Geneettinen allekirjoitus ennustaa kasvaimen etäpesäkkeitä ja potilaan eloonjäämistä selväsoluisessa munuaissyövässä

Geneettinen allekirjoitus ennustaa kasvaimen etäpesäkkeitä ja potilaan eloonjäämistä selväsoluisessa munuaissyövässä

Munuaissyöpäpotilailla neljän spesifisen geenin aktiivisuus syöpäsoluissa näyttää pystyvän ennustamaan kasvaimen leviämisriskiä ja potilaan selviytymismahdollisuuksia. Näin ruotsalaisen Karolinska Institutetin tutkijat osoittavat Nature Communications -lehdessä julkaistussa prekliinisessä tutkimuksessa.

Tämä voisi olla väline taudin etenemisen ymmärtämiseksi paremmin varhaisessa vaiheessa. Potilaita, joiden syöpäprofiili on suurella todennäköisyydellä leviämistä, voitaisiin sitten seurata tarkemmin, jotta kasvaimen kasvu voidaan havaita ja hoitaa nopeasti."

Ninib Baryawno, vanhempi tutkija, naisten ja lasten terveyden osasto, Karolinska Institutet, ja tutkimuksen lopullinen kirjoittaja

Kirkassoluinen munuaissyöpä on aikuisten munuaissyövän yleisin muoto. Jos kasvain rajoittuu munuaiseen, ennuste on usein suotuisa, mutta jos se on levinnyt luustoon, jota esiintyy noin kolmanneksella potilaista, viiden vuoden eloonjäämisaste on vain kymmenen prosentin luokkaa.

Immunoterapiasta, jota kutsutaan tarkistuspisteen estäjiksi, on viime vuosina tullut tärkeä hoitomuoto potilaille, joilla on selväsoluinen munuaissyöpä. On kuitenkin yleistä, että syöpäsolut kehittävät vastustuskykyä hoidolle, mikä johtuu osittain syöpäsolujen ympäristön tekijöistä, joita kutsutaan kasvaimen mikroympäristöksi.

Tässä tutkimuksessa tutkijat tutkivat näytteitä yhdeksästä potilaasta, joilla oli selväsoluinen munuaissyöpä. Tutkimus on tehty yhteistyössä Karolinska Institutetin tutkijoiden, Massachusettsin yleissairaalan kliinikoiden, johon potilaat rekrytoitiin, ja Harvard Medical Schoolin Bostonissa, USA:ssa olevien tietojenkäsittelytieteilijöiden kesken.

Sekä kasvainkudos että lähellä oleva normaali munuaiskudos kerättiin samalta potilaalta asianmukaisten vertailujen mahdollistamiseksi ja yksilöiden välisten erojen hallitsemiseksi. Solut tutkittiin käyttämällä yksisoluanalyysiä; sekvensointitekniikka, joka mahdollistaa jokaisen yksittäisen kudoksen solun ja geeniekspression tutkimisen, eli mitkä geenit ovat aktiivisia yksittäisissä soluissa.

Kahdella potilaalla tutkijat vertasivat myös munuaisen primaarista kasvainkudosta luuston etäpesäkkeistä peräisin olevaan kudokseen.

Tutkimus osoittaa, että neljästä spesifisestä geenistä koostuva geneettinen allekirjoitus ennustaa, leviääkö kasvain luurankoon ja selviääkö se. Näiden geenien (SAA1, SAA2, APOL1 ja MET) samanaikainen yli-ilmentyminen viittaa siihen, että potilaalla on suurempi riski saada leviävä kasvain ja huonompi eloonjäämistulos.

Geenin allekirjoituksen ja leviämisriskin välinen yhteys vahvistettiin myös, kun tutkijat tutkivat luun etäpesäkkeistä peräisin olevia kasvainsoluja seitsemällä potilaalla, joilla oli metastaattinen kirkassoluinen munuaissyöpä.

Lisäksi tutkimus osoittaa, että kasvaimen mikroympäristö estää immuunijärjestelmää, ja tutkijat ehdottavat useita mahdollisia lääkekohteita, joita voisi olla mielenkiintoista tutkia lisää. Nämä tunnistettiin käyttämällä tietokonesimulaatioita solujen vuorovaikutuksista.

Tutkimus tarjoaa tärkeitä biologisia näkemyksiä kasvainsolujen ja niiden mikroympäristön välisestä vuorovaikutuksesta selkeäsoluisessa munuaissyövässä, tutkijat sanovat.

"Toivomme tulostemme myötävaikuttavan kasvaimen mikroympäristöön vaikuttavien tekijöiden jatkotutkimuksiin, jotka voivat viime kädessä tarjota uusia mahdollisuuksia uusiutumisen ja syövän leviämisen hoitoon. Meille seuraava askel on tutkia, miten luuytimessä olevat etäpesäkkeet eroavat paikallisesta kasvaimesta munuaisessa, mutta myös kuinka luuydin kehittyy munuaissyöpäpotilailla. auttaa meitä vastaamaan kysymykseen, miksi immunoterapia ei toimi joillekin munuaissyöpäpotilaille", sanoo Adele Alchahin, tohtorikandidaatti Karolinska Institutetin naisten ja lasten terveyden osastolta ja yksi tutkimuksen ensimmäisistä tekijöistä.

Julkaisussa mukana olleet tekoälytutkijat ilmoittavat, ettei heillä ole mahdollisia eturistiriitoja. Muilla kirjoittajilla on yhteyksiä erilaisiin lääke- ja bioteknologiayrityksiin, mukaan lukien perustamis- ja konsultointitoimet. Katso lisätietoja tieteellisestä artikkelista.

Tutkimus rahoitettiin hyväntekeväisillä lahjoituksilla Bill ja Cheryl Swansonilta, Gunther ja Maggie Buermanilta sekä Robert Higginbothamilta. Ruotsin tutkimusta rahoitti Ruotsin syöpäyhdistys.

Lähde:

Karolinska-instituutti

Viite:

Alkhahin, AM, et ai. (2022) Transkription metastaattinen allekirjoitus ennustaa selviytymistä selväsoluisessa munuaissolukarsinoomassa. Luontoviestintä. doi.org/10.1038/s41467-022-33375-w.

.