Η Sapio Sciences συνεργάζεται με το Wellcome Sanger Institute στον ψηφιακό εργαστηριακό μετασχηματισμό

Η Sapio Sciences συνεργάζεται με το Wellcome Sanger Institute στον ψηφιακό εργαστηριακό μετασχηματισμό

Η Sapio Sciences, η πλατφόρμα πληροφορικής του εργαστηρίου τεχνητής νοημοσύνης Science-aware™, ανακοίνωσε σήμερα ότι το Ινστιτούτο Wellcome Sanger επέλεξε την Πλατφόρμα Πληροφορικής Sapio ως βασικό LIMS για την υποστήριξη του φιλόδοξου προγράμματος εργαστηριακού μετασχηματισμού του ινστιτούτου. Το Ινστιτούτο Sanger θα μεταβεί από ένα συνονθύλευμα παλαιών λύσεων LIMS σε ένα θεμέλιο με επίκεντρο το Sapio LIMS για την υποστήριξη μεγάλης κλίμακας έρευνας γονιδιωματικής, σχεδιασμού ζήτησης και εργαστηριακών εργασιών.

Το πολυετές έργο ψηφιακού μετασχηματισμού διευθύνεται από την ομάδα Core Operations του Sanger Institute, η οποία βρίσκεται στην καρδιά του ινστιτούτου. Η Core Operations προσφέρει ένα ευρύ φάσμα κυτταρικών και γονιδιωματικών ροών εργασίας που υποστηρίζουν τις διαδικασίες έρευνας και παραγωγής δεδομένων από άκρο σε άκρο του Ινστιτούτου. Επί του παρόντος, η ομάδα Core Operations χρησιμοποιεί ψηφιακά εργαλεία και τεχνολογικές λύσεις σχεδιασμένες για συγκεκριμένες ροές εργασίας, συμπεριλαμβανομένης της διαχείρισης δειγμάτων, της αποθήκευσης, του προγραμματισμού και της εργαστηριακής εκτέλεσης. Αυτό το συνονθύλευμα λύσεων και τεχνολογιών έχει καταστήσει πιο δύσκολο τον συντονισμό της εργασίας μεταξύ των ομάδων, τον προγραμματισμό της εργασίας από την αρχή μέχρι το τέλος και την ορατότητα των επιστημόνων για την πρόοδο.

Ένας από τους πρώτους στόχους του μετασχηματισμού είναι να δώσει στις βασικές λειτουργίες και στις επιστημονικές ομάδες μια πιο ξεκάθαρη εικόνα της εργασίας που φτάνει στο εργαστήριο, πώς αυτή η εργασία κινείται μέσα από πολύπλοκους αγωγούς, τους πόρους που χρειάζονται σε κάθε βήμα και να δώσει στους επιστήμονες πρόσβαση σε βασικά επιστημονικά δεδομένα που παράγονται στους αγωγούς επεξεργασίας. Εκτός από την εφαρμογή ενός κυρίαρχου LIMS για την υποστήριξη της έρευνας που διεξάγεται από το Sanger Institute, ο μετασχηματισμός θα επικεντρωθεί στις ροές εργασίας, τα δεδομένα και τα εργαλεία που χρησιμοποιούνται στην κυτταρική πλατφόρμα και τις ομάδες γονιδιωματικής πλατφόρμας και τελικά θα επεκταθεί σε όλες τις ερευνητικές ομάδες.

Η Sapio Sciences έχει την τιμή να συνεργάζεται με το Wellcome Sanger Institute καθώς συνεχίζουμε να διαμορφώνουμε το μέλλον της γονιδιωματικής επιστήμης. Η Sanger βοήθησε να τεθούν τα πρότυπα για μεγάλης κλίμακας γονιδιωματική και έχουν πολύ σαφείς προσδοκίες για την επιστημονική τους εφαρμογή. Με αυτό το έργο, θα συνεργαστούμε για να θέσουμε το Sapio LIMS στο επίκεντρο των εργαστηριακών λειτουργιών τους, εξαλείφοντας τις προστριβές που μπορούν να αποφευχθούν στην καθημερινή τους εργασία και δίνοντας στις ομάδες μια καλύτερη εικόνα των δεδομένων, των ροών εργασίας και των πόρων που οδηγούν την επιστήμη τους».

