Viso naviko DNR sekos nustatymas tampa standartu vėžiu sergantiems vaikams

Viso naviko DNR sekos nustatymas tampa standartu vėžiu sergantiems vaikams

Išsamios vėžio vėžio DNR rodmenys diagnozuojant europiečius buvo pritaikyti kaip priežiūros standartas. Kuo tiksliau nustatydamas vaiko vėžio tipą, Princesės Máximos vaikų onkologijos centras siekia kiekvienam vaikui pasiūlyti tokį gydymą, kuris jam labiausiai tiktų.

Norint nustatyti tikslią vaikų vėžio formą, diagnozuojant analizuojama vaikų naviko ląstelių DNR. Nuo gegužės mėnesio Princess Máxima centras pradėjo analizuoti visą vaikų naviko DNR, naudodamas technologiją, vadinamą Gym genomo sekos nustatymu.

Máxima centras padarė perėjimą, nes viso genomo sekos nustatymas yra išsamesnis nei tradicinė technika, kuri analizavo tik baltymus koduojančią DNR dalį, kuri sudaro apie 2% visos DNR. Šis žingsnis ne tik pagerina diagnostiką, bet ir suteikia vertingų duomenų kuriant naujus gydymo būdus ir tiriant vaikų vėžio išsivystymą.

Dr. Bastiaan Tops, Princess Máxima vaikų onkologijos centro Vaikų vėžio patologijos laboratorijos vadovas:Analizuodami visą DNR, dabar galime atskleisti bet kokius genetinius naviko ląstelės pokyčius. Šis jungiklis suteikia išsamesnį vaiko vėžio vaizdą. Šis metodas leidžia taikyti tokias programas kaip farmakogenomika, kur galime pasiūlyti gydymą pagal vaiko genetinį profilį. Tai taip pat leidžia atidžiau stebėti naviko progresavimą gydymo metu molekuliniu lygiu. '

Farmakogenomika

Viso genomo sekos nustatymas ne tik žiūri į naviko ląstelių DNR, bet ir į vadinamąją germinalinę DNR sveikose vaiko ląstelėse. Tai leidžia atlikti farmakogenomines analizes, kurios padeda tiksliai gydyti vaistus pagal paveldėtą vaiko genetinį profilį.

Dr. Meta Diekstra Huitema grupės mokslo darbuotojas ir ligoninės vaistininkas Princess Máxima vaikų onkologijos centre vadovauja klinikiniam farmakogenetinių tyrimų įgyvendinimui, remiant Princess Máxima centro fondą.

Pagrindinis viso genomo sekos nustatymo privalumas yra tai, kad galime pakartotinai panaudoti duomenis farmakogenominei analizei. Speciali programinė įranga leidžia greitai ir patikimai nuskaityti duomenis dėl genetinių variantų, turinčių įtakos vaiko reakcijai į skirtingus vaistus, tiek šalutinio poveikio, tiek veiksmingumo požiūriu. Tai leidžia tiksliau pritaikyti gydymą – nuo ​​dozės koregavimo iki kito vaisto, geriau atitinkančio vaiko genetinį profilį, pasirinkimo. “

Dr. Meta Diekstra Huitema grupės mokslo darbuotoja ir ligoninės vaistininkė Princess Máxima vaikų onkologijos centre

Tyrimų duomenys ir infrastruktūra

Viso naviko DNR analizė diagnozuojant mokslininkams taip pat suteikia naujų įžvalgų apie genetiškai paveldėtas vaikų vėžio formas ir naujus imunoterapijos tyrimų rezultatus.

Dr. Patrick Kemmeren, tyrimų grupės vadovas ir didžiųjų duomenų branduolio vadovas:„Viso genomo sekos nustatymas diagnozėje nebūtų buvęs įmanomas be glaudaus bendradarbiavimo tarp mūsų biologijos grupės ir mūsų diagnostikos kolegų. Kartu sukūrėme unikalią duomenų infrastruktūros sąranką, kuria dalijasi skyriai, užtikrinantys, kad genetinė informacija apie vaiko auglį būtų ne tik greičiau prieinama tyrimams, bet ir galėtume greitai pritaikyti naujoves klinikoje.“

Mokslininkai taip pat planuoja dalytis anoniminiais viso genomo sekos duomenimis su kitomis tyrimų institucijomis, dirbančiomis vaikų vėžio srityje. Kemmerenas pabrėžia to svarbą:„Vaikystės vėžys yra retas ir, be pačių duomenų tyrimo, tikimės, kad dalindamiesi šiais duomenimis paspartinsime naujų gydymo būdų kūrimą ir geriau suprasime vaikų vėžio vystymąsi.

Šaltiniai: