Zaskakujące odkrycie przeprowadzone u osób pochodzenia polinezyjskiego dostarcza wskazówek na temat genetycznego podłoża wysokiego cholesterolu
Jak wynika z nowego badania przeprowadzonego przez genetyków ze Szkoły Zdrowia Publicznego Uniwersytetu w Pittsburghu we współpracy z kilkoma innymi grupami, w tym z Uniwersytetem Otago i Samoańską Wspólnotą Badań nad Zdrowiem, odkrycie wariantu genetycznego, który jest stosunkowo powszechny u osób pochodzenia polinezyjskiego, ale niezwykle rzadki w większości innych populacji, dostarcza wskazówek na temat genetycznych podstaw wysokiego poziomu cholesterolu u wszystkich ludzi. Zaskakujące odkrycie, opublikowane w tym tygodniu w czasopiśmie Human Genetics and Genomics Advances, pokazuje, jak ważne jest zapewnienie różnorodności w genetycznych bazach danych. Gdybyśmy badali tylko populacje o europejskim pochodzeniu, mielibyśmy to...

Zaskakujące odkrycie przeprowadzone u osób pochodzenia polinezyjskiego dostarcza wskazówek na temat genetycznego podłoża wysokiego cholesterolu
Jak wynika z nowego badania przeprowadzonego przez genetyków ze Szkoły Zdrowia Publicznego Uniwersytetu w Pittsburghu we współpracy z kilkoma innymi grupami, w tym z Uniwersytetem Otago i Samoańską Wspólnotą Badań nad Zdrowiem, odkrycie wariantu genetycznego, który jest stosunkowo powszechny u osób pochodzenia polinezyjskiego, ale niezwykle rzadki w większości innych populacji, dostarcza wskazówek na temat genetycznych podstaw wysokiego poziomu cholesterolu u wszystkich ludzi.
Zaskakujące odkrycie, opublikowane w tym tygodniu w czasopiśmie Human Genetics and Genomics Advances, pokazuje, jak ważne jest zapewnienie różnorodności w genetycznych bazach danych.
Gdybyśmy zbadali jedynie populacje o europejskim pochodzeniu, moglibyśmy całkowicie przeoczyć to odkrycie. Dzięki hojności tysięcy Polinezyjczyków udało nam się znaleźć ten wariant, który stanowi kluczowy dowód dla nowych badań nad biologią stojącą za cholesterolem”.
Jenna Carlson, doktor, główna autorka, adiunkt genetyki człowieka i biostatystyki, Pitt Public Health
Według Światowej Organizacji Zdrowia wysoki poziom cholesterolu jest główną przyczyną obciążenia chorobami w krajach o każdym poziomie dochodów, jest czynnikiem ryzyka chorób serca i udaru mózgu i jest przyczyną szacunkowo 2,6 miliona zgonów rocznie na całym świecie.
Carlson i jej zespół zaprojektowali swoje badania w celu zbadania sygnału, który pojawił się w dużym badaniu obejmującym cały genom, mającym na celu poszukiwanie genów związanych z lipidami, czyli tłuszczami w organizmie. Sugerowano, że wariant genu na chromosomie 5 może być powiązany z cholesterolem. Zespół postanowił „dokładnie zmapować” region, korzystając z danych genetycznych pochodzących od 2851 dorosłych Samoańczyków z grupy badawczej zajmującej się otyłością, stylem życia i adaptacjami genetycznymi (OLAGA, co w języku samoańskim oznacza „życie”), którzy dostarczyli również informacji zdrowotnych, w tym paneli lipidowych. Aby dokładnie sprawdzić to odkrycie, zespół poszukał powiązania u 3276 innych Polinezyjczyków z Samoa w Samoa Amerykańskim i Aotearoa w Nowej Zelandii i odkrył to samo powiązanie między tym wariantem a cholesterolem.
Korzystając z danych uzyskanych od uczestników badania z Polinezji Zachodniej i Samoa, zespół był w stanie uzupełnić brakujące informacje dotyczące interesującego ich regionu na chromosomie 5. To doprowadziło ich do BTNL9 – genu kontrolującego produkcję białka BTNL9. Zwykle białka sygnalizują komórkom wykonanie działań, chociaż naukowcy nie scharakteryzowali jeszcze dokładnej roli białka BTNL9.
Okazało się, że Polinezyjczycy z niskim poziomem „dobrego” cholesterolu HDL i wysokim poziomem trójglicerydów mieli wariant „stop-gain” w BTNL9, co oznacza, że gen otrzymał polecenie wstrzymania produkcji białka, co stanowi silną wskazówkę, że białko BTNL9 bierze udział w pomaganiu komórkom w utrzymaniu zdrowego poziomu cholesterolu.
„Niewiele wiemy o tym wariancie, ponieważ nie pojawia się on w opublikowanych źródłach dotyczących genomu, które stanowią nadreprezentację osobników o europejskim pochodzeniu – jest praktycznie nieobecny w populacjach pochodzenia europejskiego, występuje bardzo rzadko u mieszkańców Azji Południowej i nie jest nawet szczególnie powszechny w Azji Wschodniej”. „Polinezyjczycy, tacy jak Maorysi mieszkający w Aotearoa w Nowej Zelandii” – powiedział Carlson. „Ale sposób, w jaki jest on powiązany z panelami lipidowymi populacji Samoa, mówi nam, że gen ten jest ważny dla poziomu cholesterolu, o czym wcześniej nie wiedzieliśmy. Dalsze badania BTNL9 mogą pewnego dnia odkryć nowe sposoby pomocy każdemu w utrzymaniu zdrowego poziomu cholesterolu”.
Źródło:
Odniesienie:
Carlson, J.C. i in. (2022) Wariant stop-gain w BTNL9 jest powiązany z aterogennymi profilami lipidowymi. Postępy w genetyce i genomice człowieka. doi.org/10.1016/j.xhgg.2022.100155.
.