Mike Hampton, Chief Commercial Officer, Sapio Sciences

«Δίνουμε στους επιστήμονές μας σαφείς και αξιόπιστες απαντήσεις στην ερώτηση «Πού είναι το δείγμα μου και πού είναι τα δεδομένα μου;» Η εργασία σε πολύπλοκες ροές εργασίας με πολλές ομάδες είναι μια από τις μεγαλύτερες προκλήσεις μας.είπε ο Simon Moore, COO στο Wellcome Sanger Institute."Για να σχεδιάσουν και να διεξάγουν την έρευνά τους, οι επιστήμονές μας χρειάζονται σιγουριά ότι η πρόοδος του δείγματος και τα κρίσιμα δεδομένα είναι πάντα ορατά και προσβάσιμα. Μεταβαίνοντας στο Sapio LIMS ως βασική πλατφόρμα μας, μπορούμε να βελτιώσουμε τον τρόπο παρακολούθησης, διαχείρισης και ενορχήστρωσης της εργασίας, ευθυγράμμισης πόρων και εξορθολογισμού των ροών εργασίας. Η Sapio παρέχει στους επιστήμονές μας σύγχρονα, διαμορφώσιμα εργαλεία που συμβαδίζουν με την επιστήμη."

Ο μετασχηματισμός επικεντρώνεται σε πολλούς βασικούς τομείς

• Zentrale LIMS-Grundlage im gesamten Sanger Institute: Sapio LIMS wird zur dominierenden LIMS-Plattform im Kernbetrieb werden und alle großen Arbeitsabläufe über eine breite Palette von Technologien hinweg unterstützen.
• Vollständige Sichtbarkeit des Probenfortschritts in komplexen Arbeitsabläufen, sodass Benutzer durchgehend in Echtzeit direkten Zugriff auf wichtige wissenschaftliche Daten und Qualitätskontrolldaten haben
• Erweiterte Workflow-Automatisierung und Geräteintegration: Sapio LIMS unterstützt konfigurierbare Workflows, die die Experimentvorbereitung, die Labordurchführung und die Primäranalyse umfassen, und lässt sich gleichzeitig mit einer breiten Palette von Instrumenten integrieren. Dazu gehört die Möglichkeit, sich an neue, hochmoderne Geräte anzuschließen, die das Sanger Institute oft als eines der ersten in den Routineeinsatz bringt.
• KI-fähige Laborinfrastruktur: Die Sapio Informatics Platform wird dem Sanger Institute eine Grundlage für native KI-Funktionen wie geführte Arbeitsabläufe und einen intelligenteren Zugriff auf Labordaten bieten, die im Einklang mit den Grundsätzen des Instituts eingeführt werden, damit Wissenschaftler die Kontrolle über Entscheidungen behalten.
• Konsistente Proben- und Datenhandhabung: Das Projekt wird ein konsistenteres Probenlebenszyklusmanagement, eine klarere Verfolgung von Proben auf ihrem Weg durch Zell- und Sequenzierungsvorgänge sowie eine bessere Verknüpfung zwischen Proben, Prozessschritten und der zugehörigen Dokumentation fördern.
• Vereinfachte LIMS-Landschaft: Mit der Verlagerung von Arbeitsabläufen in Sapio LIMS plant das Sanger Institute, im Laufe der Zeit einige seiner sich überschneidenden LIMS- und Punktlösungen einzustellen und die Komplexität für Benutzer und Supportteams zu reduzieren, um die Wiederverwendung und Erweiterung vorhandener Funktionen zu fördern, anstatt neue Punktlösungen hinzuzufügen.
• Beschleunigen Sie den Einsatz neuer Technologien und Arbeitsabläufe als Kernangebote erheblich, um das Sanger Institute an der Spitze der Genomforschung zu halten
• Stärkere Nachfrage- und Ressourcenplanung: Das Sanger Institute wird ein besseres Bild der Nachfrage in allen Labors erstellen, damit Core Operations die Arbeit planen, Durchläufe planen und Geräte, Personen und Materialien über komplexe mehrstufige Arbeitsabläufe hinweg koordinieren kann.

Συνολικά, το πρόγραμμα έχει σκοπό να δώσει στο Sanger Institute μια σαφέστερη επισκόπηση της προόδου, της ζήτησης, της ικανότητας και της επιστημονικής εργασίας στα εργαστήριά του στη δημιουργία δεδομένων. αφαιρέστε την πολυπλοκότητα που μπορεί να αποφευχθεί από τις καθημερινές λειτουργίες. και υποστηρίζουν ταχύτερη και πιο αξιόπιστη παράδοση της γονιδιωματικής επιστήμης.

Πηγές: