Mokslininkai nustato 35 genus, kurie yra labai išreikšti pacientams, sergantiems ilgalaike Laimo liga

Mokslininkai nustato 35 genus, kurie yra labai išreikšti pacientams, sergantiems ilgalaike Laimo liga

Icahn medicinos mokyklos Sinajaus kalne Niujorke mokslininkai nustatė 35 genus, kurie ypač stipriai pasireiškia žmonėms, sergantiems seniai Laimo liga. Šie genai gali būti naudojami kaip biomarkeriai diagnozuojant pacientus, sergančius liga, kurią kitaip sunku diagnozuoti ir gydyti.

Rezultatai, paskelbti lapkričio 15 d Journal Cell Reports Medicine [DOI: 10.1016/j.xcrm.2022.100816],taip pat gali sukelti naujų terapinių tikslų. Šis tyrimas yra pirmasis, kuriame transkriptomika naudojama kaip kraujo tyrimas, skirtas išmatuoti RNR lygį pacientams, sergantiems ilgalaike Laimo liga.

Laimo liga yra erkių platinama liga, kuri nėra gerai suprantama. Kiekvienais metais CDC pranešama apie 30 000 diagnozuotų atvejų, tačiau apskaičiuotas tikrasis atvejų skaičius yra artimesnis 476 000 atvejų, o tai kainuoja apie 1 milijardą JAV dolerių metinių sveikatos priežiūros išlaidų Jungtinėse Valstijose. Nors daugumai pacientų Laimo liga diagnozuojama ankstyviausiose stadijose ir jie gydomi antibiotikais, apie 20 procentų pacientų išsivysto ilgalaikės komplikacijos. Tai gali būti artritas, neurologiniai simptomai ir (arba) širdies sutrikimai.

Norėjome išsiaiškinti, ar yra specifinis imuninis atsakas, kurį galima aptikti ilgalaike Laimo liga sergančių pacientų kraujyje, kad būtų sukurta geresnė šios sekinančios ligos diagnostika. Vis dar yra nepatenkintų poreikių, nes ši liga dažnai nediagnozuojama arba neteisingai diagnozuojama. Nėra pakankamai žinoma apie ilgalaikės Laimo ligos molekulinius mechanizmus.

Avi Ma'ayan, PhD, farmakologijos mokslų profesorius ir Sinajaus kalno bioinformatikos centro direktorius Icahn Mount Sinai ir vyresnysis straipsnio autorius

Tyrimo metu RNR sekos nustatymas buvo atliktas naudojant kraujo mėginius iš 152 pacientų, kuriems po gydymo buvo Laimo ligos simptomai, siekiant įvertinti jų imuninį atsaką. Kartu su RNR sekos duomenimis iš 72 pacientų, sergančių ūmine Laimo liga, ir 44 neužkrėstų kontrolinių asmenų, mokslininkai pastebėjo genų ekspresijos skirtumus ir nustatė, kad dauguma pacientų, sergančių Laimo liga, po gydymo turėjo savitą uždegiminį požymį, palyginti su ūminės Laimo ligos grupe.

Elektroninė knyga apie laboratorinę diagnostiką ir automatizavimą

Populiariausių praėjusių metų interviu, straipsnių ir naujienų rinkinys. Atsisiųsti nemokamą kopiją

Be to, analizuodami šiame tyrime skirtingai išreikštus genus ir genus, kurie buvo skirtingai išreikšti dėl kitų infekcijų iš kitų paskelbtų tyrimų, mokslininkai nustatė genų, kurie buvo labai išreikšti ir kurie anksčiau nebuvo nustatyti šiai Laimo ligai, pogrupį. susijusi uždegiminė reakcija.

Naudodami dirbtinio intelekto tipą, vadinamą mašininiu mokymusi, mokslininkai dar labiau sumažino genų rinkinį, kad sukurtų mRNR biomarkerių rinkinį, galintį atskirti sveikus pacientus nuo tų, kurie serga ūmine ar po gydymo Laimo liga. Genų skydelis, matuojantis tyrėjų nustatytų genų ekspresiją, galėtų būti sukurtas kaip diagnostinė priemonė Laimo tyrimui atlikti.

„Neturėtume nuvertinti omikos technologijų, įskaitant transkriptomiką, naudos, kad būtų galima išmatuoti RNR lygį, kad būtų galima nustatyti daugelio sudėtingų ligų, tokių kaip Laimo ligą, buvimą, užtikrinti patikimą diagnozę ir dėl to galimai geresnį šios ligos valdymą“, – sakė daktaras Ma'ayanas.

Tada mokslininkai planuoja pakartoti tyrimą, naudodami duomenis iš vienos ląstelės transkriptomikos ir viso kraujo, pritaikyti mašininio mokymosi metodą kitoms sudėtingoms ligoms, kurias sunku diagnozuoti, ir sukurti diagnostikos genų skydelį bei išbandyti jį su pacientų mėginiais.

Šaltinis:

Sinajaus kalno sveikatos sistema

Nuoroda:

Willis, MD ir kt. (2022) Genų rinkinio prognozė po gydymo Laimo liga. Ląstelė praneša apie vaistus. doi.org/10.1016/j.xcrm.2022.100816.

.