Manger une variété de plantes aide les nourrissons à développer un microbiome intestinal plus fort
De nouvelles recherches montrent que les nourrissons qui consomment une plus grande variété d’aliments végétaux développent un microbiome intestinal plus mature, jetant ainsi les bases d’une meilleure santé et d’une meilleure résistance aux maladies plus tard dans la vie. *Avis important : Medrxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et ne sont donc pas considérés comme concluants, ne guident pas la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ni ne sont traités comme des informations établies. Une étude récente publiée sur Medrxiv Preprint* Server a rapporté que la diversité des plantes alimentaires prédit la maturation des microbiomes au début de la vie. Au cours des premières années de la vie, l'intestin humain subit une transition d'un état stérile à un écosystème microbien diversifié,...
Manger une variété de plantes aide les nourrissons à développer un microbiome intestinal plus fort
De nouvelles recherches montrent que les nourrissons qui consomment une plus grande variété d’aliments végétaux développent un microbiome intestinal plus mature, jetant ainsi les bases d’une meilleure santé et d’une meilleure résistance aux maladies plus tard dans la vie.
*Avis important : MedrxivPublier des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et donc non considérés comme concluants, qui guident la pratique clinique/les comportements liés à la santé ou qui sont traités comme des informations établies.
Une étude récemment publiée sur l'étudeMedrxivPreprint* Server a rapporté que la diversité des plantes alimentaires prédit la maturation des microbiomes au début de la vie.
Au cours des premières années de la vie, l’intestin humain subit une transition d’un état stérile à un écosystème microbien diversifié à mesure que le microbiome intestinal passe d’un état immature à un état adulte et mature. Une bonne succession microbienne est essentielle au métabolisme, à la résistance aux maladies et au développement immunitaire, et les perturbations de ce processus augmentent le risque d’allergie, de diabète et d’obésité.
Malgré les liens établis entre la santé et le microbiome intestinal du nourrisson, la colonisation par l’alimentation complémentaire reste floue. Cette étude comble cette lacune et montre que la phase de sevrage est le principal moteur des signatures alimentaires au sein des populations, indépendamment des différences régionales en matière de régime alimentaire.
L'étude et les résultats
Alors que seulement huit aliments de base étaient communs à tous les pays, l’étude a identifié 199 séquences alimentaires végétales uniques dans l’alimentation des nourrissons du monde entier, démontrant une grande diversité alimentaire.
La présente étude a examiné l'association entre le développement précoce du microbiome et l'alimentation du nourrisson. La cohorte de l'étude comprenait 729 enfants âgés de ≤ 3 ans originaires des États-Unis, du Kenya, du Nicaragua, du Pakistan et du Cambodge.
Des échantillons de selles provenant des enfants ont été soumis à une méthode d'évaluation diététique objective, Foodseq, qui séquence l'ARNr 12S des mitochondries animales ou les gènes de leucine des plastes végétaux. Cela démontre une grande hétérogénéité dans les régimes alimentaires des jeunes enfants.
Plant Foodseq a détecté 199 séquences uniques d'aliments végétaux, dont 113 espèces et 86 variantes de séquence attribuées (ASV). En outre, 42 % des ASV végétaux ont été détectés dans un pays, et seules huit cultures de base (maïs, riz, blé, tomates, mangues, alliums, bananes/plantains et morelles) étaient systématiquement répandues dans tous les pays.
L'analyse en composantes principales a montré que la présence globale d'aliments végétaux soutenait le principal axe de variation alimentaire (composante principale 1, PC1).
Contrairement aux autres PC, PC1 a montré des charges exclusivement positives pour les aliments partagés, ce qui suggère que l'étendue de la consommation de plantes a été capturée. De plus, PC1 était fortement corrélé à la richesse totale de Foodsseq et à l’âge des enfants. Ces associations étaient cohérentes avec le parcours de sevrage attendu, car les nourrissons incorporent une variété d'aliments solides dans leur alimentation.
Alors que le stade de sevrage PC1 dominait, le PC2 capturait les signatures alimentaires spécifiques au pays influencées par les aliments de base régionaux tels que le riz (Cambodge), les bananes/plantains (Nicaragua) et le mil/sorgho (Kenya). Ces différences dans le calendrier de diversification alimentaire reflètent probablement les pratiques alimentaires culturelles, les facteurs économiques et la disponibilité alimentaire locale.
Le rythme et le calendrier de la diversification alimentaire variaient selon les pays. Par exemple, les nourrissons cambodgiens ont montré une diversification alimentaire rapide, atteignant un plateau à 13 mois, tandis que les nourrissons américains ont montré une augmentation plus progressive de la diversité alimentaire à 19 mois.
En revanche, l’équipe n’a découvert que 28 espèces animales. Il s'agissait notamment du bétail commun tel que les vaches, les poulets et les porcs, ainsi que des animaux spécifiques à la région tels que les buffles d'eau (au Pakistan) et les poissons (au Cambodge).
