يشير تحليل جينومات فيروس جدري القرود إلى أنه ينتشر مبكرًا وبشكل خفي

يشير تحليل جينومات فيروس جدري القرود إلى أنه ينتشر مبكرًا وبشكل خفي

دراسة جديدة نشرت على خادم ما قبل الطباعة بايوركسيف* يُعلن عن تحديد مجموعة من جينومات سلالة فيروس جدري القرود A.2 من ثلاثة بلدان تختلف عن سلالة B.1 الأكبر حجمًا والمسؤولة عن الفاشية الحالية. تشير هذه الملاحظات إلى أن حالات جدري القرود A.2 ليست جزءًا من الفاشية العالمية الحالية لفيروس جدري القرود في عام 2022، بل حدثت بدلاً من ذلك عبر سلسلة انتقال مختلفة.

يتعلم: وتشير مجموعة واضحة من جينومات جدري القرود إلى انتشار مبكر ومبهم للفيروس.مصدر الصورة: جوشيميربين / Shutterstock.com

مقدمة

حتى وقت قريب، كان فيروس جدري القرود متوطنا في العديد من بلدان وسط أفريقيا، وعادة ما يسبب آفات حويصلية مفردة أو متعددة والتي غالبا ما يتم حلها تلقائيا. سبق أن ارتبطت العدوى بفيروس جدري القرود بالاتصال بالحيوانات البرية أو بأفراد مصابين تظهر عليهم الأعراض.

منذ أوائل مايو 2022، تم التعرف على فيروس جدري القرود في العديد من المناطق غير الموبوءة في العالم. نادرًا ما أبلغ هؤلاء المرضى عن تاريخ سفر إلى البلدان الموبوءة، حيث أبلغ ما يقرب من 75٪ عن سفرهم مؤخرًا إلى دولة أوروبية أخرى. إن المصابين في الفاشية الحالية هم على وجه الحصر تقريباً من الرجال الذين يمارسون الجنس مع الرجال (MSM)، ويبدو أن الفيروس ينتشر في المقام الأول عن طريق الاتصال الجنسي.

لقد تغير أيضًا مظهر أعراض عدوى جدري القرود أثناء الفاشية الحالية عن الأنماط الظاهرية السابقة، مما يشير إلى تغيرات كبيرة في بيولوجيا الفيروس.

تم إرجاع أول عدوى بجدري القرود في الفاشية الحالية إلى حدث أوروبي حيث ربما يكون الفيروس قد انتقل إلى العديد من الأشخاص. ثم انتشر الفيروس إلى 75 دولة، وتم الإبلاغ عن أكثر من 20 ألف حالة جديدة بحلول نهاية يوليو. في الوقت الحالي، تم تصنيف تفشي فيروس جدري القرود كحالة طوارئ صحية عامة تثير قلقًا دوليًا من قبل منظمة الصحة العالمية.

ونتيجة لذلك، تم إجراء المزيد من المراقبة الجينومية والاختبارات الجزيئية، مع تحميل العديد من الجينومات المتسلسلة إلى قاعدة بيانات المبادرة العالمية لتبادل جميع بيانات الأنفلونزا (GISAID). يتكون جينوم جدري القرود من حوالي 200 زوج قاعدة تشمل الشريط المزدوج من الحمض النووي الريبي منقوص الأكسجين (DNA).

في الآونة الأخيرة، تم تحميل تسعة جينومات من الولايات المتحدة وتايلاند والهند من ست عزلات سريرية مخصصة لسلالة مختلفة، A.2، إلى GISAID. يتكون هذا النسب من 16 طفرة فريدة، تسعة منها غير مترادفة.

باتباع نموذج النشوء والتطور، حاول الباحثون في معهد CSIR لعلم الجينوم والبيولوجيا التكاملية (CSIR-IGIB) تقدير الوقت من أحدث سلف مشترك (tMRCA) لهذه السلالة.

نتائج الدراسة

كان tMRCA للخط A.2 اعتبارًا من 25 يونيو 2021. وكان متوسط ​​معدل بدائل النوكليوتيدات أقل بكثير من الخط B.1 عند 5.53 × 10-5 مقارنة بـ 1.13 × 10-4 مع زيادة معدل الاستبدال B.1.

ولذلك، ربما يكون انتشار سلالة A.2 قد بدأ قبل سنوات من تفشي المرض في أوائل عام 2022، خاصة وأن الجينوم الأول جاء من عينة تم جمعها في يوليو 2021.

الجينومات التي تم تحليلها في الدراسة الحالية جاءت من رجال سافروا إلى الإمارات العربية المتحدة أو نيجيريا. ويشير هذا إلى وجود سلسلة منفصلة من انتقال العدوى بين البشر دون انتقال مباشر من مصدر حيواني عبر الحدود الدولية. والأهم من ذلك أنه لم يتم التعرف على هذا الانتشار حتى الدراسة الحالية.

قد لا تكون سلسلة الانتقال هذه مرتبطة بتفشي جدري القرود الكبير في عام 2022، والذي ربما تم اكتشافه بسبب زيادة الوعي والمراقبة وتوافر وسائل التشخيص على نطاق أوسع.

تسلط نتائج الدراسة الضوء على أهمية المراقبة الجينومية لجميع مسببات الأمراض الناشئة لسياسة الصحة العامة والمعرفة الوبائية.

* ملاحظة هامة

تنشر bioRxiv تقارير علمية أولية لم تخضع لمراجعة النظراء، وبالتالي لا ينبغي اعتبارها قاطعة، أو توجيه الممارسة السريرية/السلوك الصحي، أو التعامل معها على أنها معلومات ثابتة.

مراجع:

• Jolly, B. & Scari, V. (2022). Ein eindeutiger phylogenetischer Cluster von Affenpocken-Genomen deutet auf eine frühe und kryptische Ausbreitung des Virus hin. bioRxiv. doi:10.1101/2022.07.30.502168. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.07.30.502168v1
• Untersuchung des Affenpocken-Ausbruchs in England: Technisches Briefing 1 (2022). Abgerufen von https://www.gov.uk/government/publications/monkeypox-outbreak-technical-briefings/investigation-into-monkeypox-outbreak-in-england-technical-briefing-1. Zugriff am 3. August 2022.

.