Kiwira viirus: Aafrikas avastati uus nahkhiirte kaudu leviv hantaviirus

Kiwira viirus: Aafrikas avastati uus nahkhiirte kaudu leviv hantaviirus

Hiljutine Viirused Ajakirja uuringus käsitletakse Hantaviridae perekonda kuuluvat Kiwira viirust, sealhulgas selle avastamist, filogeneetilist paigutust ja viiruse ribonukleiinhappe (RNA) jaotumist kudedes.

Õppige: Kiwira viirus, äsja avastatud hantaviirus, mis avastati vabasabalistel nahkhiirtel (Molossidae) Ida- ja Kesk-Aafrikas.Foto krediit: Kateryna Kon / Shutterstock.com

Mis on hantaviirused?

Geneetika ja genoomika e-raamat

Eelmise aasta tippintervjuude, artiklite ja uudiste koostamine. Laadige alla tasuta koopia

Hantaviirustel, mis kuuluvad perekonda Hantaviridae, on kolmesegmendiline RNA genoom. Väike (S) genoomne segment kodeerib nukleokapsiidi (N) valku, keskmine (M) segment aga ümbrise glükoproteiine ja suur (L) genoomne segment kodeerib RNA-sõltuvat RNA polümeraasi.

Mitmed väikesed imetajad võivad kanda hantaviiruseid, millest tähelepanuväärseimad on närilised, millele järgnevad närilised, nahkhiired ja mutid. Inimesi võivad nakatada mitmed hantaviirused, mis kõik pärinevad närilistelt ja kuuluvad ortohantaviiruse perekonda. Inimestel nakatudes põhjustavad hantaviirused palavikku, millele järgnevad neeru- ja hingamisprobleemid, mis võivad lõpuks viia elundipuudulikkuseni.

Nahkhiirte kaudu levivaid hantaviiruseid, mis kuuluvad perekonda Mobatvirus või Loanvirus, on teatatud 14 nahkhiireliigist kogu Aasias, Euroopas ja Aafrikas. Neid viirusi tuleb siiski eraldada ja kasvatada; Seetõttu ei ole nende potentsiaal inimesi nakatada täielikult mõistetav.

Õppimisest

Praeguses uuringus püüti nahkhiired kinni 2017. aastal Kongo Demokraatlikus Vabariigis (KDV) ja Tansaania edelaosas ning seejärel uimastati ja tapeti. Kõikide nahkhiirte sooled, neerud, kopsud, põrn ja maks koguti.

Koeproovid koguti viiruse RNA ekstraheerimiseks ja analüüsimiseks pöördtranskriptsiooni-polümeraasi ahelreaktsiooni (RT-PCR) testiga. Samuti viidi läbi fülogeneetilised analüüsid.

Uuringu tulemused

PCR-analüüs näitas hantaviiruse järjestuste olemasolu kuues 334 nahkhiirest Tansaaniast ja ühes 49st Kongo Demokraatlikust Vabariigist.

Tähelepanuväärne on see, et nii Tansaania kui Kongo Demokraatliku Vabariigi nahkhiirtest eraldatud viirustel oli 98,6% identsus. Suurimat paaridevahelist identiteeti täheldati Quezoni ja Robinia viiruste vahel, vastavalt kuni 82,9% ja 81,4%.

Kõik Tansaaniast saadud hantaviiruspositiivsed nahkhiired olid Molossidae perekonda kuuluvad Angola vabasabalised nahkhiired, tuntud ka kui Mops condylurus. See liik varem teadaolevalt hantaviirusi ei sisalda.

Kuuest Tansaaniast pärit Hantaviirus-positiivsest nahkhiirest oli üks emane ja viis isast. Ainus positiivne nahkhiir Kongo Demokraatlikust Vabariigist oli isane; Selle nahkhiire liiki aga kindlaks teha ei õnnestunud.

Hantaviirusnegatiivsed nahkhiired kuulusid perekondadesse Molossidae (89), Pteropodidae (226), Hipposideridae (1), Rhinolophidae (3) ja Vespertilionidae (39), ülejäänud 18 nahkhiireliiki ei suudetud tuvastada.

Kõik Tansaaniast pärit Hantaviiruspositiivsetelt nahkhiirtelt kogutud koed olid viiruse RNA suhtes positiivsed, välja arvatud üks nahkhiir, mille kops oli ainus selle viiruse suhtes positiivne organ. Nimelt oli kahe nahkhiire põrnas suurim viiruskoormus.

Tansaaniast pärit nahkhiirtel täheldati uudset viirusjärjestust, mida hiljem nimetati Mobatavirus perekonnas Kiwira viiruseks. See avastus teeb Kiwira viirusest neljanda Aafrikas tuvastatud nahkhiirte kaudu levitatava hantaviiruse.

Uue Kiwira viiruse täielikke nukleokapsiidi ja glükoproteiini prekursorite aminohappejärjestusi ei õnnestunud edasiseks analüüsiks saada. Kiwira viiruse lähimate sugulaste hulka kuuluvad Robina ja Quezoni viirused.

Kiwira viirusega nakatunud nahkhiirtel ilmnes süsteemne infektsioon, sealhulgas nende neerude ja soolte haaratus. Seetõttu on tõenäoline, et hantaviirus võib erituda nii uriini kui ka väljaheitega.

Järeldused

M. condylurus nahkhiired ringlevad kogu Aafrikas, sageli hoonetes ja õõnespuudes ning troopiliste ja savannipiirkondade erinevates osades Lääne-Aafrika riikidest Ida-Aafrikani. Lisaks nende nahkhiirte laialdasele levikule kogu Aafrikas tekitab selles uuringus püütud nahkhiirte lähedus inimasustustele muret, et Kiwira viirus võib levida ka inimestele.

Kuigi näib, et hantaviirused ei põhjusta inimestel haigusi, võib nende võime põhjustada palavikuga haigusi, mis on teiste infektsioonidega ühine sümptom, põhjustada nende nakatumise tähelepanuta jätmise. Seetõttu on oluline täiustada täpsete seroloogiliste analüüside väljatöötamist, mida saab kasutada hantaviirustega nakatumise kinnitamiseks.

Viide:

• Weiss, S., Sudi, LE, Düx, A., et al. (2022). Kiwira-Virus, ein neu entdecktes Hantavirus, das in Freischwanzfledermäusen (Molossidae) in Ost- und Zentralafrika entdeckt wurde. Viren. doi:10.3390/v14112368

.