Geneetiline signatuur ennustab kasvaja metastaase ja patsiendi ellujäämist selgerakulise neeruvähi korral

Geneetiline signatuur ennustab kasvaja metastaase ja patsiendi ellujäämist selgerakulise neeruvähi korral

Neeruvähiga patsientidel näib nelja spetsiifilise geeni aktiivsus vähirakkudes olevat võimeline ennustama kasvaja leviku ohtu ja patsiendi ellujäämisvõimalusi. Seda näitavad Rootsi Karolinska Instituudi teadlased ajakirjas Nature Communications avaldatud prekliinilises uuringus.

See võib olla vahend haiguse progresseerumise varases staadiumis paremaks mõistmiseks. Suure leviku tõenäosusega vähiprofiiliga patsiente saaks seejärel hoolikamalt jälgida, et kasvaja kasvu kiiresti tuvastada ja ravida.

Ninib Baryawno, Karolinska Instituudi naiste ja laste tervise osakonna vanemteadur ja uuringu viimane autor

Selgerakuline neeruvähk on täiskasvanutel kõige levinum neeruvähi vorm. Kui kasvaja piirdub neeruga, on prognoos sageli soodne, kuid kui see on levinud luustikule, mis esineb ligikaudu kolmandikul patsientidest, on viie aasta elulemus vaid kümne protsendi ringis.

Immunoteraapiad, mida nimetatakse kontrollpunkti inhibiitoriteks, on viimastel aastatel muutunud oluliseks ravimeetodiks selgerakulise neeruvähiga patsientidel. Siiski on tavaline, et vähirakkudel tekib ravile resistentsus, mis on osaliselt tingitud vähirakkude keskkonna teguritest, mida nimetatakse kasvaja mikrokeskkonnaks.

Käesolevas uuringus uurisid teadlased üheksa selgerakulise neeruvähiga patsiendi proove. Uuring on koostöös Karolinska Instituudi teadlaste, Massachusettsi üldhaigla arstide, kuhu patsiendid värvati, ja USA Bostoni Harvardi meditsiinikooli arvutiteadlaste vahel.

Nii kasvajakude kui ka läheduses olev normaalne neerukude koguti samalt patsiendilt, et võimaldada asjakohast võrdlust ja kontrollida indiviididevahelisi erinevusi. Rakke uuriti üherakulise analüüsi abil; sekveneerimistehnika, mis võimaldab uurida iga üksikut rakku koes ja geeniekspressiooni, st millised geenid on üksikutes rakkudes aktiivsed.

Kahe patsiendi puhul võrdlesid teadlased ka primaarset kasvajakudet neerudest skeleti metastaaside kudedega.

Uuring näitab, et neljast spetsiifilisest geenist koosnev geneetiline signatuur ennustab, kas kasvaja levib skeletile ja kas see jääb ellu. Nende geenide (SAA1, SAA2, APOL1 ja MET) samaaegne üleekspressioon viitab sellele, et patsiendil on suurem risk leviva kasvaja tekkeks ja halvem elulemus.

Seos geenisignatuuri ja levimisriski vahel leidis kinnitust ka siis, kui teadlased uurisid luumetastaaside kasvajarakke seitsmel metastaatilise selgerakulise neeruvähiga patsiendil.

Lisaks näitab uuring, et kasvaja mikrokeskkond pärsib immuunsüsteemi ning teadlased pakuvad välja mitmeid võimalikke ravimi sihtmärke, mida võiks edasi uurida. Need tuvastati rakkude interaktsioonide arvutisimulatsioonide abil.

Uuring annab olulisi bioloogilisi teadmisi kasvajarakkude ja nende mikrokeskkonna vahelisest koostoimest selge rakulise neeruvähi korral, väidavad teadlased.

"Loodame, et meie tulemused aitavad kaasa kasvaja mikrokeskkonda mõjutavate tegurite edasisele uurimisele, mis võib lõppkokkuvõttes anda uusi võimalusi vähi retsidiivi ja vähi leviku ravimiseks. Meie jaoks on järgmiseks sammuks uurida, kuidas erinevad metastaasid luuüdis lokaalsest neerukasvajast, aga ka seda, kuidas luuüdi areneb neeruvähiga patsientidel metastaasid luustikus terve luustik. luuüdi. Loodame, et see aitab meil vastata küsimusele, miks immunoteraapia mõne neeruvähiga patsiendi puhul ei tööta, ”ütleb Karolinska Instituudi naiste ja laste tervise osakonna doktorant ja üks uuringu esimesi autoreid Adele Alchahin.

Väljaandes osalevad tehisintellekti uurijad kinnitavad, et neil ei ole võimalikke huvide konflikte. Teistel autoritel on sidemeid erinevate farmaatsia- ja biotehnoloogiaettevõtetega, sealhulgas asutamis- ja nõustamislepingute näol. Lisateabe saamiseks vaadake teaduslikku artiklit.

Uuringut rahastati Bill ja Cheryl Swansoni, Gunther ja Maggie Buermani ning Robert Higginbothami filantroopiliste annetustega. Rootsis läbiviidud uuringuid rahastas Rootsi Vähiliit.

Allikas:

Karolinska Instituut

Viide:

Alkhahin, AM jt. (2022) Transkriptsiooniline metastaatiline signatuur ennustab ellujäämist selgerakulise neerurakulise kartsinoomi korral. Loodussuhtlus. doi.org/10.1038/s41467-022-33375-w.

.