Overraskende oppdagelse hos mennesker av polynesisk avstamning gir ledetråder til det genetiske grunnlaget for høyt kolesterol

Overraskende oppdagelse hos mennesker av polynesisk avstamning gir ledetråder til det genetiske grunnlaget for høyt kolesterol

Oppdagelsen av en genetisk variant som er relativt vanlig hos mennesker av polynesisk avstamning, men som er utrolig sjelden i de fleste andre populasjoner, gir ledetråder til det genetiske grunnlaget for høyt kolesterol hos alle mennesker, ifølge en ny studie utført av genetikere ved University of Pittsburgh School of Public Health i samarbeid med flere andre grupper, inkludert University of Otago og Samoan Health Research Community.

Det overraskende funnet, publisert denne uken i tidsskriftet Human Genetics and Genomics Advances, viser viktigheten av å sikre mangfold i genetiske databaser.

Hvis vi bare hadde undersøkt populasjoner med europeiske aner, kunne vi ha gått glipp av dette funnet helt. Takket være generøsiteten til tusenvis av polynesiere, klarte vi å finne denne varianten, som er avgjørende bevis for ny forskning på biologien bak kolesterol.»

Jenna Carlson, Ph.D., hovedforfatter, assisterende professor i human genetikk og biostatistikk, Pitt Public Health

Høyt kolesterol er en ledende årsak til sykdomsbyrde i land med alle inntektsnivåer, en risikofaktor for hjertesykdom og hjerneslag, og forårsaker anslagsvis 2,6 millioner dødsfall på verdensbasis årlig, ifølge Verdens helseorganisasjon.

Carlson og teamet hennes designet sin studie for å undersøke et signal som dukket opp i en stor genomomfattende undersøkelse på jakt etter gener assosiert med lipider, eller fett, i kroppen. Det har blitt antydet at en genvariant på kromosom 5 kan være knyttet til kolesterol. Teamet satte seg fore å "fine kart" regionen ved å bruke genetiske data fra 2851 samoanske voksne fra studiegruppen Obesity, Lifestyle, And Genetic Adaptations (OLAGA, som betyr "livet" på samoansk), som også hadde gitt helseinformasjon, inkludert lipidpaneler. For å dobbeltsjekke funnet, så teamet etter koblingen hos 3276 andre polynesiere fra Samoa, Amerikansk Samoa og Aotearoa, New Zealand, og de fant den samme koblingen mellom varianten og kolesterol.

Ved å bruke data fra de vestpolynesisk-samoanske deltakerne, klarte teamet å fylle ut den manglende informasjonen rundt regionen de var interessert i på kromosom 5. Dette førte dem til BTNL9 – et gen som kontrollerer produksjonen av BTNL9-proteinet. Normalt signaliserer proteiner celler til å utføre handlinger, selv om forskere ennå ikke har karakterisert den nøyaktige rollen til BTNL9-proteinet.

Det viste seg at polynesiske mennesker med lavt HDL "gode" kolesterol og høye triglyseridnivåer hadde en "stop-gain"-variant i BTNL9, noe som betyr at genet ble instruert om å stoppe proteinproduksjonsoppgaven, en sterk indikasjon på at BTNL9-proteinet er involvert i å hjelpe cellene med å holde seg friske for å støtte kolesterolnivået.

"Vi vet ikke så mye om denne varianten fordi den ikke vises i publiserte genomreferanser, som overrepresenterer individer av europeisk aner – den er praktisk talt fraværende i populasjoner av europeiske aner, er svært sjelden i sør-asiater, og er ikke engang spesielt vanlig i Øst-Asia." "Polynesiske folk liker maoriene som bor i Aotearoa, New Zealand," sa Carlson. "Men måten det er knyttet til lipidpanelene i den samoanske befolkningen forteller oss at dette genet er viktig for kolesterolnivået, som vi ikke visste fra før. Ved å forske videre på BTNL9, kan vi en dag oppdage nye måter å hjelpe alle med å opprettholde sunne kolesterolnivåer."

Kilde:

University of Pittsburgh

Referanse:

Carlson, J.C., et al. (2022) En stop-gain-variant i BTNL9 er assosiert med aterogene lipidprofiler. Fremskritt innen menneskelig genetikk og genomikk. doi.org/10.1016/j.xhgg.2022.100155.

.