Överraskande upptäckt hos människor av polynesisk härkomst ger ledtrådar till den genetiska grunden för högt kolesterol

Överraskande upptäckt hos människor av polynesisk härkomst ger ledtrådar till den genetiska grunden för högt kolesterol

Upptäckten av en genetisk variant som är relativt vanlig hos människor av polynesisk härkomst men otroligt sällsynt i de flesta andra populationer ger ledtrådar till den genetiska grunden för högt kolesterol hos alla människor, enligt en ny studie från University of Pittsburgh School of Public Health genetiker i samarbete med flera andra grupper, inklusive University of Otago och Samoan Health Research Community.

Det överraskande fyndet, som publicerades denna vecka i tidskriften Human Genetics and Genomics Advances, visar vikten av att säkerställa mångfald i genetiska databaser.

Om vi ​​bara hade undersökt populationer med europeisk härkomst, hade vi kanske missat detta fynd helt. Tack vare tusentals polynesiers generositet kunde vi hitta denna variant, som är avgörande bevis för ny forskning om biologin bakom kolesterol."

Jenna Carlson, Ph.D., huvudförfattare, biträdande professor i human genetik och biostatistik, Pitt Public Health

Högt kolesterol är en ledande orsak till sjukdomsbördan i länder med alla inkomstnivåer, en riskfaktor för hjärtsjukdomar och stroke, och orsakar uppskattningsvis 2,6 miljoner dödsfall över hela världen årligen, enligt Världshälsoorganisationen.

Carlson och hennes team designade sin studie för att undersöka en signal som framkom i en stor genomomfattande undersökning som letade efter gener associerade med lipider, eller fetter, i kroppen. Det har föreslagits att en genvariant på kromosom 5 kan vara kopplad till kolesterol. Teamet satte sig för att "finkarta" regionen med hjälp av genetiska data från 2 851 samoanska vuxna från studiegruppen Obesity, Lifestyle, And Genetic Adaptations (OLAGA, som betyder "liv" på samoanska), som också hade tillhandahållit hälsoinformation, inklusive lipidpaneler. För att dubbelkolla upptäckten letade teamet efter länken hos 3 276 andra polynesier från Samoa, Amerikanska Samoa och Aotearoa, Nya Zeeland, och de hittade samma koppling mellan varianten och kolesterol.

Med hjälp av data från de västpolynesiska-samoanska deltagarna kunde teamet fylla i den saknade informationen kring regionen de var intresserade av på kromosom 5. Detta ledde dem till BTNL9 – en gen som styr produktionen av BTNL9-proteinet. Normalt signalerar proteiner celler att utföra åtgärder, även om forskare ännu inte har karakteriserat den exakta rollen för BTNL9-proteinet.

Det visade sig att polynesiska personer med lågt HDL "bra" kolesterol och höga triglyceridnivåer hade en "stop-gain" variant i BTNL9, vilket betyder att genen instruerades att stoppa sin proteinproduktionsuppgift, en stark indikation på att BTNL9-proteinet är involverat i att hjälpa celler att hålla sig friska för att stödja kolesterolnivåerna.

"Vi vet inte så mycket om den här varianten eftersom den inte förekommer i publicerade genomreferenser, som överrepresenterar individer av europeisk härkomst - den är praktiskt taget frånvarande i populationer av europeisk härkomst, är mycket sällsynt hos sydasiater och är inte ens särskilt vanlig i Östasien." "Polynesiska människor gillar maorierna som bor i Aotearoa, Nya Zeeland," sa Carlson. "Men sättet som det är kopplat till lipidpanelerna i den samoanska befolkningen säger oss att den här genen är viktig för kolesterolnivåerna, vilket vi inte visste tidigare. Genom att forska vidare på BTNL9 kan vi en dag upptäcka nya sätt att hjälpa alla att behålla hälsosamma kolesterolnivåer."

Källa:

University of Pittsburgh

Hänvisning:

Carlson, J.C., et al. (2022) En stop-gain-variant i BTNL9 är associerad med aterogena lipidprofiler. Framsteg inom mänsklig genetik och genomik. doi.org/10.1016/j.xhgg.2022.100155.

.