El análisis de los genomas del virus de la viruela del simio sugiere que se propaga temprana y crípticamente

El análisis de los genomas del virus de la viruela del simio sugiere que se propaga temprana y crípticamente

Un nuevo estudio publicado en el servidor de preimpresión. bioRxiv* informa la identificación de un grupo de genomas del linaje A.2 del virus de la viruela simica de tres países que son distintos del linaje B.1, mucho más grande, responsable del brote actual. Estas observaciones sugieren que los casos de viruela simica A.2 no son parte del actual brote mundial de viruela simica en 2022 y, en cambio, ocurrieron a través de una cadena de transmisión diferente.

Aprender: Un claro grupo filogenético de genomas de viruela simica sugiere una propagación temprana y críptica del virus.Crédito de la foto: joshimerbin / Shutterstock.com

introducción

Hasta hace poco, el virus de la viruela del simio era endémico en varios países de África central y típicamente causaba lesiones vesiculares únicas o múltiples que a menudo se resolvían espontáneamente. La infección por el virus de la viruela del simio se ha asociado anteriormente con el contacto con animales salvajes o con individuos infectados sintomáticos.

Desde principios de mayo de 2022, se ha identificado el virus de la viruela del simio en varias regiones no endémicas del mundo. Estos pacientes rara vez informaron antecedentes de viajes a países endémicos, y aproximadamente el 75% informó viajes recientes a otro país europeo. Los infectados en el brote actual son casi exclusivamente hombres que tienen relaciones sexuales con hombres (HSH), y el virus aparentemente se transmite principalmente a través del contacto sexual.

El perfil de síntomas de la infección por viruela simica durante el brote actual también ha cambiado con respecto a fenotipos anteriores, lo que indica cambios significativos en la biología del virus.

La primera infección de viruela simica del brote actual se remonta a un evento europeo en el que el virus pudo haberse transmitido a muchas personas. Luego, el virus se propagó a 75 países y a finales de julio se notificaron más de 20.000 nuevos casos. Actualmente, la Organización Mundial de la Salud (OMS) ha clasificado el brote del virus de la viruela simica como una emergencia de salud pública de importancia internacional.

Como resultado, se llevó a cabo una mayor vigilancia genómica y pruebas moleculares, y se cargaron varios genomas secuenciados en la base de datos de la Iniciativa global para compartir todos los datos sobre la influenza (GISAID). El genoma de la viruela del simio consta de aproximadamente 200 pares de kilobases que abarcan su doble hebra de ácido desoxirribonucleico (ADN).

Recientemente, se cargaron en GISAID nueve genomas de Estados Unidos, Tailandia e India de seis aislados clínicos asignados a un linaje diferente, A.2. Este linaje consta de 16 mutaciones únicas, nueve de las cuales no son sinónimas.

Siguiendo el modelo filogenético, investigadores del Instituto CSIR de Genómica y Biología Integrativa (CSIR-IGIB) intentaron estimar el tiempo desde el ancestro común más reciente (tMRCA) de este linaje.

Resultados del estudio

El tMRCA de la línea A.2 era al 25 de junio de 2021. La tasa promedio de sustituciones de nucleótidos fue mucho menor que la de la línea B.1 en 5,53 x 10-5 en comparación con 1,13 x 10-4 con la tasa de sustitución B.1 aumentando.

Por lo tanto, es posible que la propagación del linaje A.2 haya comenzado años antes del brote a principios de 2022, especialmente porque el genoma más antiguo provino de una muestra recolectada en julio de 2021.

Los genomas analizados en el estudio actual procedían de hombres que viajaron a los Emiratos Árabes Unidos o Nigeria. Esto sugiere una cadena separada de transmisión entre humanos sin transmisión zoonótica directa a través de fronteras internacionales. Es importante destacar que esta propagación no se reconoció hasta el estudio actual.

Es posible que esta cadena de transmisión no esté relacionada con el gran brote de viruela simica de 2022, que puede haber sido descubierto debido a una mayor concienciación, vigilancia y mayor disponibilidad de diagnósticos”.

Los resultados del estudio resaltan la importancia de la vigilancia genómica de todos los patógenos emergentes para las políticas de salud pública y el conocimiento epidemiológico.

*NOTA IMPORTANTE

bioRxiv publica informes científicos preliminares que no han sido revisados ​​por pares y, por lo tanto, no deben considerarse concluyentes, guiar la práctica clínica o el comportamiento de salud ni tratarse como información establecida.

Referencias:

• Jolly, B. & Scari, V. (2022). Ein eindeutiger phylogenetischer Cluster von Affenpocken-Genomen deutet auf eine frühe und kryptische Ausbreitung des Virus hin. bioRxiv. doi:10.1101/2022.07.30.502168. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.07.30.502168v1
• Untersuchung des Affenpocken-Ausbruchs in England: Technisches Briefing 1 (2022). Abgerufen von https://www.gov.uk/government/publications/monkeypox-outbreak-technical-briefings/investigation-into-monkeypox-outbreak-in-england-technical-briefing-1. Zugriff am 3. August 2022.

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