Pārsteidzošs atklājums polinēziešu izcelsmes cilvēkiem sniedz norādes uz augsta holesterīna līmeņa ģenētisko pamatu

Pārsteidzošs atklājums polinēziešu izcelsmes cilvēkiem sniedz norādes uz augsta holesterīna līmeņa ģenētisko pamatu

Ģenētiskā varianta atklāšana, kas ir salīdzinoši izplatīta polinēziešu izcelsmes cilvēkiem, bet neticami reti sastopama lielākajā daļā citu populāciju, sniedz norādes uz augsta holesterīna līmeņa ģenētisko pamatu visiem cilvēkiem, saskaņā ar jauno Pitsburgas Universitātes Sabiedrības veselības skolas ģenētiķu pētījumu sadarbībā ar vairākām citām grupām, tostarp Otago Universitāti un Samoa Veselības pētniecības kopienu.

Pārsteidzošais atklājums, kas šonedēļ publicēts žurnālā Human Genetics and Genomics Advances, parāda, cik svarīgi ir nodrošināt ģenētisko datu bāzu daudzveidību.

Ja mēs būtu pētījuši tikai populācijas ar Eiropas senčiem, mēs, iespējams, būtu palaiduši garām šo atradumu. Pateicoties tūkstošiem polinēziešu dāsnumam, mēs varējām atrast šo variantu, kas ir būtisks pierādījums jauniem pētījumiem par holesterīna bioloģiju.

Dženna Karlsone, Ph.D., vadošā autore, cilvēka ģenētikas un biostatistikas docente, Pitt Public Health

Augsts holesterīna līmenis ir galvenais slimību sloga cēlonis valstīs ar visu ienākumu līmeni, sirds slimību un insultu riska faktors, un saskaņā ar Pasaules Veselības organizācijas datiem ik gadu pasaulē mirst 2,6 miljoni cilvēku.

Carlson un viņas komanda izstrādāja savu pētījumu, lai pārbaudītu signālu, kas parādījās lielā genoma mēroga aptaujā, meklējot gēnus, kas saistīti ar lipīdiem vai taukiem organismā. Ir ierosināts, ka gēna variants 5. hromosomā var būt saistīts ar holesterīnu. Komanda nolēma "precīzi kartēt" reģionu, izmantojot ģenētiskos datus no 2851 Samoa pieaugušā no aptaukošanās, dzīvesveida un ģenētiskās adaptācijas (OLAGA, kas nozīmē "dzīve" Samoa valodā) pētījuma grupas, kuri bija arī snieguši informāciju par veselību, tostarp lipīdu paneļus. Lai vēlreiz pārbaudītu atradumu, komanda meklēja saikni 3276 citos polinēziešiem no Samoa, Amerikas Samoa un Aotearoa, Jaunzēlandē, un viņi atrada tādu pašu saikni starp variantu un holesterīnu.

Izmantojot Rietumpolinēzijas un Samoa dalībnieku datus, komanda varēja aizpildīt trūkstošo informāciju ap viņu interesējošo reģionu 5. hromosomā. Tas viņus noveda pie BTNL9 — gēna, kas kontrolē BTNL9 proteīna ražošanu. Parasti proteīni signalizē šūnām veikt darbības, lai gan zinātnieki vēl nav raksturojuši precīzu BTNL9 proteīna lomu.

Izrādījās, ka polinēziešiem ar zemu ABL "labā" holesterīna un augstu triglicerīdu līmeni bija "stop-gain" variants BTNL9, kas nozīmē, ka gēnam tika uzdots pārtraukt olbaltumvielu ražošanas uzdevumu, kas liecina, ka BTNL9 proteīns ir iesaistīts palīdzot šūnām uzturēt veselību, lai uzturētu holesterīna līmeni.

"Mēs neko daudz nezinām par šo variantu, jo tas neparādās publicētajās genoma atsaucēs, kas pārsvarā atspoguļo Eiropas senču indivīdus - tas praktiski nav sastopams Eiropas senču populācijās, ir ļoti reti sastopams Dienvidāzijas iedzīvotājiem un nav pat īpaši izplatīts Austrumāzijā." "Polinēziešiem, piemēram, maori, kuri dzīvo Aotearoā, Jaunzēlandē," sacīja Karlsons. "Bet veids, kā tas ir saistīts ar Samoa populācijas lipīdu paneļiem, liecina, ka šis gēns ir svarīgs holesterīna līmenim, ko mēs iepriekš nezinājām. Turpinot pētot BTNL9, mēs kādu dienu varam atklāt jaunus veidus, kā palīdzēt ikvienam uzturēt veselīgu holesterīna līmeni."

Avots:

Pitsburgas Universitāte

Atsauce:

Carlson, J.C., et al. (2022) Stop-gain variants BTNL9 ir saistīts ar aterogēniem lipīdu profiliem. Cilvēka ģenētikas un genomikas sasniegumi. doi.org/10.1016/j.xhgg.2022.100155.

.