Sekvenování celého genomu by mohlo pomoci omezit šíření bakterií odolných vůči lékům v nemocnicích
Šíření bakterií odolných vůči antibiotikům v nemocnicích se výrazně snížilo díky výzkumu University of Queensland a Queensland Health. Tým zahrnující Dr. Patrick Harris a Dr. Brian Forde z Centra pro klinický výzkum UQ použil sekvenování celého genomu jako nástroj sledování k rychlé identifikaci, sledování a narušení patogenů, které způsobují vážné nozokomiální infekce (HAI). Dr. Harris řekl, že HAI jsou běžné a jsou spojeny s horšími výsledky pacientů a nadměrnými náklady na zdravotní péči. Více než 9 procent lidí hospitalizovaných v Austrálii trpí HAI a náklady na léčbu...

Sekvenování celého genomu by mohlo pomoci omezit šíření bakterií odolných vůči lékům v nemocnicích
Šíření bakterií odolných vůči antibiotikům v nemocnicích se výrazně snížilo díky výzkumu University of Queensland a Queensland Health.
Tým včDr. Patrick Harris aDr. Brian Forde z UQ'sCentrum pro klinický výzkum použilo sekvenování celého genomu jako nástroj dohledu k rychlé identifikaci, sledování a narušení patogenů, které způsobují vážné infekce spojené se zdravotní péčí (HAI).
Dr. Harris řekl, že HAI jsou běžné a jsou spojeny s horšími výsledky pacientů a nadměrnými náklady na zdravotní péči.
Více než 9 procent lidí přijatých do nemocnice v Austrálii trpí HAI a náklady na léčbu představují obrovskou zátěž pro přetížený systém zdravotní péče.
Dopady jsou umocněny zvyšující se antimikrobiální rezistencí.
Pokud rezistentní bakterie způsobí vážná onemocnění, jako jsou infekce krevního řečiště, úmrtnost může být až 20 procent.
Dr. Patrick Harris, UQ Centrum pro klinický výzkum
Čtyřletá studie porovnávala bakterie rezistentní na antibiotika shromážděné od pacientů v nemocnicích v Queenslandu, aby identifikovala genomové souvislosti a tím i přenos z pacienta na pacienta.
"Tradiční metody kontroly infekcí a diagnostické metody nemohou přesně sledovat bakterie, které způsobují tyto infekce, ani detekovat přenosové události v nemocnicích," řekl Dr. Harris.
"Genomické testování však může potenciálně zabránit stovkám infekcí, ušetřit miliony dolarů za nadměrné náklady na zdravotní péči a v konečném důsledku snížit utrpení a smrt pacientů."
Elektronická kniha Genetika a genomika
Kompilace top rozhovorů, článků a novinek za poslední rok. Stáhněte si bezplatnou kopii
Výzkumný tým sekvenoval a porovnal genomy více než 3 000 různých bakterií, aby poskytl včasné upozornění na shlukování, což je klíčový marker pravděpodobného nemocničního přenosu.
Dr. Forde řekl, že klíčem k úspěchu projektu je pokračující používání genomiky jako nástroje sledování.
"Pomocí sekvenování tímto způsobem jsme byli schopni identifikovat, sledovat a přerušit přenos těchto bakterií v reálném čase," řekl Dr. Forde.
"Pomocí genomiky s dostupnými epidemiologickými daty jsme byli také schopni rozlišit mezi nemocničním přenosem a přenosem v komunitě a přímou kontrolou infekcí tam, kde byly nejvíce potřeba."
Projekt financovaný společností Queensland Health prokázal, že rutinní použití genomického sledování v reálném čase pro HAI je proveditelné.
"Ačkoli je obtížné implementovat, strategie prevence infekcí založené na genomice se pravděpodobně stanou novým zlatým standardem," řekl Dr. Forde.
"Značné náklady spojené s provozováním této služby jako služby by byly odůvodněny potenciálními úsporami systému zdravotní péče a zlepšenou prevencí HAI u zranitelných pacientů."
Výzkum, financovaný programem Queensland Genomics společnosti Queensland Health, byl zveřejněn vKlinická infekční onemocnění.
Zdroj:
Odkaz:
Forde, BM, a kol. (2022) Klinická implementace rutinního sekvenování celého genomu pro kontrolu nemocničních infekcí multirezistentních patogenů. Klinická infekční onemocnění. doi.org/10.1093/cid/ciac726.
.