Genetisk signatur forutsier tumormetastase og pasientoverlevelse ved klarcellet nyrekreft

Genetisk signatur forutsier tumormetastase og pasientoverlevelse ved klarcellet nyrekreft

Hos pasienter med nyrekreft ser aktiviteten til fire spesifikke gener i kreftcellene ut til å kunne forutsi risikoen for tumorspredning og pasientens sjanser for å overleve. Det viser forskere fra Karolinska Institutet i Sverige i en preklinisk studie publisert i Nature Communications.

Dette kan potensielt være et verktøy for å bedre forstå sykdomsprogresjonen på et tidlig stadium. Pasienter med en kreftprofil med høy sannsynlighet for spredning kan deretter overvåkes tettere for raskt å oppdage og behandle eventuell tumorvekst."

Ninib Baryawno, seniorforsker, Institutt for kvinner og barns helse, Karolinska Institutet, og siste forfatter av studien

Klarcellet nyrekreft er den vanligste formen for nyrekreft hos voksne. Er svulsten begrenset til nyren, er prognosen ofte gunstig, men har den spredt seg til skjelettet, som forekommer hos rundt en tredjedel av pasientene, er femårsoverlevelsen bare rundt ti prosent.

Immunterapier kalt sjekkpunkthemmere har blitt en viktig behandling for pasienter med klarcellet nyrekreft de siste årene. Det er imidlertid vanlig at kreftceller utvikler resistens mot behandling, blant annet på grunn av faktorer i kreftcellenes miljø, kalt tumormikromiljøet.

I den nåværende studien undersøkte forskere prøver fra ni pasienter med klarcellet nyrekreft. Studien er et samarbeid mellom forskere ved Karolinska Institutet, klinikere ved Massachusetts General Hospital, hvor pasientene ble rekruttert, og informatikere ved Harvard Medical School i Boston, USA.

Både tumorvev og nærliggende normalt nyrevev ble samlet inn fra samme pasient for å tillate passende sammenligninger og for å kontrollere for interindividuelle forskjeller. Cellene ble undersøkt ved bruk av enkeltcelleanalyse; en sekvenseringsteknikk som gjør det mulig å undersøke hver enkelt celle i vevet og genuttrykk, det vil si hvilke gener som er aktive i individuelle celler.

Hos to pasienter sammenlignet forskerne også primært tumorvev fra nyren med vev fra skjelettmetastaser.

Studien viser at en genetisk signatur bestående av fire spesifikke gener er prediktiv for om svulsten vil spre seg til skjelettet og om den vil overleve. Den samtidige overekspresjonen av disse genene (SAA1, SAA2, APOL1 og MET) antyder at pasienten har høyere risiko for å utvikle en spredningssvulst og et dårligere overlevelsesresultat.

Sammenhengen mellom gensignaturen og risikoen for spredning ble også bekreftet da forskere undersøkte tumorceller fra benmetastaser hos syv pasienter med metastatisk klarcellet nyrekreft.

I tillegg viser studien at tumormikromiljøet hemmer immunsystemet, og forskerne foreslår flere mulige medikamentmål som kan være interessante å studere videre. Disse ble identifisert ved hjelp av datasimuleringer av celleinteraksjoner.

Studien gir viktig biologisk innsikt i samspillet mellom tumorceller og deres mikromiljø i klarcellet nyrekreft, sier forskerne.

"Vi håper at resultatene våre vil bidra til videre undersøkelser av faktorer som påvirker svulstens mikromiljø, som til syvende og sist kan gi nye muligheter for å behandle tilbakefall og spredning av kreft. For oss er neste steg å studere hvordan metastaser i benmargen er forskjellig fra den lokale svulsten i nyrene, men også hvordan benmargen utvikler seg hos pasienter med nyrekreft skjelettmarg fra skjelett og skjelett. håper det kan hjelpe oss med å svare på spørsmålet om hvorfor immunterapi ikke virker for noen nyrekreftpasienter, sier Adele Alchahin, doktorgradskandidat ved Institutt for kvinner og barns helse ved Karolinska Institutet og en av de første forfatterne av studien.

AI-forskerne involvert i publikasjonen erklærer at de ikke har noen potensielle interessekonflikter. Andre forfattere har tilknytning til ulike farmasøytiske og bioteknologiske selskaper, blant annet i form av stiftelses- og konsulentoppdrag. For mer informasjon, se den vitenskapelige artikkelen.

Forskningen ble finansiert av filantropiske donasjoner fra Bill og Cheryl Swanson, Gunther og Maggie Buerman og Robert Higginbotham. Forskningen i Sverige ble finansiert av det svenske kreftforeningen.

Kilde:

Karolinska instituttet

Referanse:

Alkhahin, AM, et al. (2022) En transkripsjonell metastatisk signatur forutsier overlevelse i klarcellet nyrecellekarsinom. Naturkommunikasjon. doi.org/10.1038/s41467-022-33375-w.

.