Het sequencen van het hele genoom zou de verspreiding van resistente bacteriën in ziekenhuizen kunnen helpen tegengaan

Het sequencen van het hele genoom zou de verspreiding van resistente bacteriën in ziekenhuizen kunnen helpen tegengaan

De verspreiding van antibioticaresistente bacteriën in ziekenhuizen is sterk verminderd dankzij onderzoek van de University of Queensland en Queensland Health.

Een team inclDr. Patrick Harris enDr. Brian Forde van UQ'sHet Center for Clinical Research gebruikte sequencing van het hele genoom als surveillance-instrument om snel de ziekteverwekkers die ernstige gezondheidszorggerelateerde infecties (HAI's) veroorzaken, te identificeren, volgen en verstoren.

Dr. Harris zei dat zorginfecties vaak voorkomen en gepaard gaan met slechtere patiëntresultaten en buitensporige zorgkosten.

Ruim 9 procent van de mensen die in Australië in een ziekenhuis worden opgenomen, krijgt last van een zorginfectie, en de kosten van de behandeling leggen een enorme druk op het overbelaste gezondheidszorgsysteem.

De gevolgen worden nog verergerd door de toenemende antimicrobiële resistentie.

Als de resistente bacteriën ernstige ziekten veroorzaken, zoals bloedbaaninfecties, kan het sterftecijfer oplopen tot 20 procent.”

Dr. Patrick Harris, UQ Centrum voor Klinisch Onderzoek

In het vier jaar durende onderzoek werden antibioticaresistente bacteriën vergeleken die waren verzameld bij patiënten in ziekenhuizen in Queensland om genomische verbindingen en daarmee de overdracht van patiënt op patiënt te identificeren.

“Traditionele infectiebeheersings- en diagnostische methoden kunnen de bacteriën die deze infecties veroorzaken niet nauwkeurig traceren of overdrachtsgebeurtenissen in ziekenhuizen detecteren”, aldus Dr. Harris.

“Maar genomische tests kunnen mogelijk honderden infecties voorkomen, miljoenen dollars aan extra gezondheidszorgkosten besparen en uiteindelijk het lijden en de dood van patiënten verminderen.”

Genetica en genomica eBook

Compilatie van de beste interviews, artikelen en nieuws van het afgelopen jaar. Download een gratis exemplaar

Het onderzoeksteam heeft de genomen van meer dan 3.000 verschillende bacteriën gesequenced en vergeleken om vroegtijdige melding te kunnen maken van clustering, een belangrijke marker van waarschijnlijke overdracht in ziekenhuizen.

Dr. Forde zei dat de sleutel tot het succes van het project het voortdurende gebruik van genomica als surveillance-instrument is.

“Door op deze manier sequencing te gebruiken, konden we de overdracht van deze bacteriën in realtime identificeren, volgen en onderbreken”, aldus Dr. Forde.

“Door gebruik te maken van genomica met beschikbare epidemiologische gegevens, konden we ook onderscheid maken tussen overdracht via ziekenhuizen en gemeenschappen en directe inspanningen voor infectiebeheersing daar waar deze het meest nodig waren.”

Het project, gefinancierd door Queensland Health, toonde aan dat routinematig gebruik van real-time genomische surveillance voor zorginfecties haalbaar is.

“Hoewel moeilijk te implementeren, zullen op genomica gebaseerde strategieën voor infectiepreventie waarschijnlijk de nieuwe gouden standaard worden”, aldus Dr. Forde.

“De aanzienlijke kosten die gepaard gaan met het runnen van dit als een dienst zouden worden gerechtvaardigd door de potentiële besparingen voor het gezondheidszorgsysteem en de verbeterde preventie van zorginfecties bij kwetsbare patiënten.”

Het onderzoek, gefinancierd door het Queensland Genomics-programma van Queensland Health, werd gepubliceerd inKlinische infectieziekten.

Bron:

De Universiteit van Queensland

Referentie:

Forde, BM, et al. (2022) Klinische implementatie van routinematige sequencing van het hele genoom voor de beheersing van multiresistente pathogenen in ziekenhuizen. Klinische infectieziekten. doi.org/10.1093/cid/ciac726.

.