A análise dos genomas do vírus da varíola dos macacos sugere que ele se espalha precoce e enigmaticamente

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Um novo estudo publicado no servidor de pré-impressão bioRxiv* relata a identificação de um grupo de genomas da linhagem A.2 do vírus da varíola dos macacos de três países que são distintos da linhagem B.1, muito maior, responsável pelo surto atual. Estas observações sugerem que os casos de varíola dos macacos A.2 não fazem parte do atual surto global do vírus da varíola dos macacos em 2022 e, em vez disso, ocorreram através de uma cadeia de transmissão diferente. Aprendizagem: Um claro agrupamento filogenético de genomas da varíola dos macacos sugere uma disseminação precoce e enigmática do vírus. Crédito da foto: joshimerbin / Shutterstock.com Introdução Até recentemente, o vírus da varíola dos macacos era endêmico em vários países da África Central, causando...

Eine neue Studie auf dem Preprint-Server veröffentlicht bioRxiv* berichtet über die Identifizierung einer Gruppe von Genomen der A.2-Linie des Affenpockenvirus aus drei Ländern, die sich von der viel größeren B.1-Linie unterscheiden, die für den aktuellen Ausbruch verantwortlich ist. Diese Beobachtungen deuten darauf hin, dass A.2-Affenpockenfälle nicht Teil des aktuellen weltweiten Ausbruchs des Affenpockenvirus im Jahr 2022 sind und stattdessen über eine andere Übertragungskette aufgetreten sind. Lernen: Ein eindeutiger phylogenetischer Cluster von Affenpocken-Genomen deutet auf eine frühe und kryptische Ausbreitung des Virus hin. Bildnachweis: joshimerbin / Shutterstock.com Einführung Bis vor kurzem war das Affenpockenvirus in mehreren zentralafrikanischen Ländern endemisch und verursachte …
Um novo estudo publicado no servidor de pré-impressão bioRxiv* relata a identificação de um grupo de genomas da linhagem A.2 do vírus da varíola dos macacos de três países que são distintos da linhagem B.1, muito maior, responsável pelo surto atual. Estas observações sugerem que os casos de varíola dos macacos A.2 não fazem parte do atual surto global do vírus da varíola dos macacos em 2022 e, em vez disso, ocorreram através de uma cadeia de transmissão diferente. Aprendizagem: Um claro agrupamento filogenético de genomas da varíola dos macacos sugere uma disseminação precoce e enigmática do vírus. Crédito da foto: joshimerbin / Shutterstock.com Introdução Até recentemente, o vírus da varíola dos macacos era endêmico em vários países da África Central, causando...

A análise dos genomas do vírus da varíola dos macacos sugere que ele se espalha precoce e enigmaticamente

Um novo estudo publicado no servidor de pré-impressão bioRxiv* relata a identificação de um grupo de genomas da linhagem A.2 do vírus da varíola dos macacos de três países que são distintos da linhagem B.1, muito maior, responsável pelo surto atual. Estas observações sugerem que os casos de varíola dos macacos A.2 não fazem parte do atual surto global do vírus da varíola dos macacos em 2022 e, em vez disso, ocorreram através de uma cadeia de transmissão diferente.

Studie: Ein eindeutiger phylogenetischer Cluster von Affenpockengenomen deutet auf eine frühe und kryptische Ausbreitung des Virus hin.  Bildnachweis: joshimerbin / Shutterstock.com

Aprender: Um claro agrupamento filogenético de genomas da varíola dos macacos sugere uma disseminação precoce e enigmática do vírus.Crédito da foto: joshimerbin/Shutterstock.com

introdução

Até recentemente, o vírus da varíola dos macacos era endémico em vários países da África Central e normalmente causava lesões vesiculares únicas ou múltiplas que muitas vezes se resolviam espontaneamente. A infecção pelo vírus da varíola dos macacos já foi associada ao contato com animais selvagens ou com indivíduos sintomáticos infectados.

Desde o início de maio de 2022, o vírus da varíola dos macacos foi identificado em várias regiões não endêmicas do mundo. Estes doentes raramente relataram história de viagens para países endémicos, com aproximadamente 75% a reportar viagens recentes para outro país europeu. Os infectados no actual surto são quase exclusivamente homens que fazem sexo com homens (HSH), sendo que o vírus aparentemente se espalha principalmente através do contacto sexual.

O perfil de sintomas da infecção por varíola dos macacos durante o surto atual também mudou em relação aos fenótipos anteriores, indicando mudanças significativas na biologia do vírus.

A primeira infecção por varíola dos macacos do surto actual foi atribuída a um evento europeu onde o vírus pode ter sido transmitido a muitas pessoas. O vírus espalhou-se então por 75 países, com mais de 20 mil novos casos notificados até ao final de julho. Atualmente, o surto do vírus da varíola dos macacos foi classificado como uma emergência de saúde pública de preocupação internacional pela Organização Mundial da Saúde (OMS).

Como resultado, foi realizada uma maior vigilância genómica e testes moleculares, com vários genomas sequenciados carregados na base de dados da Iniciativa Global sobre Partilha de Todos os Dados da Gripe (GISAID). O genoma da varíola dos macacos consiste em aproximadamente 200 pares de quilobases que abrangem sua fita dupla de ácido desoxirribonucléico (DNA).

Recentemente, nove genomas dos Estados Unidos, Tailândia e Índia de seis isolados clínicos atribuídos a uma linhagem diferente, A.2, foram carregados no GISAID. Esta linhagem consiste em 16 mutações únicas, nove das quais não são sinônimas.

Seguindo o modelo filogenético, pesquisadores do Instituto CSIR de Genômica e Biologia Integrativa (CSIR-IGIB) tentaram estimar o tempo desde o ancestral comum mais recente (tMRCA) desta linhagem.

Resultados do estudo

O tMRCA da linhagem A.2 foi em 25 de junho de 2021. A taxa média de substituições de nucleotídeos foi muito menor do que a da linhagem B.1 em 5,53 x 10-5 em comparação com 1,13 x 10-4 com a taxa de substituição B.1 aumentando.

Portanto, a propagação da linhagem A.2 pode ter começado anos antes do surto no início de 2022, especialmente porque o genoma mais antigo veio de uma amostra recolhida em julho de 2021.

Os genomas analisados ​​no presente estudo vieram de homens que viajaram para os Emirados Árabes Unidos ou para a Nigéria. Isto sugere uma cadeia separada de transmissão entre humanos, sem transmissão zoonótica direta através das fronteiras internacionais. É importante ressaltar que esta propagação não foi reconhecida até o presente estudo.

Esta cadeia de transmissão pode não estar ligada ao grande surto de varíola dos macacos em 2022, que pode ter sido descoberto devido ao aumento da sensibilização, vigilância e maior disponibilidade de diagnósticos.”

Os resultados do estudo destacam a importância da vigilância genómica de todos os agentes patogénicos emergentes para as políticas de saúde pública e o conhecimento epidemiológico.

*NOTA IMPORTANTE

O bioRxiv publica relatórios científicos preliminares que não foram revisados ​​por pares e, portanto, não devem ser considerados conclusivos, orientar a prática clínica/comportamento de saúde ou ser tratados como informações estabelecidas.

Referências:

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