Секвенирането на ДНК на целия тумор става стандарт за деца с рак

Секвенирането на ДНК на целия тумор става стандарт за деца с рак

Пълните ДНК разчитания на ракови ракови заболявания при диагностицирането са въведени като стандарт за грижа в европейците. Чрез определяне на типа рак на детето възможно най-точно, Центърът за детска онкология Princess Máxima има за цел да предложи на всяко отделно дете лечението, което е най-вероятно да работи за него.

За да се определи точната форма на детския рак, ДНК в туморните клетки на децата се анализира при диагностицирането. От май центърът Princess Máxima започна да анализира цялата туморна ДНК на децата като грижа, използвайки технология, наречена секвениране на генома на Gym.

Центърът Máxima направи промяната, тъй като секвенирането на целия геном е по-всеобхватно от традиционната техника, която анализира само протеиново кодиращата част от ДНК, която съставлява около 2% от пълната ДНК. Ходът не само подобрява диагностиката, но също така предоставя ценни данни за разработване на нови лечения и изследване на развитието на детския рак.

Д-р Бастиан Топс, ръководител на лабораторията по патология на детския рак в Центъра за детска онкология Princess Máxima:Чрез анализиране на пълната ДНК вече можем да разкрием всякакви генетични промени в туморната клетка. Този превключвател предоставя по-пълна картина на рака на детето. Този подход дава възможност за приложения като фармакогеномика, където можем да предложим лечение въз основа на генетичния профил на детето. Също така ни позволява да наблюдаваме по-отблизо прогресията на тумора по време на лечението на молекулярно ниво. '

Фармакогеномика

Секвенирането на целия геном не само разглежда ДНК на туморните клетки, но и така наречената зародишна ДНК в здравите клетки на детето. Това дава възможност за фармакогеномни анализи, които помагат за предоставяне на прецизно медицинско лечение според наследствения генетичен профил на детето.

Д-р Мета Диекстра Постдокторски изследовател в групата Huitema и болничен фармацевт в Центъра за детска онкология Princess Máxima ръководи клиничното прилагане на фармакогенетични тестове с подкрепата на Фондация Princess Máxima Center.

Ключово предимство на използването на секвениране на целия геном в диагностиката е, че можем да използваме повторно данните за фармакогеномичен анализ. Специалният софтуер ни позволява бързо и надеждно да сканираме данните за генетични варианти, които влияят на реакцията на детето към различни лекарства, както по отношение на страничните ефекти, така и по отношение на ефективността. Това ни позволява да адаптираме лечението по-прецизно, от коригиране на дозата до избор на различно лекарство, което отговаря по-добре на генетичния профил на детето. “

Д-р Мета Диекстра Постдокторантски изследовател в групата Huitema и болничен фармацевт в Центъра за детска онкология Princess Máxima

Изследователски данни и инфраструктура

Анализът на пълната туморна ДНК при диагностицирането също така предлага на учените нови прозрения за генетично наследените форми на детски рак и нови насоки за изследване на имунотерапията.

Д-р Патрик Кемерен, ръководител на изследователска група и ръководител на Big Data Core:„Прилагането на секвениране на целия геном в диагностиката не би било възможно без тясното сътрудничество между нашата биологична група и нашите колеги диагностици. Заедно разработихме уникална настройка на инфраструктурата за данни, която се споделя между отделите, гарантирайки, че генетичната информация за тумора на детето е не само по-бързо достъпна за изследване, но и че можем бързо да пренесем иновациите в клиниката.“

Учените също така планират да споделят анонимизирани данни за секвениране на целия геном с други изследователски институции, работещи върху рака в детска възраст. Kemmeren подчертава важността на това:„Ракът в детска възраст е рядък и в допълнение към изучаването на самите данни, ние се надяваме, че чрез споделянето на тези данни ще ускорим разработването на нови лечения и ще придобием по-добро разбиране за развитието на рака в детска възраст.“

източници: