozent des Genoms, die Proteine kodieren), um Kinder zu bewerten, deren Todesfälle als SIDS oder SUDC klassifiziert wurden. In dieser Studie hatten 11 Prozent der Kinder genetische Varianten (Veränderungen), die wahrscheinlich eine Rolle bei ihrem Tod spielten. Es bleibt abzuwarten, inwieweit CMA zu diesen Ergebnissen beitragen würde und wie viel Überlappung zwischen den Genen besteht, die bei der Exomsequenzierung als verändert befunden wurden, und den Genen, die von DNA-Deletionen/Duplikationen betroffen sind.
Das Team hofft, dass ihre Ergebnisse medizinische Untersucher, die SIDS-Todesfälle untersuchen, ermutigen werden, sie um Hilfe zu bitten.
„Medizinische Untersucher interessieren sich für genetische Untersuchungen, aber ihnen fehlen die Ressourcen, insbesondere wenn es um die Interpretation der Ergebnisse geht“, sagt Goldstein. „Wir versuchen, diesen Ball nach vorne zu bewegen und nützliche Informationen bereitzustellen.“
Zusätzlich zur Exomsequenzierung und chromosomalen Anomalien bei CMA erhielten die Forscher kürzlich ein Stipendium des American SIDS Institute, um komplexere strukturelle Veränderungen in Chromosomen zu untersuchen, die zu SIDS und SUDC beitragen könnten, wobei sie eine fortschrittliche Genomikplattform namens Bionano Saphyr verwenden, um extrem lange Bilder zu machen DNA-Stränge.
„Diese Technik gibt uns die Möglichkeit, strukturelle Variationen zu finden, die zu groß sind, um von der traditionellen DNA-Sequenzierung aufgenommen zu werden, aber zu klein, um sie mit chromosomalen Mikroarrays zu erkennen“, sagt Brownstein, Erstautor der Studie und wissenschaftlicher Direktor des Manton Center for Orphan Disease Research Gene Discovery Core bei Boston Children’s. „Wir können auch Fälle erkennen, in denen ein DNA-Segment an eine andere Stelle auf dem Chromosom „umkippt“.
Langfristig, wenn die Kosten für die DNA-Sequenzierung sinken, wollen die Forscher die Sequenzierung des gesamten Genoms verwenden, um SIDS und SUDC zu untersuchen, einen einzigen Test, der den Bedarf an CMA reduzieren könnte.
Quelle:
Referenz:
Brownstein, CA, et al. (2022) Kopienzahlvariation und strukturelle genomische Befunde in 116 Fällen von plötzlichem ungeklärtem Tod zwischen 1 und 28 Monaten. Fortgeschrittene Genetik. doi.org/10.1002/ggn2.202200012.
.
