全基因组测序有助于遏制耐药细菌在医院的传播

全基因组测序有助于遏制耐药细菌在医院的传播

由于昆士兰大学和昆士兰卫生局的研究，医院内抗生素耐药细菌的传播已大大减少。

一个团队包括帕特里克·哈里斯博士和昆士兰大学的 Brian Forde 博士临床研究中心使用全基因组测序作为监测工具来快速识别、跟踪和破坏导致严重医疗保健相关感染 (HAI) 的病原体。

哈里斯博士说，医院感染很常见，并且与患者预后较差和医疗相关费用过高有关。

在澳大利亚，超过 9% 的入院患者患有 HAI，治疗费用给不堪重负的医疗系统带来了巨大压力。

抗菌素耐药性的增加加剧了这种影响。

如果耐药细菌引起血液感染等严重疾病，死亡率可能高达 20%。”

Patrick Harris 博士，昆士兰大学临床研究中心

这项为期四年的研究比较了从昆士兰医院患者身上收集的抗生素耐药细菌，以确定基因组联系，从而确定患者之间的传播。

“传统的感染控制和诊断方法无法准确追踪引起这些感染的细菌或检测医院内的传播事件，”哈里斯博士说。

“但基因组测试有可能预防数百种感染，节省数百万美元的超额医疗费用，并最终减少患者的痛苦和死亡。”

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研究小组对 3000 多种不同细菌的基因组进行了测序和比较，以提供聚类的早期通知，这是可能的医院传播的关键标志。

福特博士说，该项目成功的关键是继续使用基因组学作为监测工具。

“通过以这种方式使用测序，我们能够实时识别、跟踪和中断这些细菌的传播，”福特博士说。

“通过使用基因组学和现有的流行病学数据，我们还能够区分医院和社区传播，并在最需要的地方直接进行感染控制工作。”

该项目由昆士兰卫生局资助，证明对 HAI 进行常规实时基因组监测是可行的。

“尽管实施起来很困难，但基于基因组学的感染预防策略很可能成为新的黄金标准，”福特博士说。

“将这项服务作为一项服务来运营所带来的巨额成本，可以通过为医疗保健系统节省潜在成本并改善弱势患者医院感染的预防来证明是合理的。”

该研究由昆士兰健康局的昆士兰基因组计划资助，发表在临床感染性疾病。

来源：

昆士兰大学

参考：

福特，BM，等人。 (2022)常规全基因组测序在多重耐药病原体医院感染控制中的临床实施。 临床感染性疾病。 doi.org/10.1093/cid/ciac726 。

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