Badanie oferuje nowy wgląd w inne czerniaki, które nie są spowodowane działaniem promieniowania UV

Badanie oferuje nowy wgląd w inne czerniaki, które nie są spowodowane działaniem promieniowania UV

Grupie badaczy z Brazylii i Francji udało się odkryć markery powstające w wyniku ekspozycji na słońce w genomach osób cierpiących na czerniaka skóry. Artykuł na temat badania opublikowany w Nature Communications dostarcza także nowego zrozumienia innych czerniaków, które nie są spowodowane działaniem promieniowania ultrafioletowego (UV).

Ustaliliśmy, że niektóre zmiany były wskaźnikami przeżycia pacjentów. Dzięki tym markerom w DNA byliśmy w stanie przewidzieć, czy dana osoba ma większe, czy mniejsze szanse na przeżycie”.

Anna Luiza Silva Almeida Vicente, pierwsza autorka

Badanie przeprowadzono w czasie jej pracy doktorskiej w Hospital de Amor, jak obecnie nazywa się szpital onkologiczny w Barretos w stanie São Paulo (Brazylia).

Vicente przeprowadził część analiz podczas stażu badawczego w Międzynarodowej Agencji Badań nad Rakiem (IARC) w Lyonie we Francji, dzięki grantowi FAPESP.

Badanie, w którym uczestniczyli naukowcy z IARC, ujawniło cechy molekularne wskazujące na agresywność i mogące pomóc w leczeniu.

Jednym z analizowanych czerniaków był czerniak skóry, którego jeden podtyp jest powiązany z ekspozycją na słońce, a inny nie jest powiązany ze światłem UV. Guzy te występują głównie u osób rasy białej i atakują przede wszystkim obszary skóry wystawione na działanie promieni słonecznych.

Niewielka część próbek pochodziła z czerniaka akralnego, który nie jest związany ze światłem UV, jest najczęstszym typem czerniaka u osób o ciemniejszej skórze i tworzy się na dłoniach i podeszwach stóp oraz pod paznokciami. Niewiele jest badań na temat czerniaka akralnego. Większość badań koncentruje się na populacjach Europy i USA.

„Istnieją różne podtypy czerniaka. Wszystkie mogą być agresywne, ale w niektórych przypadkach agresywność jest bardziej powszechna. Istnieją cechy histologiczne identyfikowane pod mikroskopem oraz cechy genetyczne, z których niektóre są znane i wykorzystywane do kierowania leczeniem”. W tym obszarze otwiera się nowy szlak, który ma charakter epigenetyczny i uwzględnia obecność światła słonecznego, co prowadzi do zmian niemających wpływu na sekwencję DNA [tj. mutacje genetyczne], ale od tego, jak ulega ekspresji i koduje białka ważne dla prawidłowego funkcjonowania organizmu” – powiedział Vinicius de Lima Vazquez, dyrektor wykonawczy Instytutu Edukacji i Badań Hospital de Amor i przedostatni autor artykułu.

Informacje molekularne

Zmiany epigenetyczne są spowodowane czynnikami środowiskowymi. Są odwracalne i nie zmieniają sekwencji DNA powodując mutacje. Mogą jednak zmienić sposób, w jaki organizm je odczytuje i mogą być dziedziczne.

W badaniu naukowcy zastosowali kilka technik do analizy metylacji DNA, zmiany epigenetycznej obejmującej zmianę biochemiczną, podczas której grupy metylowe są dodawane do cząsteczki DNA w wyniku działania enzymów.

Metylacja DNA jest procesem niezbędnym, ale może prowadzić do dysfunkcji komórek i raka, jeśli zostanie rozregulowana pod wpływem czynników zewnętrznych, takich jak nadmierna ekspozycja na światło UV.

Naukowcy przeanalizowali 112 próbek czerniaka skóry i 21 próbek czerniaka akralnego. Te pierwsze zebrano z Hospital de Amor oraz z międzynarodowej bazy danych obejmującej głównie pacjentów z Europy i USA. Wszystkie próbki czerniaka akralnego pochodziły ze szpitala Barretos.

Analiza metylowanego DNA wykazała, że ​​czerniaki skóry, które nie są związane z ekspozycją na światło słoneczne, są znacznie bardziej podobne do czerniaków akralnych (na które promieniowanie UV nie ma wpływu i występują częściej u osób o ciemnej skórze) niż czerniaki skóry, które są związane z nadmierną ekspozycją na światło UV.

Wyniki te potwierdziły niższe wskaźniki przeżycia u pacjentów z czerniakami okolicy krzyżowej i skóry niezwiązanymi ze światłem słonecznym w porównaniu z pacjentami z czerniakami skóry związanymi ze światłem UV.

„Doszliśmy do wniosku, że te dwa nowotwory, które nie są związane z ekspozycją na słońce, można sklasyfikować jako różne podtypy pod względem histologicznym, ale są molekularnie bardzo podobne z punktu widzenia metylacji, a także charakteryzują się niższym współczynnikiem przeżycia. Jest to ważna część badania i może mieć znaczenie kliniczne”. będą miały konsekwencje na przyszłość” – powiedział Vicente, który obecnie jest pracownikiem naukowym ze stopniem doktora na Uniwersytecie Kalifornijskim w San Francisco (UCSF) w USA.

Innym odkryciem, które przykuło uwagę badaczy, był brak mutacji w genach BRAF, NRAS i NF1 w większości czerniaków okolicy czołowej, chociaż są one częste w przypadku czerniaków skóry.

Ponadto 28,6% pacjentów z czerniakiem okolicy krzyżowej było rasy czarnej, podczas gdy tylko 5,6% próbek czerniaka skóry z Hospital de Amor pochodziło od pacjentów o ciemnej karnacji.

Vazquez stwierdziła, że ​​niektóre metody leczenia innych nowotworów zmierzają w kierunku powiązania informacji molekularnych z rokowaniem i identyfikacji pacjentów, którzy lepiej reagują na dostępne terapie. Jest to jeden z celów badania nowotworów skóry.

„Potrzebujemy więcej takich informacji na temat czerniaka, aby można je było zastosować w codziennej medycynie. Badania takie jak to wskazują nowe kierunki badań, które należy zbadać i utorować drogę do bardziej spersonalizowanego leczenia” – powiedział.

Źródło:

Fundacja Badawcza w São Paulo (FAPESP)

Odniesienie:

Vicente, ALSA i in. (2022) Krzyżowe OMIC czerniaka skóry i kości krzyżowej ujawniają prognostyczne czynniki nowotworowe powiązane z patobiologią i ekspozycją na promieniowanie UV. Komunikacja przyrodnicza. doi.org/10.1038/s41467-022-31488-w.

.