Helgenomsekvensering kan hjälpa till att bromsa spridningen av läkemedelsresistenta bakterier på sjukhus
Spridningen av antibiotikaresistenta bakterier på sjukhus har minskat kraftigt tack vare forskning från University of Queensland och Queensland Health. Ett team inklusive Dr. Patrick Harris och Dr. Brian Forde från UQ:s Center for Clinical Research använde sekvensering av hela genomet som ett övervakningsverktyg för att snabbt identifiera, spåra och störa de patogener som orsakar allvarliga sjukhusinfektioner (HAI). Dr Harris sa att HAI är vanliga och förknippade med sämre patientresultat och överdrivna sjukvårdsrelaterade kostnader. Mer än 9 procent av personer som är inlagda på sjukhus i Australien upplever en HAI och kostnaden för behandling...

Helgenomsekvensering kan hjälpa till att bromsa spridningen av läkemedelsresistenta bakterier på sjukhus
Spridningen av antibiotikaresistenta bakterier på sjukhus har minskat kraftigt tack vare forskning från University of Queensland och Queensland Health.
Ett lag inklDr Patrick Harris ochDr Brian Forde från UQ'sCentrum för klinisk forskning använde helgenomsekvensering som ett övervakningsverktyg för att snabbt identifiera, spåra och störa de patogener som orsakar allvarliga vårdrelaterade infektioner (HAI).
Dr Harris sa att HAI är vanliga och förknippade med sämre patientresultat och överdrivna sjukvårdsrelaterade kostnader.
Mer än 9 procent av personer som är inlagda på sjukhus i Australien upplever en HAI, och kostnaden för behandling sätter en enorm belastning på ett överansträngt sjukvårdssystem.
Effekterna förvärras av ökad antimikrobiell resistens.
Om de resistenta bakterierna orsakar allvarliga sjukdomar som blodomloppsinfektioner kan dödligheten vara så hög som 20 procent.”
Dr Patrick Harris, UQ Center for Clinical Research
Den fyraåriga studien jämförde antibiotikaresistenta bakterier som samlats in från patienter på sjukhus i Queensland för att identifiera genomiska kopplingar och därmed överföring från patient till patient.
"Traditionella infektionskontroll och diagnostiska metoder kan inte exakt spåra bakterierna som orsakar dessa infektioner eller upptäcka överföringshändelser på sjukhus", säger Dr. Harris.
"Men genomisk testning kan potentiellt förhindra hundratals infektioner, spara miljontals dollar i överskjutande sjukvårdskostnader och i slutändan minska patienternas lidande och död."
Genetik och genomik e-bok
Sammanställning av de bästa intervjuerna, artiklarna och nyheterna från det senaste året. Ladda ner en gratis kopia
Forskargruppen sekvenserade och jämförde genomen från mer än 3 000 olika bakterier för att ge tidig anmälan om klustring, en nyckelmarkör för trolig sjukhusöverföring.
Dr Forde sa att nyckeln till projektets framgång är den fortsatta användningen av genomik som ett övervakningsverktyg.
"Genom att använda sekvensering på detta sätt kunde vi identifiera, spåra och avbryta överföringen av dessa bakterier i realtid", säger Dr Forde.
"Genom att använda genomik med tillgängliga epidemiologiska data kunde vi också skilja mellan överföring av sjukhus och samhälle och rikta infektionskontrollinsatser där de behövdes som mest."
Projektet, finansierat av Queensland Health, visade att rutinmässig användning av genomisk övervakning i realtid för HAI är genomförbar.
"Även om det är svårt att implementera, kommer genomikbaserade infektionsförebyggande strategier sannolikt att bli den nya guldstandarden", säger Dr Forde.
"De betydande kostnaderna för att driva detta som en tjänst skulle motiveras av de potentiella besparingarna för hälso- och sjukvården och förbättrat förebyggande av HAI hos utsatta patienter."
Forskningen, finansierad av Queensland Healths Queensland Genomics-program, publicerades iKliniska infektionssjukdomar.
Källa:
Hänvisning:
Forde, BM, et al. (2022) Klinisk implementering av rutinmässig helgenomsekvensering för sjukhusinfektionskontroll av multiresistenta patogener. Kliniska infektionssjukdomar. doi.org/10.1093/cid/ciac726.
.