Analiza genomurilor virusului variolei maimuțelor sugerează că acesta se răspândește timpuriu și în mod criptic

Analiza genomurilor virusului variolei maimuțelor sugerează că acesta se răspândește timpuriu și în mod criptic

Un nou studiu publicat pe serverul de preprint bioRxiv* raportează identificarea unui grup de genomi din descendența virusului variolei maimuțelor A.2 din trei țări care sunt distincte de descendența B.1 mult mai mare responsabilă de focarul actual. Aceste observații sugerează că cazurile de variola de maimuță A.2 nu fac parte din focarul global actual al virusului variolei maimuțelor din 2022 și, în schimb, au avut loc printr-un lanț de transmitere diferit.

Învăţa: Un grup filogenetic clar de genomi de variola a maimuței sugerează o răspândire timpurie și criptică a virusului.Credit foto: joshimerbin / Shutterstock.com

introducere

Până de curând, virusul variolei maimuțelor era endemic în mai multe țări din Africa Centrală și, de obicei, provoca leziuni veziculare simple sau multiple, care adesea s-au rezolvat spontan. Infecția cu virusul variolei maimuței a fost anterior asociată cu contactul cu animale sălbatice sau cu indivizi simptomatici infectați.

De la începutul lui mai 2022, virusul variolei maimuțelor a fost identificat în mai multe regiuni non-endemice ale lumii. Acești pacienți au raportat rareori un istoric de călătorie în țări endemice, aproximativ 75% raportând călătorii recente în altă țară europeană. Cei infectați în focarul actual sunt aproape exclusiv bărbați care fac sex cu bărbați (HSH), virusul răspândindu-se aparent în principal prin contact sexual.

Profilul simptomelor infecției cu variola maimuței în timpul focarului actual s-a schimbat, de asemenea, față de fenotipurile anterioare, indicând schimbări semnificative în biologia virusului.

Prima infecție cu variola a maimuței din focarul actual a fost urmărită de un eveniment european în care virusul ar fi putut fi transmis multor oameni. Virusul s-a răspândit apoi în 75 de țări, cu peste 20.000 de cazuri noi raportate până la sfârșitul lunii iulie. În prezent, focarul virusului variolei maimuței a fost clasificat drept o urgență de sănătate publică de interes internațional de către Organizația Mondială a Sănătății (OMS).

Ca rezultat, au fost efectuate supravegheri genomice și teste moleculare sporite, cu mai multe genomi secvențiați încărcat în baza de date a Inițiativei Globale privind Partajarea Toate Datele despre Gripă (GISAID). Genomul variolei maimuțelor constă din aproximativ 200 de perechi de kilobaze care cuprind catena sa dublă de acid dezoxiribonucleic (ADN).

Recent, nouă genomi din Statele Unite ale Americii, Thailanda și India din șase izolate clinice atribuite unei filiații diferite, A.2, au fost încărcate în GISAID. Această filiație constă din 16 mutații unice, dintre care nouă sunt non-sinonime.

Urmând modelul filogenetic, cercetătorii de la Institutul de Genomică și Biologie Integrativă CSIR (CSIR-IGIB) au încercat să estimeze timpul de la cel mai recent strămoș comun (tMRCA) al acestei filiații.

Rezultatele studiului

tMRCA al liniei A.2 a fost la 25 iunie 2021. Rata medie de substituții de nucleotide a fost mult mai mică decât cea a liniei B.1 la 5,53 x 10-5 comparativ cu 1,13 x 10-4 cu rata de substituție B.1 în creștere.

Prin urmare, răspândirea descendenței A.2 poate să fi început cu ani înainte de focar la începutul anului 2022, mai ales că cel mai vechi genom a provenit dintr-o probă colectată în iulie 2021.

Genomul analizat în studiul actual provine de la bărbați care au călătorit în Emiratele Arabe Unite sau Nigeria. Acest lucru sugerează un lanț separat de transmitere între oameni fără transmitere zoonotică directă peste granițele internaționale. Important este că această răspândire nu a fost recunoscută până la studiul actual.

Este posibil ca acest lanț de transmitere să nu fie legat de focarul mare de variolă a maimuțelor din 2022, care ar fi putut fi descoperit datorită creșterii gradului de conștientizare, supraveghere și disponibilitate mai largă a diagnosticelor.”

Rezultatele studiului evidențiază importanța supravegherii genomice a tuturor agenților patogeni emergenti pentru politica de sănătate publică și cunoștințele epidemiologice.

*NOTA importanta

bioRxiv publică rapoarte științifice preliminare care nu au fost revizuite de colegi și, prin urmare, nu ar trebui să fie considerate concludente, să ghideze practica clinică/comportamentul de sănătate sau să fie tratate ca informații stabilite.

Referinte:

• Jolly, B. & Scari, V. (2022). Ein eindeutiger phylogenetischer Cluster von Affenpocken-Genomen deutet auf eine frühe und kryptische Ausbreitung des Virus hin. bioRxiv. doi:10.1101/2022.07.30.502168. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.07.30.502168v1
• Untersuchung des Affenpocken-Ausbruchs in England: Technisches Briefing 1 (2022). Abgerufen von https://www.gov.uk/government/publications/monkeypox-outbreak-technical-briefings/investigation-into-monkeypox-outbreak-in-england-technical-briefing-1. Zugriff am 3. August 2022.

.