Genetisk signatur förutsäger tumörmetastaser och patientöverlevnad vid klarcellig njurcancer

Genetisk signatur förutsäger tumörmetastaser och patientöverlevnad vid klarcellig njurcancer

Hos patienter med njurcancer verkar aktiviteten hos fyra specifika gener i cancercellerna kunna förutsäga risken för tumörspridning och patientens chanser att överleva. Det visar forskare från Karolinska Institutet i Sverige i en preklinisk studie publicerad i Nature Communications.

Detta kan potentiellt vara ett verktyg för att bättre förstå sjukdomsförloppet i ett tidigt skede. Patienter med en cancerprofil med hög sannolikhet för spridning kunde sedan övervakas närmare för att snabbt upptäcka och behandla eventuell tumörtillväxt."

Ninib Baryawno, senior forskare, Institutionen för kvinnors och barns hälsa, Karolinska Institutet, och slutförfattare till studien

Klarcellig njurcancer är den vanligaste formen av njurcancer hos vuxna. Om tumören är begränsad till njuren är prognosen ofta gynnsam, men om den har spridit sig till skelettet, vilket förekommer hos runt en tredjedel av patienterna, är femårsöverlevnaden bara runt tio procent.

Immunterapier som kallas checkpoint-hämmare har blivit en viktig behandling för patienter med klarcellig njurcancer de senaste åren. Det är dock vanligt att cancerceller utvecklar resistens mot behandling, bland annat på grund av faktorer i cancercellernas miljö, så kallad tumörmikromiljö.

I den aktuella studien undersökte forskare prover från nio patienter med klarcellig njurcancer. Studien är ett samarbete mellan forskare vid Karolinska Institutet, läkare vid Massachusetts General Hospital, dit patienterna rekryterades, och datavetare vid Harvard Medical School i Boston, USA.

Både tumörvävnad och närliggande normal njurvävnad samlades in från samma patient för att möjliggöra lämpliga jämförelser och för att kontrollera interindividuella skillnader. Cellerna undersöktes med användning av encellsanalys; en sekvenseringsteknik som gör det möjligt att undersöka varje enskild cell i vävnaden och genuttryck, det vill säga vilka gener som är aktiva i enskilda celler.

Hos två patienter jämförde forskarna också primär tumörvävnad från njuren med vävnad från skelettmetastaser.

Studien visar att en genetisk signatur som består av fyra specifika gener är förutsägande om tumören kommer att spridas till skelettet och om den kommer att överleva. Det samtidiga överuttrycket av dessa gener (SAA1, SAA2, APOL1 och MET) tyder på att patienten har en högre risk att utveckla en spridande tumör och ett sämre överlevnadsresultat.

Kopplingen mellan gensignaturen och spridningsrisken bekräftades också när forskare undersökte tumörceller från skelettmetastaser hos sju patienter med metastaserad klarcellig njurcancer.

Dessutom visar studien att tumörmikromiljön hämmar immunförsvaret och forskarna föreslår flera möjliga läkemedelsmål som kan vara intressanta att studera vidare. Dessa identifierades med hjälp av datorsimuleringar av cellinteraktioner.

Studien ger viktiga biologiska insikter om interaktionen mellan tumörceller och deras mikromiljö i klarcellig njurcancer, säger forskarna.

"Vi hoppas att våra resultat kommer att bidra till ytterligare undersökningar av faktorer som påverkar tumörens mikromiljö, vilket i slutändan kan ge nya möjligheter att behandla återfall och spridning av cancer. För oss är nästa steg att studera hur metastaser i benmärgen skiljer sig från den lokala tumören i njuren, men också hur benmärgen utvecklas hos patienter med njurcancer skelettet skiljer sig från skeletcancer-märgmärgen. hoppas det kan hjälpa oss att svara på frågan om varför immunterapi inte fungerar för vissa njurcancerpatienter, säger Adele Alchahin, doktorand vid institutionen för kvinnors och barns hälsa vid Karolinska Institutet och en av de första författarna till studien.

AI-forskarna som är involverade i publiceringen förklarar att de inte har några potentiella intressekonflikter. Andra författare har kopplingar till olika läkemedels- och bioteknikföretag, bland annat i form av grundande och konsultuppdrag. För mer information, se den vetenskapliga artikeln.

Forskningen finansierades av filantropiska donationer från Bill och Cheryl Swanson, Gunther och Maggie Buerman och Robert Higginbotham. Forskningen i Sverige finansierades av Cancerfonden.

Källa:

Karolinska Institutet

Hänvisning:

Alkhahin, AM, et al. (2022) En transkriptionell metastaserande signatur förutsäger överlevnad vid klarcellig njurcellscancer. Naturkommunikation. doi.org/10.1038/s41467-022-33375-w.

.