Iznenađujuće otkriće kod ljudi polinezijskog podrijetla nudi tragove genetske osnove visokog kolesterola
Otkriće genetske varijante koja je relativno česta kod ljudi polinezijskog podrijetla, ali nevjerojatno rijetka u većini drugih populacija, daje tragove genetskoj osnovi visokog kolesterola kod svih ljudi, prema novoj studiji genetičara Škole javnog zdravlja Sveučilišta u Pittsburghu u suradnji s nekoliko drugih grupa, uključujući Sveučilište Otago i Samoansku zajednicu za istraživanje zdravlja. Iznenađujuće otkriće, objavljeno ovaj tjedan u časopisu Human Genetics and Genomics Advances, pokazuje važnost osiguravanja raznolikosti u genetskim bazama podataka. Da smo samo proučavali populacije europskog podrijetla, imali bismo ovo...

Iznenađujuće otkriće kod ljudi polinezijskog podrijetla nudi tragove genetske osnove visokog kolesterola
Otkriće genetske varijante koja je relativno česta kod ljudi polinezijskog podrijetla, ali nevjerojatno rijetka u većini drugih populacija, daje tragove genetskoj osnovi visokog kolesterola kod svih ljudi, prema novoj studiji genetičara Škole javnog zdravlja Sveučilišta u Pittsburghu u suradnji s nekoliko drugih grupa, uključujući Sveučilište Otago i Samoansku zajednicu za istraživanje zdravlja.
Iznenađujuće otkriće, objavljeno ovaj tjedan u časopisu Human Genetics and Genomics Advances, pokazuje važnost osiguravanja raznolikosti u genetskim bazama podataka.
Da smo samo ispitivali populacije s europskim podrijetlom, možda bismo u potpunosti propustili ovo otkriće. Zahvaljujući velikodušnosti tisuća Polinežana, uspjeli smo pronaći ovu varijantu, koja je ključni dokaz za nova istraživanja biologije iza kolesterola.”
Jenna Carlson, Ph.D., glavna autorica, docentica ljudske genetike i biostatistike, Pitt Public Health
Visoki kolesterol vodeći je uzrok opterećenja bolestima u zemljama svih razina dohotka, čimbenik rizika za srčane bolesti i moždani udar, te uzrokuje procijenjenih 2,6 milijuna smrti diljem svijeta godišnje, prema Svjetskoj zdravstvenoj organizaciji.
Carlson i njezin tim osmislili su svoju studiju kako bi ispitali signal koji se pojavio u velikom istraživanju cijelog genoma tražeći gene povezane s lipidima ili mastima u tijelu. Pretpostavlja se da bi varijanta gena na kromosomu 5 mogla biti povezana s kolesterolom. Tim je krenuo u "fino mapiranje" regije korištenjem genetskih podataka od 2851 odraslih Samoanaca iz studijske grupe za pretilost, način života i genetske prilagodbe (OLAGA, što znači "život" na samoanskom), koji su također dali zdravstvene informacije, uključujući i lipidne ploče. Kako bi još jednom provjerili nalaz, tim je tražio vezu kod 3276 drugih Polinežana iz Samoe, Američke Samoe i Aotearoe, Novog Zelanda, i pronašli su istu vezu između varijante i kolesterola.
Koristeći podatke sudionika Zapadne Polinezije i Samoa, tim je uspio popuniti informacije koje nedostaju oko regije koja ih je zanimala na kromosomu 5. To ih je dovelo do BTNL9 – gena koji kontrolira proizvodnju proteina BTNL9. Obično proteini signaliziraju stanicama da izvrše radnje, iako znanstvenici još nisu opisali točnu ulogu proteina BTNL9.
Ispostavilo se da su Polinežani s niskim HDL "dobrim" kolesterolom i visokim razinama triglicerida imali "stop-gain" varijantu BTNL9, što znači da je gen dobio upute da zaustavi svoju zadaću proizvodnje proteina, što je jaka indikacija da je protein BTNL9 uključen u pomaganje stanicama da održe zdrave kako bi podržale razinu kolesterola.
"Ne znamo puno o ovoj varijanti jer se ne pojavljuje u objavljenim referencama genoma, koje pretjerano predstavljaju pojedince europskog podrijetla - praktički je nema u populacijama europskog podrijetla, vrlo je rijetka u Južnoj Aziji, a čak nije ni osobito česta u istočnoj Aziji." "Polinežani poput Maora koji žive u Aotearoi na Novom Zelandu", rekao je Carlson. "Ali način na koji je povezan s lipidnim pločama samoanske populacije govori nam da je ovaj gen važan za razine kolesterola, što prije nismo znali. Daljnjim istraživanjem BTNL9 možda ćemo jednog dana otkriti nove načine kako svima pomoći da održe zdravu razinu kolesterola."
Izvor:
Referenca:
Carlson, J.C., et al. (2022) Varijanta stop-gain kod BTNL9 povezana je s aterogenim lipidnim profilima. Napredak ljudske genetike i genomike. doi.org/10.1016/j.xhgg.2022.100155.
.