L'intervalle en série et la période d'incubation pour l'apparition des symptômes et des éruptions cutanées liés à l'infection par le virus de la variole du singe au cours de l'épidémie actuelle aux États-Unis

L'intervalle en série et la période d'incubation pour l'apparition des symptômes et des éruptions cutanées liés à l'infection par le virus de la variole du singe au cours de l'épidémie actuelle aux États-Unis

Dans une étude récemment publiée medRxiv * Les chercheurs ont estimé l'intervalle en série et la période d'incubation des infections par le virus de la variole du singe (MPXV) pour l'épidémie de 2022 aux États-Unis (US).

Lernen: Schätzungen der seriellen Intervalle und Inkubationszeit der Affenpockenvirusinfektion in 12 US-Gerichtsbarkeiten, Mai – August 2022. Bildnachweis: Marina Demidiuk/Shutterstock

*REMARQUE importante :medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui n'ont pas été évalués par des pairs et ne doivent donc pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/le comportement lié à la santé, ou être traités comme des informations établies.

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Les données des Centers for Disease Control and Prevention (CDC) des États-Unis ont montré 75 568 cas confirmés de MPXV et 34 décès dans 109 sites endémiques et non endémiques au 25 octobre 2022. Lors de l'épidémie de MPXV de 2022, la transmission s'est produite principalement par contact sexuel ou étroit avec des éruptions cutanées infectieuses, des croûtes ou des liquides organiques.

Par la suite, plusieurs patients de 12 États américains ont déclaré avoir eu de nombreux partenaires sexuels anonymes ou avoir assisté à des festivals trois semaines avant l'apparition des symptômes. Cela a compliqué les efforts visant à identifier les paires de cas primaires et secondaires. En outre, cela a compliqué la détermination de l’intervalle en série pour l’épidémie actuelle de MPXV, un déterminant essentiel de l’évolution d’une épidémie et de l’impact des interventions telles que les vaccins et les médicaments. En particulier, les symptômes du MPXV se manifestent généralement dans les trois semaines suivant l'exposition et peuvent inclure de la fièvre, des maux de tête, des frissons, des ganglions lymphatiques enflés et de la fatigue. Une éruption cutanée se développe généralement un à quatre jours après l’apparition des symptômes.

L'intervalle sériel est défini comme le temps écoulé entre l'apparition des symptômes dans le cas primaire et l'apparition des symptômes dans le cas secondaire. Il détermine le nombre effectif de reproduction (Rt) et prédit l’apparition d’un agent pathogène infectieux.

À propos des études

Dans la présente étude, les chercheurs ont compilé des données sur l’apparition des symptômes et des éruptions cutanées pour des paires de cas primaires et secondaires et leur type de contact provenant de 12 services de santé étatiques et locaux aux États-Unis. Ils ont utilisé des méthodes bayésiennes pour estimer la distribution des intervalles en série pour les paires de cas primaires et secondaires connues pour l'apparition des symptômes et l'éruption cutanée. Ils ont choisi le modèle avec la valeur du critère d’information Akaike (AIC) la plus basse.

Ensuite, l'équipe a estimé l'intervalle en série pour l'apparition des symptômes et l'apparition des éruptions cutanées en utilisant 50 000 échantillons de chaîne de Markov Monte Carlo (MCMC) et un burn-in de 10 000 échantillons. Ils ont évalué la convergence des échantillons MCMC à l'aide des statistiques Gelman-Rubin. Les chercheurs ont également inclus neuf et quatre cas du District de Columbia et de Floride, respectivement, dans l'analyse de la période d'incubation du MPXV de l'étude actuelle.

Résultats de l'étude

Au total, 57 paires de cas répondaient aux critères d'inclusion de l'étude, dont 40 présentaient des éruptions cutanées dans les cas primaires et secondaires. L'intervalle sériel d'apparition des symptômes variait de deux à 25 jours pour les cas index MPXV, en partie à cause de la variabilité du type et de l'intensité du contact. L’intervalle de série global estimé pour l’apparition des symptômes et des éruptions cutanées était respectivement de 8,5 et sept jours.

Les auteurs ont constaté que 10 nouveaux cas sur 14 (rapportés uniquement aux États-Unis) ont été exposés au MPXV en une seule journée. Le temps moyen d'incubation du MPXV entre l'exposition et l'apparition des symptômes était de 5,6 jours, tandis qu'entre l'exposition et l'apparition de l'éruption cutanée était de 7,5 jours dans 36 et 35 cas, respectivement. Il est intéressant de noter que dans les cas secondaires, il existait une association statistiquement significative entre les intervalles en série et les durées d'incubation.

Conclusions

L'intervalle MPXV en série de 8,5 jours pour l'apparition des symptômes dans la présente étude était cohérent avec l'estimation de 9,8 jours d'une étude menée au Royaume-Uni après correction de la troncature droite. Cependant, ce temps était beaucoup plus court que le temps de génération de 12,5 jours rapporté par une étude menée en Italie. Selon les auteurs, aucune étude antérieure n’a documenté les intervalles de pointes en série du MPXV. Ils ont signalé un intervalle de sept jours avant l'apparition de l'éruption cutanée, ce qui était nettement plus long que la période d'incubation de l'éruption cutanée de 5,6 jours. Cela suggère que la transmission du MPXV s'est également produite avant l'éruption cutanée.

En résumé, l'étude a estimé l'intervalle en série contenant des estimations de l'apparition d'éruptions cutanées pour l'épidémie actuelle de MPXV aux États-Unis ; De plus, elle a démontré la fiabilité des estimations basées sur les symptômes initiaux de la maladie.

*REMARQUE importante :medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui n'ont pas été évalués par des pairs et ne doivent donc pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/le comportement en matière de santé, ou être traités comme des informations établies.

Référence:

• Vorläufiger wissenschaftlicher Bericht.
  Madewell, Z. et al. (2022) „Serienintervall- und Inkubationszeitschätzungen der Affenpockenvirusinfektion in 12 US-Gerichtsbarkeiten, Mai – August 2022“. medRxiv. doi: 10.1101/2022.10.26.22281516. https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2022.10.26.22281516v1

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