Sekwencjonowanie całego genomu może pomóc w ograniczeniu rozprzestrzeniania się bakterii lekoopornych w szpitalach
Badania przeprowadzone na Uniwersytecie Queensland i Queensland Health pozwoliły znacznie ograniczyć rozprzestrzenianie się w szpitalach bakterii opornych na antybiotyki. Zespół składający się z dr Patricka Harrisa i dr Briana Forde z Centrum Badań Klinicznych UQ wykorzystał sekwencjonowanie całego genomu jako narzędzie nadzoru w celu szybkiej identyfikacji, śledzenia i niszczenia patogenów powodujących poważne zakażenia szpitalne (HAI). Dr Harris stwierdziła, że zakażenia HAI są powszechne i wiążą się z gorszymi wynikami leczenia pacjentów oraz nadmiernymi kosztami związanymi z opieką zdrowotną. Ponad 9 procent osób hospitalizowanych w Australii doświadcza zakażenia HAI, a koszty leczenia...

Sekwencjonowanie całego genomu może pomóc w ograniczeniu rozprzestrzeniania się bakterii lekoopornych w szpitalach
Badania przeprowadzone na Uniwersytecie Queensland i Queensland Health pozwoliły znacznie ograniczyć rozprzestrzenianie się w szpitalach bakterii opornych na antybiotyki.
Zespół m.inDoktor Patrick Harris iDoktor Brian Forde z UQ’sCentrum Badań Klinicznych wykorzystało sekwencjonowanie całego genomu jako narzędzie nadzoru umożliwiające szybką identyfikację, śledzenie i niszczenie patogenów powodujących poważne zakażenia związane z opieką zdrowotną (HAI).
Dr Harris stwierdziła, że zakażenia HAI są powszechne i wiążą się z gorszymi wynikami leczenia pacjentów oraz nadmiernymi kosztami związanymi z opieką zdrowotną.
Ponad 9 procent osób przyjętych do szpitali w Australii doświadcza zakażenia HAI, a koszty leczenia ogromnie obciążają przeciążony system opieki zdrowotnej.
Skutki te pogłębiają się w miarę wzrostu oporności na środki przeciwdrobnoustrojowe.
Jeśli oporne bakterie powodują poważne choroby, takie jak infekcje krwi, śmiertelność może sięgać nawet 20 procent”.
Dr Patrick Harris, Centrum Badań Klinicznych UQ
W czteroletnim badaniu porównano bakterie oporne na antybiotyki pobrane od pacjentów szpitali w Queensland w celu zidentyfikowania powiązań genomowych, a tym samym przenoszenia choroby z pacjenta na pacjenta.
„Tradycyjne metody kontroli infekcji i metody diagnostyczne nie są w stanie dokładnie śledzić bakterii wywołujących te infekcje ani wykrywać przypadków przenoszenia w szpitalach” – powiedział dr Harris.
„Ale badania genomiczne mogą potencjalnie zapobiec setkom infekcji, zaoszczędzić miliony dolarów na nadmiernych kosztach opieki zdrowotnej i ostatecznie zmniejszyć cierpienie i śmierć pacjentów”.
E-book Genetyka i genomika
Zestawienie najważniejszych wywiadów, artykułów i aktualności z ostatniego roku. Pobierz bezpłatną kopię
Zespół badawczy zsekwencjonował i porównał genomy ponad 3000 różnych bakterii, aby zapewnić wczesne powiadomienie o skupianiu się, kluczowym markerze prawdopodobnego przeniesienia wirusa do szpitala.
Dr Forde stwierdziła, że kluczem do sukcesu projektu jest ciągłe wykorzystywanie genomiki jako narzędzia nadzoru.
„Wykorzystując w ten sposób sekwencjonowanie, byliśmy w stanie zidentyfikować, śledzić i przerwać przenoszenie tych bakterii w czasie rzeczywistym” – powiedział dr Forde.
„Wykorzystując genomikę i dostępne dane epidemiologiczne, byliśmy również w stanie rozróżnić przenoszenie wirusa w szpitalu i poza nim oraz podejmować bezpośrednie wysiłki w zakresie kontroli infekcji tam, gdzie były one najbardziej potrzebne”.
Projekt, finansowany przez Queensland Health, wykazał, że rutynowe stosowanie nadzoru genomicznego w czasie rzeczywistym w przypadku zakażeń HAI jest wykonalne.
„Chociaż strategie zapobiegania infekcjom oparte na genomice są trudne do wdrożenia, prawdopodobnie staną się nowym złotym standardem” – stwierdził dr Forde.
„Znaczne koszty związane z prowadzeniem tej usługi w formie usługi byłyby uzasadnione potencjalnymi oszczędnościami dla systemu opieki zdrowotnej i lepszą profilaktyką zakażeń szpitalnych u bezbronnych pacjentów”.
Wyniki badania, finansowanego przez program Queensland Genomics firmy Queensland Health, opublikowano w czasopiśmie:Kliniczne choroby zakaźne.
Źródło:
Odniesienie:
Forde, BM i in. (2022) Kliniczne wdrożenie rutynowego sekwencjonowania całego genomu w celu kontroli zakażeń szpitalnych patogenami wielolekoopornymi. Kliniczne choroby zakaźne. doi.org/10.1093/cid/ciac726.
.