Notamment, 41 % des échantillons manquaient d’ADN animal non humain et seulement un tiers contenait plus de deux espèces animales. Compte tenu de cette portée limitée et du rôle établi des fibres dans le développement du microbiome, l’étude s’est principalement concentrée sur la diversité alimentaire à base de plantes en tant que moteur clé de la maturation microbienne.
De plus, la diversité alpha du microbiome intestinal a augmenté régulièrement au cours des deux premières années de vie, quel que soit le pays. Cependant, le pays d’origine et l’âge étaient des facteurs significatifs de variation interindividuelle (diversité bêta), tandis que le mode de naissance et le statut d’allaitement étaient des facteurs significatifs de composition microbienne.
De plus, le regroupement hiérarchique a révélé un modèle de succession microbienne. L'équipe a observé un groupe en début de vie enrichi en streptocoques et en bifidobactéries et un groupe de transition entre 12 et 18 mois enrichi en porteurs végétaux tels que Blautia et Ligilactobacillus.
Pas seulement les plantes, mais aussi combien de choses : le simple fait de compter le nombre d’aliments végétaux différents qu’un enfant consomme peut être un moyen pratique de suivre le développement sain du microbiome.
Après la transition de 21 à 36 mois, un groupe de microbiome tardif est apparu, similaire au microbiome adulte, et présentait Faecalibacterium prausnitzii et Bacteroides vulgatus.
En outre, un modèle de forêt aléatoire (RF) a prédit avec succès l’âge de l’enfance à l’aide de données sur le microbiome et a identifié Bifidobacterium et Faecalibacterium comme principaux prédicteurs.
Ensuite, les chercheurs ont comparé la maturation des aliments avec la maturation du microbiome intestinal. Cependant, ils ont constaté que si la diversité alimentaire était associée à la transition vers un microbiome adulte, elle n’était pas directement corrélée à la diversité microbienne globale.
La diversité alpha a augmenté jusqu'à 14 à 16 mois après le plateau de diversité alimentaire, ce qui suggère que la diversification du microbiome intestinal s'est poursuivie même après que la complexité alimentaire ait été atteinte.
En outre, il existait une forte corrélation positive entre la diversité alimentaire et la présence de groupes de microbiome de transition et tardifs, notamment des taxons dégradant les fibres tels que Facalibacterium, Bacteroides et Prevotella.
En revanche, le premier groupe de microbiome n’était pas corrélé à la diversité alimentaire, renforçant l’idée selon laquelle la consommation de lait, plutôt que d’aliments solides, influence la composition microbienne initiale.
Conclusions
Les bactéries dégradant les fibres se sont révélées plus abondantes chez les jeunes enfants qui mangeaient un plus large éventail de plantes, ce qui suggère que la variété alimentaire pourrait aider à préparer l’intestin à un microbiome adulte.
Les résultats n’indiquent pas d’associations simples et linéaires entre le microbiome et la diversité alimentaire au début de la vie. Cependant, les résultats soutiennent un modèle de développement en deux étapes : les phases précoces et de maturation, qui sont respectivement régulées par la consommation de lait et la diversité alimentaire.
Au cours de la maturation, l'âge physiologique du nourrisson et la diversité alimentaire prédisent la colonisation du nourrisson par certains taxons associés à une fonction similaire du microbiome adulte.
Notamment, malgré de nombreux modes d’alimentation complémentaires, les tendances de succession étaient similaires dans l’ensemble de la cohorte. Cela suggère que le microbiome suit un chemin de maturation prévisible quelles que soient les traditions alimentaires régionales spécifiques.
Ces données confirment cet apport diversifié et approprié d'aliments végétaux lors de l'alimentation complémentaire, favorisant la maturation du microbiome intestinal vers un état adulte dégénéré en fibres.
En outre, ces résultats renforcent le rôle de la diversité alimentaire à base de plantes dans le développement du microbiome et fournissent une mesure simple mais efficace pour surveiller la maturation microbienne chez les nourrissons – une mesure qui pourrait facilement être mise en œuvre dans les interventions de santé publique et nutritionnelles dans le monde entier.
*Avis important : MedrxivPublier des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et donc non considérés comme concluants, qui guident la pratique clinique/les comportements liés à la santé ou qui sont traités comme des informations établies.
Sources :
- Preliminary scientific report.
Dietary plant diversity predicts early life microbiome maturation Teresa McDonald, Ammara Aqeel, Ben Neubert, Anna Bauer, Sharon Jiang, Olivia Osborne, Danting Jiang, Filemon Bucardo, Lester Gutiérrez, Luis Zambrana, Kirsten Jenkins, Jennifer Gilner, Javier Rodriguez, Amanda Lai, Jonathan P. Smith, Rinn Song, Kazi Ahsan, Sheraz Ahmed, Sanam Iram Soomro, Fayaz Umrani, Michael Barratt, Jeffrey Gordon, Asad Ali, Najeeha Iqbal, Jillian Hurst, Victoria Martin, Wayne Shreffler, Qian Yuan, Joe Brown, Neeraj K. Surana, Samuel Vilchez, Sylvia Becker-Dreps, Lawrence David medRxiv 2025.02.28.25323117; DOI: 10.1101/2025.02.28.25323117, https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2025.02.28.25323117v1