Tutkimus tarjoaa uusia oivalluksia muihin melanoomiin, jotka eivät ole UV-säteilyn aiheuttamia

Tutkimus tarjoaa uusia oivalluksia muihin melanoomiin, jotka eivät ole UV-säteilyn aiheuttamia

Ryhmä brasilialaisia ​​ja ranskalaisia ​​tutkijoita on onnistunut löytämään auringolle altistumisesta syntyviä markkereita ihomelanoomasta kärsivien ihmisten genomista. Nature Communicationsissa julkaistu artikkeli tutkimuksesta tarjoaa myös uutta ymmärrystä muista melanoomeista, jotka eivät aiheudu ultraviolettisäteilyn (UV) vaikutuksesta.

Huomasimme, että jotkut muutoksista olivat potilaan eloonjäämisen indikaattoreita. Näiden DNA-merkkien ansiosta pystyimme ennustamaan, selviytyikö ihminen enemmän vai vähemmän."

Anna Luiza Silva Almeida Vicente, ensimmäinen kirjoittaja

Tutkimus suoritettiin hänen väitöstyönsä aikana Hospital de Amorissa, kuten nykyään kutsutaan Barretosin syöpäsairaalaa São Paulon osavaltiossa (Brasilia).

Vicente suoritti osan analyysistä tutkimusharjoittelussa Kansainvälisessä syöväntutkimuskeskuksessa (IARC) Lyonissa Ranskassa FAPESP:n apurahalla.

Tutkimus, johon osallistui IARC:n tutkijoita, paljasti molekyyliominaisuudet, jotka osoittavat aggressiivisuutta ja voivat ohjata hoitoa.

Yksi analysoiduista melanoomista oli ihomelanooma, jossa yksi alatyyppi liittyy auringolle altistumiseen ja toinen ei liity UV-valoon. Näitä kasvaimia esiintyy ensisijaisesti valkoisilla ihmisillä ja ne vaikuttavat ensisijaisesti auringonvalolle alttiisiin ihoalueisiin.

Pieni osa näytteistä oli peräisin akraalimelanoomasta, joka ei liity UV-valoon, on yleisin tyyppi tummemman ihon omaavilla ihmisillä ja muodostuu kämmenissä ja jalkapohjissa sekä kynsien alle. Akral-melanoomasta on vähän tutkimusta. Suurin osa tutkimuksista keskittyy Euroopan ja Yhdysvaltojen väestöihin.

"Melanooman alatyyppejä on erilaisia. Ne voivat kaikki olla aggressiivisia, mutta joissain aggressiivisuus on yleisempää. On olemassa histologisia piirteitä, jotka tunnistetaan mikroskoopilla, ja geneettisiä piirteitä, joista osa tunnetaan ja niitä käytetään hoidon ohjaamiseen." Tällä alueella avautuu uusi polku, joka on epigeneettinen ja ottaa huomioon auringonvalon läsnäolon, mikä johtaa muutoksiin, jotka eivät vaikuta DNA-sekvenssiin [ts. geneettiset mutaatiot] vaan siitä, miten se ilmentyy ja koodaa proteiineja, jotka ovat tärkeitä organismin normaalille toiminnalle”, sanoi Vinicius de Lima Vazquez, Hospital de Amorin koulutus- ja tutkimusinstituutin johtaja ja artikkelin toiseksi viimeinen kirjoittaja.

Molekyylitietoa

Epigeneettiset muutokset johtuvat ympäristötekijöistä. Ne ovat palautuvia eivätkä muuta DNA-sekvenssiä aiheuttaen mutaatioita. Ne voivat kuitenkin muuttaa tapaa, jolla keho lukee niitä, ja ne voivat olla perinnöllisiä.

Tutkimuksessa tutkijat käyttivät useita tekniikoita analysoidakseen DNA:n metylaatiota, epigeneettistä muutosta, johon liittyy biokemiallinen muutos, jossa metyyliryhmiä lisätään DNA-molekyyliin entsyymien vaikutuksesta.

DNA:n metylaatio on välttämätön prosessi, mutta se voi johtaa solujen toimintahäiriöihin ja syöpään, jos se on säätelemätön ulkoisten tekijöiden, kuten liiallisen UV-säteilyn vuoksi.

Tutkijat analysoivat 112 ihon melanoomanäytettä ja 21 akraalimelanoomanäytettä. Ensimmäiset kerättiin Hospital de Amorista ja kansainvälisestä tietokannasta, joka edustaa pääasiassa eurooppalaisia ​​ja yhdysvaltalaisia ​​potilaita. Kaikki akral-melanoomanäytteet olivat Barretosin sairaalasta.

Metyloidun DNA:n analyysi osoitti, että ihomelanoomat, joihin ei liity auringonvalolle altistumista, ovat paljon samankaltaisempia kuin akraaliset melanoomat (joihin UV-säteily ei vaikuta ja ovat yleisempiä tummaihoisilla ihmisillä) kuin ihomelanoomat, jotka liittyvät liialliseen UV-valoaltistukseen.

Nämä tulokset vahvistivat, että eloonjäämisluvut olivat alhaisemmat potilailla, joilla oli akraali- ja ihomelanooma, jotka eivät liity auringonvaloon, kuin potilailla, joilla oli UV-valoon liittyviä ihomelanoomaa.

"Päätimme, että nämä kaksi kasvainta, jotka eivät liittyneet auringolle altistumiseen, voidaan luokitella eri alatyypeiksi histologisesti, mutta ne olivat molekyylisesti hyvin samankaltaisia ​​metylaation näkökulmasta ja niillä oli myös alhaisemmat eloonjäämisluvut. Tämä on tärkeä osa tutkimusta ja sillä voi olla kliinistä merkitystä." sillä on vaikutuksia tulevaisuuteen", sanoi Vicente, joka on tällä hetkellä tutkijatohtori Kalifornian yliopistossa San Franciscossa (UCSF) Yhdysvalloissa.

Toinen havainto, joka kiinnitti tutkijoiden huomion, oli se, että mutaatioita BRAF-, NRAS- ja NF1-geeneissä ei havaittu useimmissa akraalmelanoomissa, vaikka ne ovat yleisiä ihomelanoomissa.

Lisäksi 28,6 % akraalimelanoomapotilaista oli mustia, kun taas vain 5,6 % Hospital de Amorin ihomelanoomanäytteistä tuli potilailta, joilla oli tumma iho.

Vazquez sanoi, että jotkin muiden syöpien hoidot edistävät molekyylitietojen yhdistämistä ennusteeseen ja sellaisten potilaiden tunnistamista, jotka reagoivat paremmin saatavilla oleviin hoitoihin. Tämä on yksi ihokasvainten tutkimuksen tavoitteista.

"Tällaista lisää tietoa melanoomasta tarvitaan jokapäiväisessä lääketieteessä. Tämänkaltaiset tutkimukset viittaavat uusiin tutkimuslinjoihin, joita on tutkittava ja jotka tasoittavat tietä yksilöllisemmälle hoidolle", hän sanoi.

Lähde:

São Paulon tutkimussäätiö (FAPESP)

Viite:

Vicente, ALSA, et ai. (2022) Ihon ja akraalisen melanooman risti-OMIC-tutkimukset paljastavat patobiologiaan ja UV-altistukseen liittyviä prognostisia syöpätekijöitä. Luontoviestintä. doi.org/10.1038/s41467-022-31488-w.

.