Η αλληλουχία ολόκληρου του γονιδιώματος θα μπορούσε να βοηθήσει στον περιορισμό της εξάπλωσης των ανθεκτικών στα φάρμακα βακτηρίων στα νοσοκομεία

Η αλληλουχία ολόκληρου του γονιδιώματος θα μπορούσε να βοηθήσει στον περιορισμό της εξάπλωσης των ανθεκτικών στα φάρμακα βακτηρίων στα νοσοκομεία

Η εξάπλωση των ανθεκτικών στα αντιβιοτικά βακτηρίων στα νοσοκομεία έχει μειωθεί σημαντικά χάρη σε έρευνα από το Πανεπιστήμιο του Κουίνσλαντ και την Υγεία του Κουίνσλαντ.

Μια ομάδα που περιλαμβάνειΟ γιατρός Πάτρικ Χάρις καιΟ Δρ. Brian Forde από το UQ’sΤο Κέντρο Κλινικής Έρευνας χρησιμοποίησε την αλληλουχία ολόκληρου του γονιδιώματος ως εργαλείο επιτήρησης για την ταχεία αναγνώριση, παρακολούθηση και διακοπή των παθογόνων που προκαλούν σοβαρές λοιμώξεις που σχετίζονται με την υγειονομική περίθαλψη (HAI).

Ο Δρ Χάρις είπε ότι τα ΕΑΑ είναι κοινά και συνδέονται με χειρότερα αποτελέσματα ασθενών και υπερβολικό κόστος που σχετίζεται με την υγειονομική περίθαλψη.

Περισσότερο από το 9 τοις εκατό των ατόμων που εισάγονται σε νοσοκομείο στην Αυστραλία βιώνουν ένα HAI και το κόστος της θεραπείας επιβαρύνει τεράστιο ένα υπερβολικά τεντωμένο σύστημα υγειονομικής περίθαλψης.

Οι επιπτώσεις επιδεινώνονται με την αύξηση της μικροβιακής αντοχής.

Εάν τα ανθεκτικά βακτήρια προκαλούν σοβαρές ασθένειες, όπως λοιμώξεις του αίματος, το ποσοστό θνησιμότητας μπορεί να φτάσει το 20 τοις εκατό».

Dr. Patrick Harris, UQ Center for Clinical Research

Η τετραετής μελέτη συνέκρινε τα ανθεκτικά στα αντιβιοτικά βακτήρια που συλλέχθηκαν από ασθενείς σε νοσοκομεία του Κουίνσλαντ για τον εντοπισμό γονιδιωματικών συνδέσεων και επομένως τη μετάδοση από ασθενή σε ασθενή.

«Οι παραδοσιακές μέθοδοι ελέγχου των λοιμώξεων και οι διαγνωστικές μέθοδοι δεν μπορούν να παρακολουθήσουν με ακρίβεια τα βακτήρια που προκαλούν αυτές τις λοιμώξεις ή να ανιχνεύσουν συμβάντα μετάδοσης στα νοσοκομεία», είπε ο Δρ Χάρις.

«Αλλά οι γονιδιωματικές δοκιμές μπορούν ενδεχομένως να αποτρέψουν εκατοντάδες μολύνσεις, να εξοικονομήσουν εκατομμύρια δολάρια σε υπερβολικό κόστος υγειονομικής περίθαλψης και τελικά να μειώσουν τον πόνο και τον θάνατο των ασθενών».

Ηλεκτρονικό βιβλίο Γενετικής & Γονιδιωματικής

Συγκέντρωση των κορυφαίων συνεντεύξεων, άρθρων και ειδήσεων του περασμένου έτους. Κατεβάστε ένα δωρεάν αντίγραφο

Η ερευνητική ομάδα ανέλυσε την αλληλουχία και συνέκρινε τα γονιδιώματα περισσότερων από 3.000 διαφορετικών βακτηρίων για να παράσχει έγκαιρη ειδοποίηση για ομαδοποίηση, έναν βασικό δείκτη πιθανής νοσοκομειακής μετάδοσης.

Ο Δρ Forde είπε ότι το κλειδί για την επιτυχία του έργου είναι η συνεχής χρήση της γονιδιωματικής ως εργαλείο επιτήρησης.

«Χρησιμοποιώντας την αλληλουχία με αυτόν τον τρόπο, μπορέσαμε να αναγνωρίσουμε, να παρακολουθήσουμε και να διακόψουμε τη μετάδοση αυτών των βακτηρίων σε πραγματικό χρόνο», είπε ο Δρ Φορντ.

«Χρησιμοποιώντας τη γονιδιωματική με διαθέσιμα επιδημιολογικά δεδομένα, μπορέσαμε επίσης να διακρίνουμε μεταξύ της μετάδοσης σε νοσοκομείο και κοινότητας και άμεσου ελέγχου των λοιμώξεων εκεί όπου χρειάζονταν περισσότερο».

Το έργο, που χρηματοδοτήθηκε από το Queensland Health, έδειξε ότι η τακτική χρήση της γονιδιωματικής επιτήρησης σε πραγματικό χρόνο για HAI είναι εφικτή.

«Αν και είναι δύσκολο να εφαρμοστούν, οι στρατηγικές πρόληψης λοιμώξεων που βασίζονται στη γονιδιωματική είναι πιθανό να γίνουν το νέο χρυσό πρότυπο», είπε ο Δρ Φορντ.

«Το σημαντικό κόστος που σχετίζεται με τη λειτουργία αυτής ως υπηρεσίας θα δικαιολογούνταν από την πιθανή εξοικονόμηση πόρων στο σύστημα υγειονομικής περίθαλψης και τη βελτιωμένη πρόληψη των HAI σε ευάλωτους ασθενείς».

Η έρευνα, που χρηματοδοτήθηκε από το πρόγραμμα Queensland Genomics του Queensland Health, δημοσιεύτηκε στοΚλινικές μολυσματικές ασθένειες.

Πηγή:

Το Πανεπιστήμιο του Κουίνσλαντ

Αναφορά:

Forde, BM, et al. (2022) Κλινική εφαρμογή της ρουτίνας αλληλουχίας ολόκληρου του γονιδιώματος για τον έλεγχο νοσοκομειακών λοιμώξεων παθογόνων ανθεκτικών σε πολλά φάρμακα. Κλινικές μολυσματικές ασθένειες. doi.org/10.1093/cid/ciac726.

.