Prekvapivý objav u ľudí polynézskeho pôvodu ponúka vodítka ku genetickému základu vysokého cholesterolu

Prekvapivý objav u ľudí polynézskeho pôvodu ponúka vodítka ku genetickému základu vysokého cholesterolu

Objav genetického variantu, ktorý je relatívne bežný u ľudí polynézskeho pôvodu, ale neuveriteľne zriedkavý vo väčšine ostatných populácií, poskytuje kľúče ku genetickému základu vysokého cholesterolu u všetkých ľudí, podľa novej štúdie genetikov Univerzity v Pittsburghu School of Public Health v spolupráci s niekoľkými ďalšími skupinami, vrátane University of Otago a Samoan Health Research Community.

Prekvapivé zistenie, publikované tento týždeň v časopise Human Genetics and Genomics Advances, ukazuje dôležitosť zabezpečenia diverzity v genetických databázach.

Ak by sme skúmali len populácie s európskymi predkami, možno by nám toto zistenie úplne uniklo. Vďaka štedrosti tisícov Polynézanov sa nám podarilo nájsť tento variant, ktorý je kľúčovým dôkazom pre nový výskum biológie za cholesterolom.“

Jenna Carlson, Ph.D., hlavná autorka, odborná asistentka ľudskej genetiky a bioštatistiky, Pitt Public Health

Vysoký cholesterol je hlavnou príčinou chorobnej záťaže v krajinách všetkých úrovní príjmov, rizikovým faktorom srdcových chorôb a mŕtvice a podľa Svetovej zdravotníckej organizácie spôsobuje celosvetovo odhadom 2,6 milióna úmrtí ročne.

Carlson a jej tím navrhli svoju štúdiu tak, aby preskúmala signál, ktorý sa objavil vo veľkom genómovom prieskume, ktorý hľadal gény spojené s lipidmi alebo tukmi v tele. Bolo navrhnuté, že génový variant na chromozóme 5 môže byť spojený s cholesterolom. Tím sa rozhodol „jemne zmapovať“ región pomocou genetických údajov od 2 851 dospelých Samoa zo študijnej skupiny Obezita, životný štýl a genetické úpravy (OLAGA, čo znamená „život“ v Samoa), ktorí poskytli aj zdravotné informácie vrátane lipidových panelov. Na dvojitú kontrolu zistenia tím hľadal spojenie u 3 276 ďalších Polynézanov zo Samoy, Americkej Samoy a Aotearoa na Novom Zélande a našli rovnaké spojenie medzi variantom a cholesterolom.

Pomocou údajov od účastníkov zo západnej Polynézsko-Samojskej republiky sa tímu podarilo doplniť chýbajúce informácie o oblasti, ktorá ich zaujímala na chromozóme 5. To ich priviedlo k BTNL9 – génu, ktorý riadi produkciu proteínu BTNL9. Za normálnych okolností proteíny signalizujú bunkám, aby vykonali akcie, hoci vedci ešte nedefinovali presnú úlohu proteínu BTNL9.

Ukázalo sa, že polynézski ľudia s nízkym HDL „dobrým“ cholesterolom a vysokými hladinami triglyceridov mali v BTNL9 variant „stop-gain“, čo znamená, že gén bol inštruovaný, aby zastavil svoju úlohu produkcie proteínov, čo je silný náznak toho, že proteín BTNL9 sa podieľa na udržiavaní zdravých buniek na podporu hladín cholesterolu.

"O tomto variante toho veľa nevieme, pretože sa nevyskytuje v publikovaných genómových referenciách, ktoré nadmerne zastupujú jedincov európskeho pôvodu - v populáciách európskeho pôvodu sa prakticky nevyskytuje, u Juhoázijčanov je veľmi zriedkavý a vo východnej Ázii dokonca nie je obzvlášť bežný." "Polynézski ľudia ako Maori, ktorí žijú v Aotearoa na Novom Zélande," povedal Carlson. "Ale spôsob, akým je spojený s lipidovými panelmi samojskej populácie, nám hovorí, že tento gén je dôležitý pre hladinu cholesterolu, čo sme predtým nevedeli. Pri ďalšom skúmaní BTNL9 možno jedného dňa objavíme nové spôsoby, ako pomôcť každému udržať si zdravé hladiny cholesterolu."

Zdroj:

University of Pittsburgh

Referencia:

Carlson, J.C., a kol. (2022) Variant stop-gain v BTNL9 je spojený s aterogénnymi lipidovými profilmi. Pokroky v ľudskej genetike a genomike. doi.org/10.1016/j.xhgg.2022.100155.

.