Presenetljivo odkritje pri ljudeh polinezijskega porekla ponuja namige o genetski osnovi visokega holesterola

Presenetljivo odkritje pri ljudeh polinezijskega porekla ponuja namige o genetski osnovi visokega holesterola

Odkritje genetske variante, ki je razmeroma pogosta pri ljudeh polinezijskega porekla, vendar neverjetno redka pri večini drugih populacij, zagotavlja namige za genetsko osnovo visokega holesterola pri vseh ljudeh, glede na novo študijo genetikov Šole za javno zdravje Univerze v Pittsburghu v sodelovanju z več drugimi skupinami, vključno z Univerzo v Otagu in Samoansko skupnostjo za raziskave zdravja.

Presenetljiva ugotovitev, objavljena ta teden v reviji Human Genetics and Genomics Advances, kaže na pomen zagotavljanja raznolikosti v genetskih zbirkah podatkov.

Če bi pregledali samo populacije z evropskim poreklom, bi to ugotovitev morda povsem zgrešili. Zahvaljujoč velikodušnosti tisočih Polinezijcev smo lahko našli to različico, ki je ključen dokaz za nove raziskave biologije za holesterolom.«

Jenna Carlson, doktorica znanosti, glavna avtorica, docentka za humano genetiko in biostatistiko, Pitt Public Health

Visok holesterol je vodilni vzrok bremena bolezni v državah z vsemi stopnjami dohodka, dejavnik tveganja za bolezni srca in možgansko kap ter po podatkih Svetovne zdravstvene organizacije povzroči približno 2,6 milijona smrti po vsem svetu letno.

Carlson in njena ekipa so svojo študijo zasnovali, da bi preučili signal, ki se je pojavil v veliki raziskavi celotnega genoma, ki je iskala gene, povezane z lipidi ali maščobami v telesu. Predlagano je bilo, da je različica gena na kromosomu 5 morda povezana s holesterolom. Ekipa se je odločila "natančno preslikati" regijo z uporabo genetskih podatkov 2.851 odraslih samoancev iz študijske skupine za debelost, življenjski slog in genetske prilagoditve (OLAGA, kar v samoanščini pomeni "življenje"), ki so prav tako zagotovili zdravstvene informacije, vključno z lipidnimi ploščami. Da bi ponovno preverili ugotovitev, je ekipa iskala povezavo pri 3276 drugih Polinezijcih iz Samoe, Ameriške Samoe in Aotearoe, Nova Zelandija, in našli so enako povezavo med različico in holesterolom.

Z uporabo podatkov udeležencev iz Zahodne Polinezije in Samoa je ekipa lahko zapolnila manjkajoče informacije v regiji, ki jih je zanimala na kromosomu 5. To jih je pripeljalo do BTNL9 – gena, ki nadzoruje proizvodnjo proteina BTNL9. Običajno proteini signalizirajo celicam, da izvajajo dejanja, čeprav znanstveniki še niso opredelili natančne vloge proteina BTNL9.

Izkazalo se je, da so imeli Polinezijci z nizkim "dobrim" holesterolom HDL in visokimi ravnmi trigliceridov različico "stop-gain" v BTNL9, kar pomeni, da je bilo genu naročeno, naj ustavi svojo nalogo proizvodnje beljakovin, kar je močan znak, da je beljakovina BTNL9 vpletena v pomoč celicam pri ohranjanju zdravja za vzdrževanje ravni holesterola.

"O tej različici ne vemo veliko, ker se ne pojavlja v objavljenih referencah genoma, ki preveč zastopajo posameznike evropskega porekla - praktično je odsoten v populacijah evropskega porekla, je zelo redek v Južni Aziji in niti ni posebej pogost v vzhodni Aziji." "Polinezijci, kot so Māori, ki živijo v Aotearoi na Novi Zelandiji," je dejal Carlson. "Toda način, kako je povezan z lipidnimi ploščami samoanskega prebivalstva, nam pove, da je ta gen pomemben za raven holesterola, česar prej nismo vedeli. Z nadaljnjim raziskovanjem BTNL9 bomo morda nekega dne odkrili nove načine, kako vsem pomagati vzdrževati zdravo raven holesterola."

Vir:

Univerza v Pittsburghu

Referenca:

Carlson, J.C., et al. (2022) Varianta stop-gain pri BTNL9 je povezana z aterogenimi lipidnimi profili. Napredek v človeški genetiki in genomiki. doi.org/10.1016/j.xhgg.2022.100155.

.