Sapio Sciences werkt samen met het Wellcome Sanger Institute aan digitale laboratoriumtransformatie

Sapio Sciences werkt samen met het Wellcome Sanger Institute aan digitale laboratoriumtransformatie

Sapio Sciences, het science-aware™ AI-platform voor laboratoriuminformatica, heeft vandaag aangekondigd dat het Wellcome Sanger Institute het Sapio Informatics Platform heeft geselecteerd als het belangrijkste LIMS ter ondersteuning van het ambitieuze laboratoriumtransformatieprogramma van het instituut. Het Sanger Institute zal overstappen van een lappendeken van bestaande LIMS-oplossingen naar een op Sapio LIMS gerichte basis ter ondersteuning van grootschalig genomica-onderzoek, vraagplanning en laboratoriumactiviteiten.

Het meerjarige digitale transformatieproject wordt geleid door het Core Operations-team van het Sanger Instituut, dat het hart van het instituut vormt. Core Operations biedt een breed scala aan cellulaire en genomische workflows die de end-to-end onderzoeks- en datageneratieprocessen van het Instituut ondersteunen. Momenteel maakt het Core Operations-team gebruik van digitale tools en technologische oplossingen die zijn ontworpen voor specifieke workflows, waaronder monsterbeheer, opslag, planning en laboratoriumuitvoering. Deze lappendeken van oplossingen en technologieën heeft het moeilijker gemaakt om het werk van verschillende teams te coördineren, het werk van begin tot eind te plannen en wetenschappers inzicht te geven in de voortgang.

Een van de eerste doelstellingen van de transformatie is om kernoperaties en wetenschapsteams een duidelijker beeld te geven van het werk dat in het laboratorium aankomt, hoe dat werk door complexe pijplijnen beweegt, de middelen die nodig zijn bij elke stap, en om wetenschappers toegang te geven tot belangrijke wetenschappelijke gegevens die in de verwerkingspijplijnen worden gegenereerd. Naast de implementatie van een dominant LIMS ter ondersteuning van onderzoek uitgevoerd door het Sanger Instituut, zal de transformatie zich richten op de workflows, gegevens en hulpmiddelen die worden gebruikt in de cellulaire platform- en genomische platformteams en zich uiteindelijk uitstrekken tot alle onderzoeksteams.

Sapio Sciences is vereerd om samen te werken met het Wellcome Sanger Institute terwijl we de toekomst van de genomische wetenschap blijven vormgeven. Sanger heeft geholpen de standaard te zetten voor grootschalige genomica en ze hebben zeer duidelijke verwachtingen van de wetenschappelijke implementatie ervan. Met dit project gaan we samenwerken om Sapio LIMS centraal te stellen in hun laboratoriumactiviteiten, waardoor vermijdbare wrijving in hun dagelijkse werk wordt geëlimineerd en teams een beter zicht krijgen op de gegevens, workflows en bronnen die hun wetenschap aandrijven.”

Mike Hampton, commercieel directeur, Sapio Sciences

“We geven onze wetenschappers duidelijke en betrouwbare antwoorden op de vraag ‘Waar is mijn monster en waar zijn mijn gegevens?’ Werken in complexe workflows met meerdere teams is een van onze grootste uitdagingen”,zei Simon Moore, COO bij het Wellcome Sanger Institute."Om hun onderzoek te plannen en uit te voeren, hebben onze wetenschappers het vertrouwen nodig dat de voortgang van monsters en kritieke gegevens altijd zichtbaar en toegankelijk zijn. Door over te stappen op Sapio LIMS als ons kernplatform kunnen we de manier verbeteren waarop we werk volgen, beheren en orkestreren, middelen op elkaar afstemmen en workflows stroomlijnen. Sapio biedt onze wetenschappers moderne, configureerbare tools die gelijke tred houden met de manier waarop we wetenschap bedrijven."

De transformatie richt zich op een aantal belangrijke gebieden

• Zentrale LIMS-Grundlage im gesamten Sanger Institute: Sapio LIMS wird zur dominierenden LIMS-Plattform im Kernbetrieb werden und alle großen Arbeitsabläufe über eine breite Palette von Technologien hinweg unterstützen.
• Vollständige Sichtbarkeit des Probenfortschritts in komplexen Arbeitsabläufen, sodass Benutzer durchgehend in Echtzeit direkten Zugriff auf wichtige wissenschaftliche Daten und Qualitätskontrolldaten haben
• Erweiterte Workflow-Automatisierung und Geräteintegration: Sapio LIMS unterstützt konfigurierbare Workflows, die die Experimentvorbereitung, die Labordurchführung und die Primäranalyse umfassen, und lässt sich gleichzeitig mit einer breiten Palette von Instrumenten integrieren. Dazu gehört die Möglichkeit, sich an neue, hochmoderne Geräte anzuschließen, die das Sanger Institute oft als eines der ersten in den Routineeinsatz bringt.
• KI-fähige Laborinfrastruktur: Die Sapio Informatics Platform wird dem Sanger Institute eine Grundlage für native KI-Funktionen wie geführte Arbeitsabläufe und einen intelligenteren Zugriff auf Labordaten bieten, die im Einklang mit den Grundsätzen des Instituts eingeführt werden, damit Wissenschaftler die Kontrolle über Entscheidungen behalten.
• Konsistente Proben- und Datenhandhabung: Das Projekt wird ein konsistenteres Probenlebenszyklusmanagement, eine klarere Verfolgung von Proben auf ihrem Weg durch Zell- und Sequenzierungsvorgänge sowie eine bessere Verknüpfung zwischen Proben, Prozessschritten und der zugehörigen Dokumentation fördern.
• Vereinfachte LIMS-Landschaft: Mit der Verlagerung von Arbeitsabläufen in Sapio LIMS plant das Sanger Institute, im Laufe der Zeit einige seiner sich überschneidenden LIMS- und Punktlösungen einzustellen und die Komplexität für Benutzer und Supportteams zu reduzieren, um die Wiederverwendung und Erweiterung vorhandener Funktionen zu fördern, anstatt neue Punktlösungen hinzuzufügen.
• Beschleunigen Sie den Einsatz neuer Technologien und Arbeitsabläufe als Kernangebote erheblich, um das Sanger Institute an der Spitze der Genomforschung zu halten
• Stärkere Nachfrage- und Ressourcenplanung: Das Sanger Institute wird ein besseres Bild der Nachfrage in allen Labors erstellen, damit Core Operations die Arbeit planen, Durchläufe planen und Geräte, Personen und Materialien über komplexe mehrstufige Arbeitsabläufe hinweg koordinieren kann.

Over het geheel genomen is het programma bedoeld om het Sanger Instituut een duidelijker overzicht te geven van de voortgang van het genereren van gegevens, de vraag, de capaciteit en het wetenschappelijk werk in zijn laboratoria; verwijder vermijdbare complexiteit uit de dagelijkse bedrijfsvoering; en een snellere en betrouwbaardere levering van genomische wetenschap ondersteunen.

Bronnen: